230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2394 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2394  phosphoglyceromutase  100 
 
 
513 aa  1058    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2188  phosphoglyceromutase  61.43 
 
 
517 aa  653    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5865  phosphoglyceromutase  60.12 
 
 
515 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18663  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0031  phosphoglyceromutase  57.71 
 
 
517 aa  618  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67770  phosphoglyceromutase  60.43 
 
 
515 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.842673 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5056  phosphoglyceromutase  59.49 
 
 
511 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4929  phosphoglyceromutase  59.49 
 
 
511 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0451  phosphoglyceromutase  57.56 
 
 
519 aa  610  1e-173  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.688516  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0494  phosphoglyceromutase  57.28 
 
 
516 aa  606  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1720  phosphoglyceromutase  57.37 
 
 
519 aa  607  9.999999999999999e-173  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5107  phosphoglyceromutase  58.5 
 
 
511 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4141  phosphoglyceromutase  56.19 
 
 
515 aa  603  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.793791  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0075  phosphoglyceromutase  55.99 
 
 
515 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0069  phosphoglyceromutase  55.99 
 
 
515 aa  601  1.0000000000000001e-171  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0333  phosphoglyceromutase  57.91 
 
 
508 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0676803  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3166  phosphoglyceromutase  58.82 
 
 
519 aa  599  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0040  phosphoglyceromutase  58.1 
 
 
514 aa  598  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4246  phosphoglyceromutase  59.53 
 
 
510 aa  601  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0255535 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0093  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  56.67 
 
 
514 aa  595  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0043  phosphoglyceromutase  57.71 
 
 
514 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3949  phosphoglyceromutase  56.67 
 
 
514 aa  595  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.549374 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0047  phosphoglyceromutase  57.91 
 
 
514 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000662777 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3903  phosphoglyceromutase  56.19 
 
 
514 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.361835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3922  phosphoglyceromutase  56.39 
 
 
514 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.935714  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3984  phosphoglyceromutase  56.39 
 
 
514 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.669307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0060  phosphoglyceromutase  57.96 
 
 
513 aa  595  1e-169  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4090  phosphoglyceromutase  56.39 
 
 
514 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4332  phosphoglyceromutase  57.71 
 
 
514 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4029  phosphoglyceromutase  56.39 
 
 
514 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03470  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 
514 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5327  phosphoglycerate mutase, 2,3-bisphosphoglycerate-independent  56.78 
 
 
510 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4116  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 
514 aa  593  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03421  hypothetical protein  56.47 
 
 
514 aa  593  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3824  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 
514 aa  593  1e-168  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0096  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 
514 aa  593  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0047  phosphoglyceromutase  57.51 
 
 
514 aa  592  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  0.0000166466 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4985  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 
514 aa  593  1e-168  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.676695  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4040  phosphoglyceromutase  56.47 
 
 
514 aa  593  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0526  phosphoglyceromutase  59.1 
 
 
509 aa  588  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.594564  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0049  phosphoglyceromutase  56.72 
 
 
514 aa  588  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0045  phosphoglyceromutase  57.31 
 
 
514 aa  591  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000150167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0043  phosphoglyceromutase  57.31 
 
 
514 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00316902 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0051  phosphoglyceromutase  57.11 
 
 
514 aa  588  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000185111 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0684  phosphoglyceromutase  59.1 
 
 
509 aa  588  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113328 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002247  2,3-bisphosphoglycerate-independent phosphoglycerate mutase  57.71 
 
 
510 aa  587  1e-166  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0136338  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4885  phosphoglyceromutase  56.58 
 
 
529 aa  585  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0409  phosphoglyceromutase  58.5 
 
 
511 aa  586  1e-166  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.518325 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0123  phosphoglyceromutase  56.19 
 
 
514 aa  587  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4819  phosphoglyceromutase  55.01 
 
 
514 aa  583  1.0000000000000001e-165  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.799171  hitchhiker  0.000265912 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27440  phosphoglyceromutase  59.38 
 
 
511 aa  578  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04670  phosphoglyceromutase  59.49 
 
 
511 aa  580  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3806  phosphoglyceromutase  55.91 
 
