More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2224 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2224  anthranilate synthase component II  100 
 
 
189 aa  390  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.626919 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2468  anthranilate synthase component II  81.28 
 
 
188 aa  330  1e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1028  anthranilate synthase component II  76.76 
 
 
195 aa  308  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3477  anthranilate synthase component II  76.34 
 
 
190 aa  306  1.0000000000000001e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.760643  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3024  anthranilate synthase component II  71.96 
 
 
205 aa  301  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00296432  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3179  anthranilate synthase component II  71.96 
 
 
189 aa  300  1e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2564  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  74.19 
 
 
189 aa  298  3e-80  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2882  anthranilate synthase component II  72.04 
 
 
189 aa  297  6e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.521517 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0267  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase or para-aminobenzoate synthase  71.73 
 
 
197 aa  295  3e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0432226  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0790  anthranilate synthase component II  73.82 
 
 
201 aa  294  6e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0532  anthranilate synthase component II  72.49 
 
 
196 aa  292  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.169927  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3576  anthranilate synthase component II  72.49 
 
 
196 aa  292  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.455371  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1911  anthranilate synthase component II  72.49 
 
 
196 aa  292  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0941  anthranilate synthase component II  72.49 
 
 
196 aa  292  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0645  anthranilate synthase component II  72.49 
 
 
196 aa  292  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3584  anthranilate synthase component II  72.49 
 
 
196 aa  292  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0358  anthranilate synthase component II  71.74 
 
 
190 aa  291  3e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1061  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  72.63 
 
 
192 aa  291  4e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.124191 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3124  anthranilate synthase component II  70.43 
 
 
189 aa  291  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.680889 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2759  anthranilate synthase component II  71.51 
 
 
189 aa  290  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.397265  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2699  anthranilate synthase component II  70.37 
 
 
195 aa  290  9e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2910  anthranilate synthase component II  72.49 
 
 
196 aa  290  9e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3557  anthranilate synthase component II  71.96 
 
 
196 aa  289  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.312746  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0368  anthranilate synthase component II  71.2 
 
 
190 aa  289  1e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3620  anthranilate synthase component II  72.58 
 
 
196 aa  288  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08340  anthranilate synthase component II  72.25 
 
 
201 aa  289  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000176766 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2801  anthranilate synthase component II  70.9 
 
 
202 aa  288  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0147  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  71.51 
 
 
188 aa  288  3e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2845  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  70.05 
 
 
190 aa  287  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.101069  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3244  para-aminobenzoate synthase glutamine amidotransferase component II  70.05 
 
 
190 aa  287  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.349554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2572  anthranilate synthase component II  71.96 
 
 
199 aa  287  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0505  anthranilate synthase component II  71.96 
 
 
199 aa  287  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.624854 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0533  anthranilate synthase component II  71.96 
 
 
199 aa  287  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0460  anthranilate synthase component II  70.37 
 
 
200 aa  287  7e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0583  anthranilate synthase component II  72.43 
 
 
190 aa  287  8e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4455  anthranilate synthase component II  71.89 
 
 
190 aa  286  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0462  anthranilate synthase component II  71.43 
 
 
199 aa  286  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.431343 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2543  anthranilate synthase component II  71.43 
 
 
195 aa  286  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.362783  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0438  anthranilate synthase component II  71.43 
 
 
199 aa  286  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3497  anthranilate synthase component II  69.84 
 
 
200 aa  286  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.317495  hitchhiker  0.000454644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4581  anthranilate synthase component II  70.68 
 
 
199 aa  285  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.0000000148168  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4783  anthranilate synthase component II  70.47 
 
 
197 aa  285  2e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.576947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0450  anthranilate synthase component II  69.95 
 
 
197 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.401641 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0161  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  70.43 
 
 
188 aa  284  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.708014  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3652  anthranilate synthase component II  70.9 
 
 
194 aa  284  5.999999999999999e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3946  anthranilate synthase component II  70.47 
 
 
198 aa  284  7e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0731  anthranilate synthase component II  72.43 
 
 
188 aa  283  8e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2861  anthranilate synthase component II  72.04 
 
