147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2232 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  100 
 
 		 400 aa  799    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  58.33 
 
 		 397 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  53.23 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  58.77 
 
 		 421 aa  420  1e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  59.54 
 
 		 418 aa  417  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  48.7 
 
 		 382 aa  340  2e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  49.86 
 
 		 402 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  49.56 
 
 		 383 aa  328  8e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  47.33 
 
 		 410 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  48.09 
 
 		 410 aa  326  6e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  47.33 
 
 		 374 aa  325  7e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  47.54 
 
 		 410 aa  324  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  46.09 
 
 		 386 aa  324  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  47.41 
 
 		 393 aa  322  7e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  47.27 
 
 		 409 aa  322  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  45.5 
 
 		 374 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  49.85 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  49.85 
 
 		 392 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  49.57 
 
 		 383 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  48.1 
 
 		 386 aa  320  3e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  46.88 
 
 		 425 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  46.88 
 
 		 425 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  46.88 
 
 		 425 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  46.88 
 
 		 425 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  45 
 
 		 374 aa  319  5e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  48.67 
 
 		 385 aa  319  7e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  48.29 
 
 		 382 aa  318  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  48.75 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  48.29 
 
 		 372 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  46.88 
 
 		 433 aa  317  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  43.98 
 
 		 410 aa  317  2e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  48.47 
 
 		 403 aa  315  9e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  47.81 
 
 		 410 aa  312  4.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  46.09 
 
 		 374 aa  312  6.999999999999999e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  47.06 
 
 		 410 aa  311  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  47.52 
 
 		 375 aa  310  2e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  46.06 
 
 		 376 aa  306  4.0000000000000004e-82  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  44.44 
 
 		 384 aa  302  7.000000000000001e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  43.61 
 
 		 380 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  44.44 
 
 		 380 aa  297  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  38.56 
 
 		 386 aa  295  7e-79  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  39.3 
 
 		 398 aa  270  4e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  42.42 
 
 		 475 aa  270  4e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3470  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  46.2 
 
 		 397 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.348474  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  38.98 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  47.49 
 
 		 341 aa  264  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  41.71 
 
 		 412 aa  261  2e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  47.79 
 
 		 341 aa  255  8e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  47.49 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  45.22 
 
 		 352 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37.64 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3902  MltA domain-containing protein  40.05 
 
 		 431 aa  252  1e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0352522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  40.19 
 
 		 398 aa  248  1e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  39.46 
 
 		 405 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  39.73 
 
 		 543 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0520  3D domain protein  35.22 
 
 		 534 aa  244  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  40.58 
 
 		 416 aa  241  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  43.39 
 
 		 338 aa  238  1e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  40.32 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  38.72 
 
 		 500 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  41.71 
 
 		 402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  38.97 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.27 
 
 		 502 aa  233  3e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  47.08 
 
 		 440 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  44.18 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  41.71 
 
 		 380 aa  234  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0365  MltA  38.8 
 
 		 456 aa  230  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  46.76 
 
 		 514 aa  230  4e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0843  MltA domain-containing protein  38.82 
 
 		 416 aa  229  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  39.17 
 
 		 542 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4651  MltA domain-containing protein  39.71 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5152  MltA domain protein  38.15 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  41.48 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4651  MltA  40.29 
 
 		 422 aa  223  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.139284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3893  MltA domain-containing protein  38.86 
 
 		 414 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.304798 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  42.94 
 
 		 407 aa  219  7e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  38.21 
 
 		 368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.5 
 
 		 506 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  40.44 
 
 		 413 aa  214  2.9999999999999995e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  39.95 
 
 		 492 aa  212  9e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  45.99 
 
 		 405 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  40.32 
 
 		 372 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  40.4 
 
 		 372 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  40.83 
 
 		 497 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  43.14 
 
 		 399 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  44.2 
 
 		 395 aa  206  8e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  38.73 
 
 		 382 aa  205  9e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  45.32 
 
 		 401 aa  203  5e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  37.15 
 
 		 362 aa  203  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  36.87 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  45.52 
 
 		 381 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  39.62 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  42.75 
 
 		 395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  38.29 
 
 		 354 aa  197  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  43.22 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.94 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2733  transglycosylase, putative  41.22 
 
 		 412 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.927679  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0139  MltA domain-containing protein  34.73 
 
 		 400 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  42.59 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  38.81 
 
 		 372 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>