 
514 aa  579  1e-164  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.823885 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00121  phosphoglyceromutase  56.52 
 
 
510 aa  576  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4391  phosphoglyceromutase  55.38 
 
 
520 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0257  phosphoglyceromutase  56.34 
 
 
516 aa  577  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4877  phosphoglyceromutase  55.4 
 
 
514 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4021  phosphoglyceromutase  55.4 
 
 
513 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0246  phosphoglyceromutase  56.34 
 
 
516 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.605789  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0723  phosphoglyceromutase  55.1 
 
 
509 aa  576  1.0000000000000001e-163  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1404  phosphoglyceromutase  53.71 
 
 
512 aa  570  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00187376  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3698  phosphoglyceromutase  55.14 
 
 
514 aa  569  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4470  phosphoglyceromutase  54.81 
 
 
514 aa  569  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000756408 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4217  phosphoglyceromutase  54.42 
 
 
514 aa  569  1e-161  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1431  phosphoglyceromutase  53.74 
 
 
530 aa  567  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.896282 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0673  phosphoglyceromutase  53.55 
 
 
552 aa  566  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3611  phosphoglyceromutase  53.65 
 
 
511 aa  561  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0257  phosphoglyceromutase  55.36 
 
 
516 aa  564  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.359629  normal  0.907394 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0305  phosphoglyceromutase  56.39 
 
 
509 aa  564  1.0000000000000001e-159  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3134  phosphoglyceromutase  54.58 
 
 
511 aa  558  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1956  phosphoglyceromutase  54 
 
 
521 aa  559  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.029965  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0265  phosphoglyceromutase  56.58 
 
 
513 aa  559  1e-158  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0235  phosphoglyceromutase  56.53 
 
 
516 aa  559  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.2203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15800  phosphoglyceromutase  52.95 
 
 
512 aa  559  1e-158  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0071307  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0046  phosphoglyceromutase  57.12 
 
 
525 aa  560  1e-158  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2259  phosphoglyceromutase  53.71 
 
 
511 aa  558  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3211  phosphoglyceromutase  54.42 
 
 
509 aa  560  1e-158  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.55726 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2738  phosphoglyceromutase  56.02 
 
 
510 aa  559  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000279445  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3050  phosphoglyceromutase  54.55 
 
 
516 aa  555  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.583924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1309  phosphoglyceromutase  53.36 
 
 
514 aa  555  1e-157  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2959  phosphoglyceromutase  54.49 
 
 
512 aa  553  1e-156  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000558659  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1508  phosphoglyceromutase  53.11 
 
 
512 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1298  phosphoglyceromutase  52.92 
 
 
512 aa  553  1e-156  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00238199  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4127  phosphoglyceromutase  55.06 
 
 
512 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000341854  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0167  phosphoglyceromutase  54.64 
 
 
505 aa  551  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.414873  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0140  phosphoglyceromutase  54.78 
 
 
511 aa  550  1e-155  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0701  phosphoglyceromutase  53.17 
 
 
552 aa  546  1e-154  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1223  phosphoglyceromutase  52.27 
 
 
517 aa  548  1e-154  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0135  phosphoglyceromutase  53.83 
 
 
516 aa  546  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2988  phosphoglyceromutase  53.14 
 
 
516 aa  547  1e-154  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00782111  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3934  phosphoglyceromutase  51.76 
 
 
513 aa  545  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000777024  normal  0.797845 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2222  phosphoglyceromutase  51.45 
 
 
525 aa  544  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.169882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3611  phosphoglyceromutase  54.81 
 
 
510 aa  545  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.055696  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4986  phosphoglyceromutase  53.15 
 
 
509 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4815  phosphoglyceromutase  53.15 
 
 
509 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4825  phosphoglyceromutase  53.15 
 
 
509 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5365  phosphoglyceromutase  53.15 
 
 
509 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00214518  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5250  phosphoglyceromutase  53.15 
 
 
509 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.120995  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5221  phosphoglyceromutase  52.95 
 
 
509 aa  538  1e-151  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4928  phosphoglyceromutase  53.35 
 
 
509 aa  537  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.237588  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5285  phosphoglyceromutase  52.95 
 
 
509 aa  537  1e-151  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000133351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>