79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2158 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2158  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  538  9.999999999999999e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.73728  normal  0.123639 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1634  hypothetical protein  73.06 
 
 		 251 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.525776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0146  hypothetical protein  69.32 
 
 		 251 aa  367  1e-101  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.865977  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0217  hypothetical protein  71.14 
 
 		 247 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0174  hypothetical protein  67.2 
 
 		 266 aa  354  8.999999999999999e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2878  hypothetical protein  68.72 
 
 		 251 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000157183  hitchhiker  0.00000000000184345 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16850  hypothetical protein  67.21 
 
 		 254 aa  338  5e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0460319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3686  protein of unknown function DUF82  66.8 
 
 		 253 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000683757  hitchhiker  0.000000000000406532 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3123  hypothetical protein  67.49 
 
 		 251 aa  330  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0157534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0270  hypothetical protein  65.85 
 
 		 251 aa  328  6e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.318554  hitchhiker  0.00000949427 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3863  hypothetical protein  62.95 
 
 		 251 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0031  hypothetical protein  62.95 
 
 		 251 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.885016  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3802  hypothetical protein  64.61 
 
 		 251 aa  320  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.142796  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3352  protein of unknown function DUF82  54.29 
 
 		 252 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.729294  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0209  hypothetical protein  53.57 
 
 		 246 aa  253  3e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.121486  unclonable  0.00000000000711775 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0233  hypothetical protein  52.99 
 
 		 255 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0265996  hitchhiker  0.00000000670922 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2800  hypothetical protein  53.94 
 
 		 259 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.349371  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0306  hypothetical protein  53.94 
 
 		 259 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00785467  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0225  hypothetical protein  53.72 
 
 		 268 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3405  hypothetical protein  53.94 
 
 		 254 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000396149  normal  0.418275 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3276  protein of unknown function DUF82  53.88 
 
 		 252 aa  237  1e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.31629  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1812  protein of unknown function DUF82  51.6 
 
 		 261 aa  226  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0867671  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3080  protein of unknown function DUF82  42.45 
 
 		 261 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.367373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0418  hypothetical protein  48.55 
 
 		 262 aa  212  4.9999999999999996e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10590  hypothetical protein  46.81 
 
 		 252 aa  211  7e-54  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  1.18585e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3040  protein of unknown function DUF82  42.04 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4229  protein of unknown function DUF82  45.63 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4339  protein of unknown function DUF82  45.63 
 
 		 258 aa  204  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.172322 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0281  protein of unknown function DUF82  42.08 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0147  hypothetical protein  41.56 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0149  hypothetical protein  41.56 
 
 		 247 aa  191  8e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0327  hypothetical protein  42.68 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.359144  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1988  protein of unknown function DUF82  42 
 
 		 254 aa  188  9e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.865468  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02617  hypothetical protein  42.86 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.77875 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0859  hypothetical protein  41.06 
 
 		 267 aa  177  2e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113509  normal  0.015676 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1285  hypothetical protein  39.82 
 
 		 244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1519  hypothetical protein  38.08 
 
 		 241 aa  155  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00627759  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2400  protein of unknown function DUF82  42.37 
 
 		 268 aa  154  1e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3958  protein of unknown function DUF82  36.89 
 
 		 243 aa  142  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1548  hypothetical protein  35.74 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_368  hypothetical protein  40.54 
 
 		 167 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0577491  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7452  protein of unknown function DUF82  35.02 
 
 		 262 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.753636 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0403  hypothetical protein  37.58 
 
 		 167 aa  110  3e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.393997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2002  protein of unknown function DUF82  35.19 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.724782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0100  protein of unknown function DUF82  37.8 
 
 		 235 aa  108  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.566034  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0341  protein of unknown function DUF82  35.85 
 
 		 158 aa  106  4e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00210637  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0758  hypothetical protein  35.44 
 
 		 161 aa  83.6  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0072  hypothetical protein  38.19 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0153972 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1471  hypothetical protein  31.52 
 
 		 164 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.863306  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1175  protein of unknown function DUF82  32.05 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1425  hypothetical protein  31.68 
 
 		 164 aa  80.1  0.00000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2621  hypothetical protein  34.42 
 
 		 152 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0155  hypothetical protein  31.76 
 
 		 166 aa  72  0.000000000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.292503  normal  0.0192044 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0747  hypothetical protein  33.77 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1033  hypothetical protein  32.89 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1020  hypothetical protein  31.45 
 
 		 180 aa  68.6  0.0000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.134843 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0872  protein of unknown function DUF82  33.55 
 
 		 149 aa  67.4  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.340382  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0441  protein of unknown function DUF82  32.35 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.297493 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1691  hypothetical protein  35.17 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.000104629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1962  protein of unknown function DUF82  32 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00000351454  decreased coverage  0.00501017 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1135  protein of unknown function DUF82  30.06 
 
 		 164 aa  63.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.132995  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1591  hypothetical protein  34.39 
 
 		 162 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2635  protein of unknown function DUF82  32.45 
 
 		 158 aa  61.6  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2987  protein of unknown function DUF82  31.76 
 
 		 153 aa  57.4  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3160  hypothetical protein  37.11 
 
 		 176 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.462387  normal  0.20944 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1053  hypothetical protein  30.99 
 
 		 145 aa  53.5  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.171553 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1779  hypothetical protein  27.27 
 
 		 162 aa  52  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000347212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2503  thiamineS protein  36.54 
 
 		 79 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00377976  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0508  hypothetical protein  29.71 
 
 		 136 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0988512 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1167  hypothetical protein  33.08 
 
 		 126 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1707  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.91 
 
 		 74 aa  47  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2286  thiamineS protein  37.14 
 
 		 77 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0278  thiamineS protein  39.44 
 
 		 82 aa  44.3  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0219  protein of unknown function DUF82  41.43 
 
 		 167 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.375339  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0051  thiamineS protein  34.21 
 
 		 84 aa  43.1  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0952955 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1819  thiamineS protein  33.33 
 
 		 84 aa  43.1  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00304735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1283  hypothetical protein  40.74 
 
 		 93 aa  42.7  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.107465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2848  thiamineS  28.95 
 
 		 84 aa  42  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.221435  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1955  thiamineS protein  33.78 
 
 		 75 aa  42  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>