201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2337 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2337  organic solvent tolerance transmembrane protein  100 
 
 		 728 aa  1484    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.503681  normal  0.440955 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0521  organic solvent tolerance protein  43.87 
 
 		 929 aa  571  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3659  organic solvent tolerance protein  39.27 
 
 		 849 aa  523  1e-147  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.880911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0391  Organic solvent tolerance protein  41.7 
 
 		 813 aa  519  1e-146  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.298665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2149  organic solvent tolerance protein  36.4 
 
 		 803 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.550449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1454  Organic solvent tolerance protein  41.58 
 
 		 836 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591855  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0406  Organic solvent tolerance protein  41.42 
 
 		 813 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0515  organic solvent tolerance transmembrane protein  41.13 
 
 		 811 aa  507  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877133  normal  0.048519 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0436  organic solvent tolerance protein  38.31 
 
 		 824 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.524466 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0497  organic solvent tolerance protein  36.46 
 
 		 810 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4863  organic solvent tolerance protein  37.93 
 
 		 822 aa  457  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.102386 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2714  Organic solvent tolerance protein  39.97 
 
 		 753 aa  455  1.0000000000000001e-126  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0675  Organic solvent tolerance protein  35.82 
 
 		 788 aa  449  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4112  organic solvent tolerance protein  36.93 
 
 		 783 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4812  organic solvent tolerance protein  37.57 
 
 		 856 aa  446  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.685199  normal  0.0371737 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3470  Organic solvent tolerance protein  36.79 
 
 		 791 aa  446  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.917858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0396  organic solvent tolerance protein  36.14 
 
 		 788 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.441976  normal  0.0999186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4024  putative organic solvent tolerance protein  35.45 
 
 		 789 aa  438  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.560503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4764  organic solvent tolerance protein  36.74 
 
 		 820 aa  437  1e-121  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2629  organic solvent tolerance protein  34.53 
 
 		 786 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2763  organic solvent tolerance protein  34.36 
 
 		 786 aa  426  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6038  organic solvent tolerance protein  33.69 
 
 		 786 aa  424  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0098  organic solvent tolerance protein  35.83 
 
 		 799 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2738  organic solvent tolerance protein  34.61 
 
 		 786 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2099  organic solvent tolerance protein  34.61 
 
 		 786 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2711  organic solvent tolerance protein  34.61 
 
 		 786 aa  424  1e-117  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4076  organic solvent tolerance protein  35.11 
 
 		 814 aa  425  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.258262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0588  organic solvent tolerance protein  34.37 
 
 		 786 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.649611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0202  putative organic solvent tolerance transmembrane protein  35.58 
 
 		 819 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.829458 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2115  Organic solvent tolerance protein  34.32 
 
 		 808 aa  413  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0208  organic solvent tolerance protein, putative  33.73 
 
 		 787 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.357539  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0871  organic solvent tolerance protein, putative  33.73 
 
 		 787 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2737  putative organic solvent tolerance protein  33.73 
 
 		 787 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2341  putative organic solvent tolerance protein  33.73 
 
 		 787 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.651905  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0692  organic solvent tolerance protein  33.73 
 
 		 787 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0706  organic solvent tolerance protein  33.73 
 
 		 787 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2421  putative organic solvent tolerance protein  33.73 
 
 		 761 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644424  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3482  organic solvent tolerance protein  33.61 
 
 		 776 aa  405  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.151246 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6035  organic solvent tolerance protein  35.06 
 
 		 774 aa  403  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1724  organic solvent tolerance protein  36.27 
 
 		 738 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0575  organic solvent tolerance protein, putative  33.2 
 
 		 787 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5275  Organic solvent tolerance protein  32.55 
 
 		 860 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0199  organic solvent tolerance protein  34.93 
 
 		 757 aa  382  1e-104  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0836973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1977  Organic solvent tolerance protein  35.15 
 
 		 751 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1574  Organic solvent tolerance protein  30.51 
 
 		 841 aa  373  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07770  organic solvent tolerance protein OstA precursor  31.97 
 
 		 924 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0241314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04642  organic solvent tolerance protein  33.51 
 
 		 813 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0686354  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4624  organic solvent tolerance protein  31.02 
 
 		 926 aa  362  2e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0438  organic solvent tolerance protein  30.6 
 
 		 935 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.373211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1870  organic solvent tolerance protein  30.37 
 
 		 816 aa  362  2e-98  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0739  organic solvent tolerance protein OstA precursor  30.91 
 
