More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2390 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2390  adenylyltransferase  100 
 
 
251 aa  494  1e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.648878  normal  0.790433 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  58.13 
 
 
259 aa  285  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3860  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  57.26 
 
 
251 aa  280  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.810636 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3507  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.85 
 
 
254 aa  280  2e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  55.24 
 
 
266 aa  278  5e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  59.76 
 
 
259 aa  277  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.85 
 
 
254 aa  277  1e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.22 
 
 
253 aa  275  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  58.63 
 
 
253 aa  275  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  56.63 
 
 
251 aa  275  6e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.47 
 
 
250 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  57.83 
 
 
254 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4105  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  55.82 
 
 
251 aa  269  2e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.129718  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  53.25 
 
 
253 aa  270  2e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  57.83 
 
 
252 aa  269  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1083  putative molybdopterin biosynthesis protein  57.32 
 
 
254 aa  268  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.365488  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4183  putative molybdopterin biosynthesis protein  52.03 
 
 
252 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0085  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  55.65 
 
 
251 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2358  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  54.47 
 
 
248 aa  265  7e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.63 
 
 
252 aa  264  8e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.853411  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0263  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.21 
 
 
252 aa  264  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1118  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  53.66 
 
 
250 aa  263  2e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  54.07 
 
 
257 aa  261  8.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0951  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  59.76 
 
 
259 aa  260  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0414  HesA/MoeB/ThiF family protein  52.02 
 
 
274 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.665894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0660  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.22 
 
 
252 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  55.28 
 
 
247 aa  258  9e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0476  HesA/MoeB/ThiF family protein  51.22 
 
 
252 aa  257  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.41 
 
 
250 aa  257  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.318137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0735  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  57.03 
 
 
251 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3210  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  51.22 
 
 
252 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0495  HesA/MoeB/ThiF family protein  51.22 
 
 
252 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0776  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  57.83 
 
 
251 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0183  HesA/MoeB/ThiF family protein  51.22 
 
 
252 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1532  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  55.65 
 
 
259 aa  256  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1409  HesA/MoeB/ThiF family protein  51.22 
 
 
252 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2245  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  51 
 
 
250 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2859  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51 
 
 
250 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2836  HesA/MoeB/ThiF family protein  51.22 
 
 
252 aa  256  2e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  53.66 
 
 
245 aa  255  5e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0034  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.01 
 
 
249 aa  255  5e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.439342  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4746  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  59.04 
 
 
251 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159527  normal  0.138679 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6188  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  50.2 
 
 
271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2776  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.2 
 
 
250 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2100  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.61 
 
 
251 aa  251  7e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0444  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.6 
 
 
250 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.441495  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41450  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  58.23 
 
 
252 aa  250  1e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2914  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.8 
 
 
250 aa  250  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4454  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  56.22 
 
 
251 aa  248  5e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  53.01 
 
 
248 aa  246  2e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  56.1 
 
 
260 aa  243  3e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.296557  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1811  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.03 
 
 
250 aa  243  3e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0613  adenylyltransferase  53.66 
 
 
248 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0302  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  53.25 
 
 
249 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.39 
 
 
383 aa  236  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.22 
 
 
251 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0652  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  51.22 
 
 
251 aa  236  2e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.522282  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0282  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.97 
 
 
249 aa  235  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490625 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0226  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  53.25 
 
 
249 aa  233  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000578228 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  50 
 
 
390 aa  232  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49 
 
 
387 aa  232  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.82 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.41 
 
 
249 aa  231  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  48.19 
 
 
392 aa  231  7.000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.18 
 
 
383 aa  229  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.18 
 
 
383 aa  230  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49 
 
 
390 aa  229  3e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2985  thiamine biosynthesis adenylyltransferase ThiF  45.45 
 
 
282 aa  229  3e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0207  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.85 
 
 
249 aa  229  4e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.430763  normal  0.232129 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  47.2 
 
 
269 aa  228  7e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0218  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52.85 
 
 
259 aa  228  9e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0351  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  53.23 
 
 
249 aa  227  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0392139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49 
 
 
390 aa  228  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold protein  45.16 
 
 
257 aa  227  1e-58  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.37 
 
 
364 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  46.8 
 
 
396 aa  226  3e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1380  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.4 
 
 
271 aa  225  4e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.39 
 
 
395 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0214  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.63 
 
 
259 aa  224  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.886192  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.39 
 
 
268 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4568  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  47.15 
 
 
252 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00103081 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0951  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.8 
 
 
272 aa  222  4.9999999999999996e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00521597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0249  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  53.25 
 
 
250 aa  222  4.9999999999999996e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0922  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  47.37 
 
 
390 aa  222  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698196  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  48.39 
 
 
393 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  47.58 
 
 
377 aa  221  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7815  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  48.33 
 
 
393 aa  221  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3793  molybdopterin biosynthesis protein  48.59 
 
 
271 aa  221  9e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4494  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  46.99 
 
 
252 aa  221  9.999999999999999e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.360756  hitchhiker  0.00000302852 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0095  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.81 
 
 
255 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1160  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  48.99 
 
 
480 aa  221  9.999999999999999e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.284227  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1499  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  49.39 
 
 
250 aa  219  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039426  normal  0.0112948 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  48.21 
 
 
255 aa  219  3e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4372  adenylyltransferase ThiF  47.56 
 
 
252 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0245  thiamine biosynthesis protein (HesA/MoeB/ThiF family protein)  46.44 
 
 
345 aa  219  3e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.881416 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  46.18 
 
 
403 aa  219  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  43.5 
 
 
250 aa  219  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1945  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  52 
 
 
350 aa  219  3.9999999999999997e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410103  decreased coverage  0.00836902 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  47.58 
 
 
393 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  45.97 
 
 
392 aa  218  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>