 
195 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4583  para-aminobenzoate synthase component II  68.95 
 
 
191 aa  283  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0420  anthranilate synthase component II  69.43 
 
 
197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0538249  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0453  anthranilate synthase component II  69.43 
 
 
197 aa  282  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.259992 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0752  anthranilate synthase, component II  68.59 
 
 
192 aa  282  2.0000000000000002e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.425073 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5115  anthranilate synthase component II  69.43 
 
 
197 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2249  anthranilate synthase, component II  69.79 
 
 
192 aa  282  3.0000000000000004e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.814755  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0592  anthranilate synthase, component II  69.63 
 
 
199 aa  280  9e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.747776  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2382  anthranilate synthase component II  70.37 
 
 
190 aa  280  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.655324  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2496  anthranilate synthase component II  68.78 
 
 
189 aa  280  1e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0301629  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1732  anthranilate synthase component II  68.78 
 
 
191 aa  279  1e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3518  anthranilate synthase component II  66.49 
 
 
192 aa  279  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.934173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2585  anthranilate synthase component II  69.84 
 
 
195 aa  278  3e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1211  anthranilate synthase component II  69.68 
 
 
190 aa  278  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.903358  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2196  para-aminobenzoate synthase component II  67.36 
 
 
193 aa  276  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3605  anthranilate synthase component II  68.25 
 
 
208 aa  276  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.240756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2261  anthranilate synthase component II  68.25 
 
 
189 aa  276  1e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1955  anthranilate synthase component II  68.78 
 
 
189 aa  276  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5239  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  62.9 
 
 
195 aa  276  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294206 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1341  anthranilate synthase, component II  69.73 
 
 
204 aa  275  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.211873  normal  0.788179 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46130  anthranilate synthase component II  67.54 
 
 
197 aa  275  3e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0067  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  65.59 
 
 
192 aa  275  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0526  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  67.89 
 
 
202 aa  275  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2155  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  66.31 
 
 
188 aa  274  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.64084  hitchhiker  0.0020762 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  61.83 
 
 
195 aa  274  7e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0284  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  65.61 
 
 
191 aa  273  1.0000000000000001e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0907  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  66.67 
 
 
201 aa  273  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000149415  hitchhiker  0.00000000332325 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0081  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  60.75 
 
 
195 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2495  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  67.36 
 
 
193 aa  271  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0786321  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3878  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  69.35 
 
 
188 aa  271  3e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2081  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  64.95 
 
 
197 aa  271  4.0000000000000004e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0077  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  61.29 
 
 
195 aa  271  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.480837  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0068  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  60.22 
 
 
195 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  60.22 
 
 
195 aa  271  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0070  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  62.43 
 
 
192 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  61.29 
 
 
195 aa  271  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1581  anthranilate synthase component II  67.2 
 
 
191 aa  271  6e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0078  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  60.22 
 
 
195 aa  270  9e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000982059 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0244  para-aminobenzoate synthase component II  65.26 
 
 
191 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0673282  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3705  para-aminobenzoate synthase component II  65.26 
 
 
191 aa  270  1e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0575  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  69.63 
 
 
194 aa  270  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.539767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3948  para-aminobenzoate synthase component II  65.26 
 
 
191 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0768  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  69.31 
 
 
195 aa  269  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.474408  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2729  para-aminobenzoate synthase component II  64.92 
 
 
192 aa  268  2.9999999999999997e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  60.75 
 
 
195 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0065  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  60.75 
 
 
195 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0069  para-aminobenzoate/anthranilate synthase glutamine amidotransferase component II  60.75 
 
 
195 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1121  anthranilate synthase, component II  65.59 
 
 
187 aa  268  4e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0241501  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2361  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  66.49 
 
 
197 aa  267  5.9999999999999995e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.853565  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3462  anthranilate synthase, component II  68.25 
 
 
189 aa  267  5.9999999999999995e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.772396  normal  0.100457 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1454  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  64.71 
 
 
188 aa  266  2e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4034  para-aminobenzoate synthase component II  63.68 
 
 
238 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.217778  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0597  glutamine amidotransferase of anthranilate synthase  67.2 
 
 
199 aa  264  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>