 		 922 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5132  organic solvent tolerance protein  30.25 
 
 		 937 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.563491  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0554  organic solvent tolerance protein, putative  30.63 
 
 		 905 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3911  organic solvent tolerance protein  34.36 
 
 		 863 aa  355  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46800  Organic solvent tolerance protein  32.18 
 
 		 919 aa  353  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.532703  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1936  organic solvent tolerance protein  33.38 
 
 		 792 aa  350  4e-95  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2012  organic solvent tolerance protein  32.55 
 
 		 792 aa  348  2e-94  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0435  organic solvent tolerance protein  30.34 
 
 		 932 aa  347  6e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00337227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4798  organic solvent tolerance protein  29.25 
 
 		 934 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4010  organic solvent tolerance protein  29.96 
 
 		 938 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0601  organic solvent tolerance protein, putative  30.49 
 
 		 1091 aa  333  5e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1020  organic solvent tolerance protein  31.82 
 
 		 794 aa  328  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1274  Organic solvent tolerance protein  30.51 
 
 		 778 aa  327  3e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.436193  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0375  hypothetical protein  29.58 
 
 		 839 aa  326  1e-87  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0671  organic solvent tolerance protein  30.18 
 
 		 826 aa  325  2e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0350  hypothetical protein  29.36 
 
 		 839 aa  324  3e-87  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0967  organic solvent tolerance protein  30.17 
 
 		 774 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000267662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1017  organic solvent tolerance protein  30.18 
 
 		 773 aa  318  3e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000878563  hitchhiker  0.00955351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0865  organic solvent tolerance protein  30.36 
 
 		 774 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000634249  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3076  organic solvent tolerance protein  30.11 
 
 		 766 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3510  organic solvent tolerance protein  32.7 
 
 		 794 aa  312  1e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0882  organic solvent tolerance protein  30.18 
 
 		 773 aa  313  1e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000270887  normal  0.785369 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2816  organic solvent tolerance protein  29.16 
 
 		 764 aa  311  2.9999999999999997e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.472096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3418  organic solvent tolerance protein  31.08 
 
 		 735 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000112563  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0740  organic solvent tolerance protein, putative  29.31 
 
 		 860 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0917  organic solvent tolerance protein  29.95 
 
 		 821 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2885  organic solvent tolerance protein  28.85 
 
 		 766 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000379496  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3441  organic solvent tolerance protein  30.24 
 
 		 780 aa  301  2e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3570  organic solvent tolerance protein  30.24 
 
 		 750 aa  301  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000108275  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1050  organic solvent tolerance protein  27.3 
 
 		 790 aa  300  7e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0769  organic solvent tolerance protein  29.94 
 
 		 750 aa  300  8e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000043296  normal  0.038123 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3034  organic solvent tolerance protein, putative  28.88 
 
 		 701 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2643  Organic solvent tolerance protein  28.88 
 
 		 727 aa  290  8e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.301946  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4523  organic solvent tolerance protein  27.62 
 
 		 771 aa  289  1e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0605  organic solvent tolerance protein  29.15 
 
 		 799 aa  287  4e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0272025  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3829  organic solvent tolerance protein  27.52 
 
 		 801 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0727  organic solvent tolerance protein  28.81 
 
 		 787 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000065541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0992  organic solvent tolerance protein  28.88 
 
 		 765 aa  284  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0210027  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3632  organic solvent tolerance protein  27.13 
 
 		 799 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000841674  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03411  organic solvent tolerance protein  26.91 
 
 		 750 aa  279  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.473581  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1049  organic solvent tolerance protein  28.59 
 
 		 765 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000815644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3309  Organic solvent tolerance protein  28.59 
 
 		 765 aa  279  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000208036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1082  organic solvent tolerance protein  28.3 
 
 		 765 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000021692  normal  0.94876 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0371  organic solvent tolerance protein  28.49 
 
 		 784 aa  276  1.0000000000000001e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0908  organic solvent tolerance protein  27.42 
 
 		 765 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000625202  normal  0.177324 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3112  organic solvent tolerance protein  27.42 
 
 		 765 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000136701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0980  organic solvent tolerance protein  28.16 
 
 		 765 aa  275  3e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000900172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3206  organic solvent tolerance protein  27.42 
 
 		 765 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000004691  normal  0.810097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0566  organic solvent tolerance protein  28.51 
 
 		 807 aa  273  8.000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0203405  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0099  organic solvent tolerance protein  27.16 
 
 		 786 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0097442  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>