51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2403 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2403  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  309  1e-83  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.482031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1125  hypothetical protein  38.46 
 
 		 162 aa  91.7  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2184  hypothetical protein  36.17 
 
 		 141 aa  90.1  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.483241  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1540  protein of unknown function DUF1058  36.43 
 
 		 165 aa  84.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0614  hypothetical protein  36.17 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0346  hypothetical protein  29.8 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00234847  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5059  hypothetical protein  34.34 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0044  hypothetical protein  35.29 
 
 		 185 aa  57.4  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0036  hypothetical protein  35.29 
 
 		 176 aa  57  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.239823 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4408  protein of unknown function DUF1058  29.25 
 
 		 179 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3061  hypothetical protein  32.65 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4088  protein of unknown function DUF1058  31.13 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0072  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.237291  normal  0.464662 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2971  hypothetical protein  31.25 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3642  hypothetical protein  32.69 
 
 		 199 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000544722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3379  hypothetical protein  31.13 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0353  hypothetical protein  35.29 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.539349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0779  hypothetical protein  31.25 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0615  hypothetical protein  31.37 
 
 		 174 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.190546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3789  hypothetical protein  28.28 
 
 		 186 aa  50.8  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3400  protein of unknown function DUF1058  28.38 
 
 		 153 aa  51.2  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.874568  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2312  hypothetical protein  31.63 
 
 		 191 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0986  hypothetical protein  31.63 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2188  hypothetical protein  30.61 
 
 		 197 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1266  hypothetical protein  26.09 
 
 		 185 aa  48.5  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0914  hypothetical protein  32.65 
 
 		 190 aa  48.5  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2088  hypothetical protein  31.07 
 
 		 245 aa  48.1  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3942  hypothetical protein  34.62 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2176  hypothetical protein  31.07 
 
 		 181 aa  47.4  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0315  hypothetical protein  27.36 
 
 		 179 aa  47.4  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1903  M23/37 family peptidase  28.45 
 
 		 564 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000402629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1938  peptidase, M23/M37 family  28.45 
 
 		 564 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2868799999999999e-45 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0218  hypothetical protein  29.13 
 
 		 174 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.236167  normal  0.0484329 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1742  peptidase M23/M37 family protein  28.45 
 
 		 564 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000319429  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4125  hypothetical protein  32.35 
 
 		 183 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  0.305565 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1765  M24/M37 family peptidase  28.45 
 
 		 564 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000130231  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1942  hypothetical protein  28.57 
 
 		 200 aa  47  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0398084  decreased coverage  0.00719314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3295  hypothetical protein  24.03 
 
 		 158 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164661 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1909  peptidase, M23/M37 family  27.59 
 
 		 564 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00585964  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1100  hypothetical protein  28.16 
 
 		 239 aa  45.1  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00740954  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5957  protein of unknown function DUF1058  31.43 
 
 		 184 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0475342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2486  protein of unknown function DUF1058  30.39 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.11896 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0427  protein of unknown function DUF1058  31.07 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1586  batE protein  32.35 
 
 		 302 aa  43.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0510  hypothetical protein  26.47 
 
 		 192 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.833855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0735  hypothetical protein  25.96 
 
 		 190 aa  42.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2231  hypothetical protein  42.86 
 
 		 194 aa  42  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.115294 
 
 
-
 
NC_002978  WD1176  hypothetical protein  25.26 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0263  peptidase, M23/M37 family  28.87 
 
 		 603 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0304388 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0203  enterotoxin, putative  28.87 
 
 		 603 aa  40.8  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>