188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2324 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  579  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  54.93 
 
 		 305 aa  265  8e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  54.2 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  59.39 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  57.68 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  53.33 
 
 		 312 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  58.09 
 
 		 312 aa  258  8e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  57.68 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  59.57 
 
 		 317 aa  249  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  58.7 
 
 		 300 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  47.22 
 
 		 304 aa  231  2e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  55.13 
 
 		 300 aa  229  3e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  44.16 
 
 		 309 aa  228  7e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  49.22 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  49.22 
 
 		 260 aa  219  5e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  50.41 
 
 		 279 aa  219  6e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  53.09 
 
 		 306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  46.37 
 
 		 255 aa  213  3.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  41.35 
 
 		 261 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  44.66 
 
 		 261 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5081  hypothetical protein  48.84 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.53383  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1163  zinc/iron permease  50.84 
 
 		 300 aa  193  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.436725  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  46.12 
 
 		 258 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57990  hypothetical protein  47.51 
 
 		 310 aa  187  3e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  44.18 
 
 		 245 aa  186  5e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  44.18 
 
 		 245 aa  186  5e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0947  zinc/iron permease  47.41 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  42.86 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4268  zinc/iron permease  44.98 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0986  zinc/iron permease  47.01 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0954  zinc/iron permease  46.43 
 
 		 297 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.55549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  41.53 
 
 		 246 aa  178  1e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  40.16 
 
 		 251 aa  172  9e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0852  Zinc transporter ZIP  48.41 
 
 		 297 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  44.89 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0597  zinc/iron permease  42.17 
 
 		 246 aa  165  9e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000532722  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  37.98 
 
 		 244 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  36.76 
 
 		 243 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  39.13 
 
 		 272 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  42.57 
 
 		 271 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  37.2 
 
 		 258 aa  153  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  35.21 
 
 		 269 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  36.33 
 
 		 269 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  36.3 
 
 		 269 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  35.5 
 
 		 264 aa  149  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  39.38 
 
 		 264 aa  149  8e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  42.16 
 
 		 285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  35.63 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  35.57 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  38.96 
 
 		 273 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  41.92 
 
 		 270 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  34.81 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  39.62 
 
 		 277 aa  139  6e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  38.84 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  36.51 
 
 		 271 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  36.9 
 
 		 262 aa  137  3.0000000000000003e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  40.08 
 
 		 270 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  37.64 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  35.74 
 
 		 270 aa  132  6e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0224  metal cation transporter, zinc (Zn2+)-iron (Fe2+) permease (ZIP) family protein  35.71 
 
 		 273 aa  132  9e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0186331  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  36 
 
 		 271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1781  zinc/iron permease  40.88 
 
 		 284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.080702 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  38.1 
 
 		 271 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  35.47 
 
 		 268 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  33.45 
 
 		 286 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  39.36 
 
 		 270 aa  126  3e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2882  zinc/iron permease  41.04 
 
 		 267 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0130  zinc/iron permease  33.19 
 
 		 265 aa  122  8e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4292  zinc/iron permease  30.18 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1001  zinc/iron permease  32.92 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  31.87 
 
 		 272 aa  118  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2148  zinc/iron permease  37.25 
 
 		 276 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0305  zinc/iron permease  37.6 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0694906  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  35.6 
 
 		 269 aa  116  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3064  zinc/iron permease  38.25 
 
 		 248 aa  116  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  36.58 
 
 		 277 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  32.93 
 
 		 258 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3077  zinc/iron permease  33.19 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  33.33 
 
 		 247 aa  109  6e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1236  zinc/iron permease  30.51 
 
 		 267 aa  107  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.216123  normal  0.828913 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  32.56 
 
 		 268 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49400  predicted protein  34.86 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.396172  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  33.98 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  34.71 
 
 		 266 aa  104  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  33.91 
 
 		 254 aa  102  1e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  35.08 
 
 		 267 aa  101  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  34.29 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  32.92 
 
 		 252 aa  100  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  31.37 
 
 		 271 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  28.95 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  31.91 
 
 		 270 aa  94  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  30.47 
 
 		 298 aa  93.6  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  33.19 
 
 		 265 aa  93.6  4e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  31.97 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  32.91 
 
 		 246 aa  90.1  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  29.02 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  31.77 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  30 
 
 		 298 aa  89.7  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  28.14 
 
 		 265 aa  87  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  28.7 
 
 		 239 aa  86.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>