More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2349 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2349  hypothetical protein  100 
 
 		 256 aa  523  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.672728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0864  oxidoreductase molybdopterin binding  59.85 
 
 		 259 aa  298  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4816  oxidoreductase molybdopterin binding  57.71 
 
 		 258 aa  285  5e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2568  oxidoreductase molybdopterin binding  56.52 
 
 		 258 aa  275  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0385834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3632  oxidoreductase molybdopterin binding  49.83 
 
 		 315 aa  275  7e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.363586 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3309  oxidoreductase molybdopterin binding  49.5 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.62654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3509  oxidoreductase molybdopterin binding  48.85 
 
 		 318 aa  268  5e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0563  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.6 
 
 		 251 aa  262  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.276964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1812  oxidoreductase, molybdopterin binding  59.26 
 
 		 249 aa  261  8e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218509  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4106  oxidoreductase molybdopterin binding  49.62 
 
 		 262 aa  260  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0018  oxidoreductase, molybdopterin-binding  50.2 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0015  oxidoreductase, molybdopterin-binding  50.2 
 
 		 262 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.642429  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0491  oxidoreductase, molybdopterin binding  57.58 
 
 		 256 aa  238  8e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.727181  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4302  oxidoreductase molybdopterin binding  45.38 
 
 		 247 aa  216  4e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4154  oxidoreductase molybdopterin binding  43.37 
 
 		 247 aa  211  7e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3845  oxidoreductase molybdopterin binding  42.97 
 
 		 247 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.624438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding protein  48.57 
 
 		 495 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0908687  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4346  oxidoreductase, molybdopterin binding  46.98 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.315393  normal  0.221875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1008  oxidoreductase molybdopterin binding  37.46 
 
 		 319 aa  176  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.700197  normal  0.289957 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4930  oxidoreductase molybdopterin binding  40.16 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.73484  normal  0.226199 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2177  putative oxidoreductase, molybdopterin binding  40.73 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.60597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1752  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  39.76 
 
 		 258 aa  172  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.175218  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1625  oxidoreductase molybdopterin binding  40.47 
 
 		 256 aa  169  5e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.464814  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3371  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.76 
 
 		 256 aa  168  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0860075  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3286  oxidoreductase molybdopterin binding  39.61 
 
 		 241 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.18954  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3943  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.67 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1697  oxidoreductase molybdopterin binding  40.64 
 
 		 249 aa  165  6.9999999999999995e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0744  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.31 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1225  oxidoreductase, molybdopterin binding  40.31 
 
 		 262 aa  165  8e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1198  oxidoreductase molybdopterin binding  40.31 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0452128  normal  0.688101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1510  oxidoreductase molybdopterin binding  38.8 
 
 		 262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.832441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64540  hypothetical protein  41.45 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4334  oxidoreductase, molybdopterin binding  40 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.868418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5604  hypothetical protein  41.45 
 
 		 255 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2666  oxidoreductase molybdopterin binding  38.96 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2730  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.52 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.195614 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0541  oxidoreductase, molybdopterin binding  38.52 
 
 		 263 aa  162  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1108  oxidoreductase molybdopterin binding  39.22 
 
 		 262 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1201  oxidoreductase molybdopterin binding protein  35.74 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1108  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.11 
 
 		 262 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.906624  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5020  oxidoreductase molybdopterin binding  38.82 
 
 		 258 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.159564 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6422  oxidoreductase molybdopterin binding  38.55 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.603539  normal  0.600006 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0486  oxidoreductase, molybdopterin-binding  41.53 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0666  oxidoreductase, molybdopterin-binding  41.53 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.540729  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1400  oxidoreductase, molybdopterin-binding  41.53 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1201  oxidoreductase, molybdopterin-binding  41.53 
 
 		 263 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.463291  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0958  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.02 
 
 		 240 aa  158  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1495  oxidoreductase molybdopterin binding  38.96 
 
 		 255 aa  158  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3600  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  39.74 
 
