75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2293 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2293  phosphonate metabolism protein PhnJ  100 
 
 
299 aa  619  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2085  phosphonate metabolism PhnJ  76.39 
 
 
308 aa  471  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3689  phosphonate metabolism PhnJ  78.34 
 
 
308 aa  469  1e-131  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4040  phosphonate metabolism PhnJ  72.79 
 
 
299 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0220  phosphonate metabolism PhnJ  72.79 
 
 
299 aa  443  1e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3789  phosphonate metabolism PhnJ  71.58 
 
 
289 aa  439  1e-122  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3840  phosphonate metabolism PhnJ  71.94 
 
 
289 aa  439  1e-122  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.869881  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0427  phosphonate metabolism protein  73.43 
 
 
299 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.396425  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0463  phosphonate metabolism protein  73.43 
 
 
299 aa  434  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.343412  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5000  phosphonate metabolism PhnJ  71.33 
 
 
315 aa  427  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00558671  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4146  phosphonate metabolism PhnJ  67.6 
 
 
302 aa  411  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2292  phosphonate metabolism PhnJ  67.94 
 
 
302 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2911  phosphonate metabolism PhnJ  55.91 
 
 
295 aa  317  2e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.946533  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4189  phosphonate metabolism PhnJ  54.87 
 
 
293 aa  316  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4652  phosphonate metabolism protein PhnJ  55.04 
 
 
281 aa  315  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03930  hypothetical protein  55.04 
 
 
281 aa  315  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4339  phosphonate metabolism protein PhnJ  55.04 
 
 
281 aa  315  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3928  phosphonate metabolism PhnJ  55.04 
 
 
281 aa  315  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03970  carbon-phosphorus lyase complex subunit  55.04 
 
 
281 aa  315  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4564  phosphonate metabolism protein PhnJ  53.96 
 
 
281 aa  315  6e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2921  phosphonate metabolism PhnJ  54.91 
 
 
305 aa  315  6e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.108887  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3828  phosphonate metabolism PhnJ  54.86 
 
 
293 aa  314  1e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3893  phosphonate metabolism PhnJ  54.68 
 
 
281 aa  314  1e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5611  phosphonate metabolism protein PhnJ  54.68 
 
 
281 aa  314  1e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2883  phosphonate metabolism PhnJ  55.56 
 
 
289 aa  313  2e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.409915  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2254  phosphonate metabolism PhnJ  53.5 
 
 
295 aa  312  4e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00439967  normal  0.789995 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0302  phosphonate metabolism PhnJ  53.24 
 
 
281 aa  311  9e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.131985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4210  phosphonate metabolism PhnJ  54.17 
 
 
296 aa  310  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.558349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1283  phosphonate metabolism PhnJ  54.71 
 
 
293 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2562  phosphonate metabolism protein PhnJ  53.15 
 
 
295 aa  310  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3776  phosphonate metabolism PhnJ  52.78 
 
 
302 aa  309  3e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0231  phosphonate metabolism PhnJ  56.78 
 
 
335 aa  309  3e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.713809  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1588  phosphonate metabolism PhnJ  54.39 
 
 
288 aa  308  7e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2691  phosphonate metabolism PhnJ  53.6 
 
 
284 aa  308  9e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0763  phosphonate metabolism protein PhnJ  51.74 
 
 
295 aa  306  2e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00284174  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1752  hypothetical protein  53 
 
 
293 aa  306  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.109251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20390  hypothetical protein  53 
 
 
294 aa  305  5e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.168153  normal  0.830655 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0518  phosphonate metabolism PhnJ  52.33 
 
 
286 aa  303  2e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5943  phosphonate metabolism PhnJ  50.33 
 
 
310 aa  302  4e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0890  phosphonate metabolism PhnJ  52.88 
 
 
284 aa  301  9e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1313  phosphonate metabolism PhnJ  53.36 
 
 
299 aa  301  9e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.981243  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4092  phosphonate metabolism PhnJ  54.12 
 
 
293 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.419307  normal  0.0436641 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0482  phosphonate metabolism PhnJ  52.54 
 
 
301 aa  300  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2182  putative phosphonate metabolism PhnJ protein  51.59 
 
 
313 aa  300  3e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.260879  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0578  phosphonate metabolism PhnJ  51.04 
 
 
301 aa  299  4e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5845  putative PhnJ protein, phosphonate metabolism  54.74 
 
 
294 aa  298  6e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.955133  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2193  phosphonate metabolism PhnJ  52.9 
 
 
297 aa  298  7e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.371496  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2960  phosphonate metabolism PhnJ  55.52 
 
 
326 aa  298  8e-80  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4232  phosphonate metabolism PhnJ  52.17 
 
 
297 aa  297  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0273  hypothetical protein  51.05 
 
 
302 aa  294  1e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4121  phosphonate metabolism PhnJ  51.62 
 
 
291 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1311  phosphonate metabolism PhnJ  52.78 
 
 
283 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0677348  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3854  phosphonate metabolism PhnJ  53.98 
 
 
295 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.764067 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6095  phosphonate metabolism PhnJ  54.8 
 
 
299 aa  292  4e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0759  phosphonate metabolism PhnJ  53.65 
 
 
292 aa  291  9e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4435  phosphonate metabolism PhnJ  50.9 
 
 
291 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.734305  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3563  phosphonate metabolism protein PhnJ  53.09 
 
 
293 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3331  PhnJ protein, phosphonate metabolism, function unknown  50.91 
 
 
318 aa  289  3e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3697  phosphonate metabolism PhnJ  53.09 
 
 
293 aa  289  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4779  phosphonate metabolism PhnJ  52.73 
 
 
290 aa  289  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0683801  normal  0.346578 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0142  phosphonate metabolism PhnJ  52.9 
 
 
307 aa  289  5e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.03169  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4028  PhnJ protein  53.09 
 
 
293 aa  288  8e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0816  phosphonate metabolism PhnJ  52.13 
 
 
284 aa  286  3e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3509  phosphonate metabolism PhnJ  54.33 
 
 
288 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3700  phosphonate metabolism PhnJ  52.01 
 
 
293 aa  286  4e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.501076 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3308  phosphonate metabolism protein PhnJ  53.07 
 
 
324 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2589  phosphonate metabolism protein PhnJ  52.71 
 
 
324 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3342  phosphonate metabolism protein PhnJ  52.71 
 
 
324 aa  278  7e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.87201  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1180  phosphonate metabolism protein PhnJ  52.71 
 
 
324 aa  278  7e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2403  alkylphosphonate utilization operon protein PhnJ  52.35 
 
 
324 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1928  phosphonate metabolism PhnJ  51.09 
 
 
274 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0319  phosphonate metabolism protein PhnJ  52.35 
 
 
324 aa  276  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2281  phosphonate metabolism protein PhnJ  51.09 
 
 
274 aa  276  2e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2914  phosphonate metabolism PhnJ  53.24 
 
 
277 aa  271  7e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5870  phosphonate metabolism PhnJ  44.96 
 
 
293 aa  239  4e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>