115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2185 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2185  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  598  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000288489 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0135  peptidase U32  59.53 
 
 		 302 aa  358  7e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.903367  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3221  peptidase U32  58.11 
 
 		 300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2574  peptidase U32  58.11 
 
 		 300 aa  339  2.9999999999999998e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1805  U32 family peptidase  59.04 
 
 		 295 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0624  hypothetical protein  58.31 
 
 		 295 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.380014  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2388  hypothetical protein  58.31 
 
 		 295 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2899  hypothetical protein  58.31 
 
 		 295 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.315007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1703  hypothetical protein  58.31 
 
 		 295 aa  331  7.000000000000001e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.802439  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2813  U32 family peptidase  58.7 
 
 		 295 aa  331  8e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2691  hypothetical protein  58.7 
 
 		 295 aa  331  8e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2748  hypothetical protein  58.36 
 
 		 295 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0716  peptidase U32  58.5 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0108  peptidase U32  52.07 
 
 		 300 aa  308  5e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3586  peptidase U32  53.26 
 
 		 294 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.838786  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4663  peptidase U32  53.26 
 
 		 294 aa  288  9e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02300  hypothetical protein  52.67 
 
 		 294 aa  287  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.655444 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2112  peptidase U32  52.38 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.315239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1788  peptidase U32  51.7 
 
 		 294 aa  277  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.175461  normal  0.636013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3097  peptidase U32  45.73 
 
 		 297 aa  275  9e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0892981  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5059  peptidase U32  51.54 
 
 		 304 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.091087  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2344  peptidase U32  47.77 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.993055  hitchhiker  0.000182916 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2722  peptidase, U32 family  47.77 
 
 		 292 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0428229  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2135  peptidase U32  48.99 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.449129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13300  hypothetical protein  48.98 
 
 		 296 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.480197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0604  putative peptidase  43.54 
 
 		 292 aa  258  9e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.71179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1196  hypothetical protein  48.98 
 
 		 296 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4939  peptidase U32  49.67 
 
 		 306 aa  256  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.443584 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1033  peptidase U32  45.21 
 
 		 300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.350899  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1471  peptidase U32  45.13 
 
 		 317 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.134915 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002617  putative protease  42.71 
 
 		 296 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.883659  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2132  hypothetical protein  44.26 
 
 		 293 aa  245  8e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2788  peptidase U32  45.17 
 
 		 281 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03389  hypothetical protein  43.39 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03868  putative protease  43.54 
 
 		 297 aa  241  9e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0593  peptidase U32  44.07 
 
 		 292 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1038  peptidase U32  40.83 
 
 		 289 aa  237  1e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0817  peptidase U32  43.29 
 
 		 292 aa  237  1e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.137275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0182  hypothetical protein  41.16 
 
 		 292 aa  235  7e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1060  peptidase U32  43.49 
 
 		 289 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3457  peptidase U32  44.75 
 
 		 292 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.38168  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03026  predicted protease  43.39 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0546  peptidase U32  43.39 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02977  hypothetical protein  43.39 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1248  peptidase  43.84 
 
 		 289 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3351  U32 family peptidase  43.39 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3716  peptidase U32  43.05 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0539  peptidase U32  43.39 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.195699 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3455  U32 family peptidase  43.39 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3613  peptidase, U32 family  43.39 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4478  peptidase, U32 family  43.39 
 
 		 292 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3641  U32 family peptidase  43.05 
 
 		 292 aa  233  3e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3583  U32 family peptidase  43.05 
 
 		 292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4009  U32 family peptidase  43.05 
 
 		 292 aa  233  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1132  peptidase U32  43.15 
 
 		 289 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0299652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3533  peptidase, U32 family  44.3 
 
 		 292 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3630  peptidase, U32 family  44.41 
 
 		 292 aa  232  7.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2806  peptidase U32  43.6 
 
 		 291 aa  231  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1013  peptidase U32  40.72 
 
 		 313 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3570  peptidase, U32 family  44.3 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3462  peptidase, U32 family  44.3 
 
 		 292 aa  230  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3464  peptidase, U32 family  44.75 
 
 		 292 aa  230  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3596  peptidase U32  43.39 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0503  peptidase U32  43.39 
 
 		 292 aa  229  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3020  peptidase U32  41.72 
 
 		 285 aa  229  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3338  peptidase U32  43.39 
 
 		 292 aa  228  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1064  peptidase U32  41.78 
 
 		 305 aa  225  7e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3351  peptidase U32  40.96 
 
 		 286 aa  224  1e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1170  peptidase U32  42.76 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3341  peptidase U32  42.47 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3517  peptidase U32  38.91 
 
 		 286 aa  222  6e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3197  peptidase U32  42.09 
 
 		 297 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3203  peptidase U32  41.44 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0997  peptidase U32  41.58 
 
 		 278 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0827  peptidase U32  38.33 
 
 		 309 aa  205  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0163501  normal  0.325471 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3006  peptidase U32  43.39 
 
 		 302 aa  192  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.154697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2402  peptidase U32  40.07 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2524  peptidase U32  39.06 
 
 		 300 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4297  peptidase U32  39.25 
 
 		 299 aa  179  7e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4229  peptidase U32  42.09 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3476  peptidase U32  38.1 
 
 		 299 aa  175  6e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.627959  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3115  peptidase U32  37.87 
 
 		 306 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2385  peptidase U32  40.4 
 
 		 298 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0265  putative protease  38.01 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.600402  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0289  protease, putative  37.67 
 
 		 310 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4475  peptidase U32  36.58 
 
 		 306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4325  peptidase U32  36.12 
 
 		 306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4778  peptidase U32  34.12 
 
 		 306 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2116  peptidase U32  39.4 
 
 		 298 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0464  putative protease  39.4 
 
 		 298 aa  156  4e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.852312  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1004  peptidase U32  33.56 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1511  peptidase family protein U32  25.88 
 
 		 886 aa  62.8  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3702  protease  25.19 
 
 		 878 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.204118  normal  0.320272 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3347  U32 family peptidase  24.88 
 
 		 790 aa  49.3  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2286  peptidase U32  23.46 
 
 		 716 aa  48.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2047  peptidase U32  22.6 
 
 		 783 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0943  peptidase U32  24.4 
 
 		 411 aa  47  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.600634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1107  peptidase U32  27.94 
 
 		 836 aa  46.6  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0104488  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0735  peptidase U32  21.49 
 
 		 408 aa  46.2  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0327554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23520  collagenase-like protease  26.84 
 
 		 442 aa  45.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000439045 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>