 		 215 aa  158  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3085  oxidoreductase, molybdopterin-binding  41.13 
 
 		 263 aa  157  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3725  oxidoreductase molybdopterin binding  38.55 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6764  oxidoreductase molybdopterin binding  36.9 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1533  oxidoreductase, molybdopterin-binding  41.13 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1405  oxidoreductase, molybdopterin-binding  41.13 
 
 		 263 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2990  oxidoreductase molybdopterin binding  39.37 
 
 		 263 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.587027  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2840  oxidoreductase, molybdopterin-binding  39.11 
 
 		 263 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4897  oxidoreductase molybdopterin binding  39.22 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00490947  decreased coverage  0.000741335 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1518  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.11 
 
 		 263 aa  154  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0338  putative oxidoreductase molybdopterin binding  37.35 
 
 		 260 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.0092485  normal  0.0273242 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2592  oxidoreductase, molybdopterin binding  39.52 
 
 		 262 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.938521  normal  0.743537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2751  oxidoreductase molybdopterin binding  38.4 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0587289 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0620  hypothetical protein  38.65 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3598  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.6 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3628  oxidoreductase molybdopterin binding  40 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0640094 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0223  oxidoreductase molybdopterin binding  35.71 
 
 		 259 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3134  oxidoreductase molybdopterin binding  38.19 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219177 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0309  oxidoreductase molybdopterin binding  39.84 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.261244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4164  oxidoreductase molybdopterin binding  38.15 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.430302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0297  oxidoreductase molybdopterin binding  39.44 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0316  oxidoreductase, molybdopterin binding  42.03 
 
 		 517 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0487  twin-arginine translocation pathway signal  35.86 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1560  oxidoreductase molybdopterin binding  39.76 
 
 		 234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0242  twin-arginine translocation pathway signal  35.32 
 
 		 259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.297118  normal  0.0333661 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1638  oxidoreductase molybdopterin binding  39.76 
 
 		 234 aa  145  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.934019  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0333  twin-arginine translocation pathway signal  35.32 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2994  oxidoreductase, molybdopterin binding  37.2 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2311  molybdopterin-binding oxidoreductase  39.76 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0961  oxidoreductase molybdopterin binding  34.52 
 
 		 263 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3769  oxidoreductase molybdopterin binding protein  40.97 
 
 		 328 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3278  putative sulfite oxidase subunit YedY  38.6 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2981  putative sulfite oxidase subunit YedY  38.55 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00718  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.36 
 
 		 322 aa  99  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0719411  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3141  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.84 
 
 		 334 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.258907  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0384  putative sulfite oxidase subunit YedY  41.1 
 
 		 317 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.10592  normal  0.557943 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0650  oxidoreductase, molybdopterin binding  33.77 
 
 		 237 aa  97.1  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0972302  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4244  oxidoreductase molybdopterin binding protein  29.01 
 
 		 266 aa  96.7  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.978688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0713  putative sulfite oxidase subunit YedY  34.98 
 
 		 332 aa  97.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.348188 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2758  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 331 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3454  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 331 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.926854  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3739  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 331 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337436  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3769  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 331 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3711  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 331 aa  96.3  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1900  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 331 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.190019  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3194  putative sulfite oxidase subunit YedY  33.33 
 
 		 331 aa  96.3  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.349387  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1564  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.37 
 
 		 311 aa  95.9  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0532333  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1013  putative sulfite oxidase subunit YedY  36.25 
 
 		 313 aa  95.5  8e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.300604 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1458  putative sulfite oxidase subunit YedY  37.95 
 
 		 315 aa  95.1  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.516736  normal  0.156711 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3680  putative sulfite oxidase subunit YedY  30.54 
 
 		 331 aa  94.7  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0844677  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5586  putative sulfite oxidase subunit YedY  39.77 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.18066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0932  putative sulfite oxidase subunit YedY  35.26 
 
 		 319 aa  93.6  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.958125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>