More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2292 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2292  ABC phosphonate transport system ATPase  100 
 
 
276 aa  568  1e-161  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4145  ABC transporter related  78.99 
 
 
276 aa  456  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2293  ABC transporter related  78.62 
 
 
276 aa  457  1e-127  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5001  ABC transporter related  75 
 
 
276 aa  448  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.20285  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3688  ABC transporter for phosphonate ATP-binding protein  77.01 
 
 
278 aa  445  1.0000000000000001e-124  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2086  ABC transporter related  75.27 
 
 
278 aa  438  9.999999999999999e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4041  ABC transporter related  77.17 
 
 
276 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0221  ABC transporter related  77.17 
 
 
276 aa  438  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3839  ABC transporter related  68.84 
 
 
276 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.588878  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3788  ABC transporter related  68.84 
 
 
276 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0428  ABC type ATPase  69.42 
 
 
283 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.602427  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0464  ABC type ATPase  69.42 
 
 
283 aa  390  1e-107  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.849392  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0232  ABC transporter related  56.2 
 
 
286 aa  303  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3508  ABC transporter related  52.17 
 
 
279 aa  290  2e-77  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1587  ABC transporter related  52.54 
 
 
280 aa  288  6e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2961  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  53.33 
 
 
257 aa  248  8e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.919043  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6094  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  52.08 
 
 
263 aa  245  6.999999999999999e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.991353  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3698  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.45 
 
 
263 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4027  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.45 
 
 
263 aa  241  1e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3564  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.45 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2919  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  51.04 
 
 
262 aa  239  2.9999999999999997e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0502891  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4778  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  51.02 
 
 
260 aa  238  8e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.326884  normal  0.35491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0301  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.38 
 
 
251 aa  238  8e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0517  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.01 
 
 
262 aa  236  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4338  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.29 
 
 
252 aa  236  2e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03969  carbon-phosphorus lyase complex subunit  46.93 
 
 
252 aa  235  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3894  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.93 
 
 
252 aa  235  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03929  hypothetical protein  46.93 
 
 
252 aa  235  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.93 
 
 
252 aa  235  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4651  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.93 
 
 
252 aa  235  7e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5610  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.21 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1753  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.74 
 
 
271 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.18865  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4563  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.21 
 
 
252 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2690  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.55 
 
 
273 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.18 
 
 
262 aa  232  5e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0709875  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20400  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.38 
 
 
271 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110651  normal  0.49891 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3699  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.14 
 
 
256 aa  231  9e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.493547 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  51.43 
 
 
262 aa  231  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.328087  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2915  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.98 
 
 
254 aa  230  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.909018  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3829  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.59 
 
 
266 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.179517  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5844  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.39 
 
 
264 aa  229  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71167  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0483  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  44.89 
 
 
262 aa  229  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0891  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.79 
 
 
254 aa  229  5e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.60959  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4093  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.59 
 
 
266 aa  228  6e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0806703 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3332  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.39 
 
 
284 aa  228  8e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3852  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50 
 
 
257 aa  228  8e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0579  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.79 
 
 
262 aa  226  2e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4211  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  45.88 
 
 
256 aa  226  4e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.637449  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5869  ABC transporter-related protein  44.53 
 
 
291 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1929  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.78 
 
 
260 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2282  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.78 
 
 
260 aa  225  6e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2882  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  44.57 
 
 
269 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.769928  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2563  phosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  44.93 
 
 
273 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641397  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0758  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.19 
 
 
272 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850324  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0762  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  50.81 
 
 
258 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000264723  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1312  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  49.39 
 
 
265 aa  224  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.750857  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2255  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  44.64 
 
 
273 aa  221  7e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0000530025  normal  0.747967 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0817  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.18 
 
 
257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0274  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  44.93 
 
 
258 aa  219  3.9999999999999997e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2910  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.77 
 
 
257 aa  218  6e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.838485  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4120  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.33 
 
 
258 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0141  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  48.61 
 
 
294 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.662097  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4434  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.5 
 
 
258 aa  216  4e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4231  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  46.56 
 
 
258 aa  215  5e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.503556  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2192  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  45.56 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.153347  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3777  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  45.88 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4190  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  51.41 
 
 
258 aa  212  5.999999999999999e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2183  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  44.96 
 
 
256 aa  207  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.481502  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5944  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  44.96 
 
 
256 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.504755  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3307  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.56 
 
 
256 aa  205  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761331  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1181  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.56 
 
 
256 aa  204  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3341  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.56 
 
 
256 aa  204  9e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489996  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2590  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.56 
 
 
256 aa  204  9e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3353  phosphonates ABC transporter, ATP-binding protein  49.36 
 
 
611 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403888  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2404  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.35 
 
 
256 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0320  phosphonate C-P lyase system protein PhnK  47.35 
 
 
256 aa  202  5e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5668  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.15 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.467741  normal  0.0318296 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4397  ABC transporter related protein  40.41 
 
 
623 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0655491  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0869  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like protein  42.97 
 
 
343 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0418  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.39 
 
 
339 aa  170  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.755562  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4105  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  41.46 
 
 
347 aa  170  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1819  ATPase components of various ABC-type transport systems contain duplicated ATPase  39.74 
 
 
593 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0376212  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0248  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.34 
 
 
443 aa  169  4e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0759  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 
353 aa  169  6e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1063  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.56 
 
 
339 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1615  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.84 
 
 
353 aa  168  7e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.79 
 
 
347 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.61652  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0320  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.65 
 
 
322 aa  167  1e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.173398 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2988  peptide ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
336 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.534578  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2601  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40 
 
 
336 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1226  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.74 
 
 
357 aa  166  5e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1303  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
347 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.92932  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1341  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
347 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000765858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1237  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
347 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.180341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1092  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.65 
 
 
347 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00314713  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1264  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
347 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1104  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  40.65 
 
 
347 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1086  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  40.65 
 
 
347 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1194  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  40.65 
 
 
347 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.118138  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4339  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.32 
 
 
708 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.108178  normal  0.933802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>