More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2413 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2413  HPrNtr  100 
 
 
89 aa  179  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.981961  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6190  HPrNtr  68.97 
 
 
89 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0412  phosphocarrier protein HPr  68.97 
 
 
89 aa  128  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.889761  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2778  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  67.82 
 
 
89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2872  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  67.82 
 
 
89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.424776  normal  0.410297 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0442  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  68.97 
 
 
89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.293204  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2247  phosphotransferase system, HPr  67.82 
 
 
89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2861  HPr family phosphocarrier protein  67.82 
 
 
89 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.324976  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0473  phosphocarrier protein HPr  67.82 
 
 
89 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.316514  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3212  phosphocarrier protein HPr  67.82 
 
 
89 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0657  phosphocarrier protein HPr  67.82 
 
 
89 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0492  phosphocarrier protein HPr  67.82 
 
 
89 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0186  phosphocarrier protein HPr  67.82 
 
 
89 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2833  phosphocarrier protein HPr  67.82 
 
 
89 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858125  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1406  phosphocarrier protein HPr  67.82 
 
 
89 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0530  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  65.52 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0602783  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2916  HPr family phosphocarrier protein  66.67 
 
 
89 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0261  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  65.52 
 
 
89 aa  125  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4185  HPrNtr  65.52 
 
 
89 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0222  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  68.97 
 
 
89 aa  123  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000064621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0203  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  67.82 
 
 
89 aa  122  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405136  normal  0.268008 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0347  phosphohistidinoprotein-hexose phosphotransferase  68.97 
 
 
89 aa  122  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.648241 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0147  HPrNtr  64.37 
 
 
89 aa  122  2e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.377653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0245  hypothetical protein  67.82 
 
 
89 aa  120  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.519653  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0296  phosphoryl transfer system, HPr  66.67 
 
 
89 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0468  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  64.37 
 
 
89 aa  117  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.278707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0219  HPrNtr  60.92 
 
 
89 aa  117  7e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4083  phosphoryl transfer system, HPr  60.92 
 
 
89 aa  114  5e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1657  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  60.92 
 
 
89 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.769211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1952  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  59.77 
 
 
89 aa  110  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1031  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  63.22 
 
 
89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4897  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  59.77 
 
 
89 aa  108  3e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0408  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  59.77 
 
 
89 aa  107  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0324  phosphocarrier protein HPr  65.85 
 
 
89 aa  107  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0273003  normal  0.0186594 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0376  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.55 
 
 
89 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.293876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0298  HPrNtr  62.07 
 
 
89 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0238  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  63.75 
 
 
89 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.610305  normal  0.320844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2966  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  59.09 
 
 
88 aa  104  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.351605  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0291  phosphocarrier, HPr family  56.32 
 
 
89 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1882  phosphocarrier protein HPr  57.95 
 
 
88 aa  103  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38742  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2161  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.95 
 
 
88 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0353  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  57.47 
 
 
89 aa  102  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000307134 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0744  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 
89 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0296  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.17 
 
 
89 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166635 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1288  HPrNtr  55.68 
 
 
88 aa  100  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.12196  hitchhiker  0.00000200864 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1281  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  60 
 
 
89 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544435  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0152  HPrNtr  55.81 
 
 
90 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28673  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0720  phosphoryl transfer system, HPr  54.02 
 
 
89 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0159  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.65 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0170  phosphocarrier, HPr family  54.65 
 
 
90 aa  98.6  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0467  HPrNtr  51.76 
 
 
108 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.319274  normal  0.40713 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2719  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  56.32 
 
 
89 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1209  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
89 aa  96.7  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0756  phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
89 aa  96.7  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1190  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.86 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0665  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.14 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0224  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.28 
 
 
89 aa  95.5  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3385  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.55 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4626  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  55.06 
 
 
92 aa  94.7  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.563542  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0751  phosphotransferase system HPr enzyme  50 
 
 
89 aa  95.1  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.862158  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2132  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.595795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1930  phosphocarrier protein HPr  51.72 
 
 
95 aa  93.6  7e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000294443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0130  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.43 
 
 
89 aa  93.6  8e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0517698 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1757  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  47.73 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2760  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  51.19 
 
 
93 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0566866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0357  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.24 
 
 
110 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0371  phosphotransferase system, HPr  49.41 
 
 
111 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0255941 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2799  phosphoryl transfer system, HPr  47.73 
 
 
89 aa  91.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0874  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.41 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02220  phosphotransferase system HPr enzyme  48.86 
 
 
89 aa  90.1  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.340612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0157  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  50 
 
 
90 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.160349 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0593  HPrNtr  50 
 
 
112 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.040328  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0540  hypothetical protein  48.28 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0516  hypothetical protein  48.28 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3446  HPrNtr  49.41 
 
 
112 aa  88.2  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2420  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.32 
 
 
89 aa  88.6  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.11815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0980  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  54.55 
 
 
88 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0602  HPrNtr  57.47 
 
 
89 aa  87.8  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0048  phosphocarrier protein HPr  50.59 
 
 
91 aa  87.8  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0117  HPrNtr domain-containing protein  46.59 
 
 
90 aa  87  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.668749  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2626  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  53.57 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.325956  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3019  phosphocarrier protein HPr  53.57 
 
 
90 aa  86.3  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.330484  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2076  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  46.59 
 
 
88 aa  86.3  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3575  HPr family phosphocarrier protein  51.76 
 
 
101 aa  85.9  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0948  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  45.45 
 
 
89 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.660983 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2234  HPr family phosphocarrier protein  48.78 
 
 
119 aa  85.9  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2095  phosphocarrier protein HPr  50.59 
 
 
104 aa  85.5  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4094  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.58 
 
 
89 aa  84.7  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0707453  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2014  phosphocarrier protein HPr  50.59 
 
 
104 aa  85.5  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.205162  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3182  HNH nuclease  44.83 
 
 
89 aa  85.1  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0077  HPr family phosphocarrier protein  49.41 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.984139 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0824  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  49.41 
 
 
104 aa  84  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1165  phosphocarrier protein HPr  46.34 
 
 
88 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.388376  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2283  Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  44.71 
 
 
88 aa  84  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47392  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1143  phosphocarrier protein HPr  46.34 
 
 
88 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.716406  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1869  HPrNtr  48.28 
 
 
88 aa  84  7e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3144  phosphocarrier protein Chr  49.38 
 
 
85 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1361  phosphocarrier protein HPr  47.44 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.228078  hitchhiker  0.00001957 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3092  phosphocarrier protein NPR  46.51 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.429943  normal  0.129077 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2849  phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr  48.24 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.531241  normal  0.30984 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>