250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2149 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2149  putative lipase  100 
 
 		 203 aa  398  9.999999999999999e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208079 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1745  GDSL family lipase  49.46 
 
 		 242 aa  180  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0864047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1302  lipolytic protein G-D-S-L family  52.49 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0430  acyl-CoA thioesterase I  47.62 
 
 		 189 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000157795  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0043  GDSL family lipase  46.74 
 
 		 202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000938694  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1154  lipolytic protein  41 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2630  lipolytic enzyme, G-D-S-L  39.39 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0895129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0825  lipolytic protein G-D-S-L family  42.11 
 
 		 216 aa  141  6e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000789426  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3205  GDSL family lipase  42.44 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0765552  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0488  GDSL family lipase  45.11 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.307636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3734  GDSL family lipase  40.49 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00414819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0057  lipolytic protein G-D-S-L family  43.78 
 
 		 212 aa  134  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3558  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.42 
 
 		 201 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0285978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2112  lipolytic protein G-D-S-L family  42.53 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.835545 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2989  GDSL family lipase  38.07 
 
 		 203 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.816827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0394  GDSL family lipase  37.89 
 
 		 204 aa  115  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00216683  hitchhiker  0.0000338179 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1526  GDSL family lipase  36.31 
 
 		 206 aa  105  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0224358  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3116  Lysophospholipase  35.63 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  35.63 
 
 		 197 aa  101  8e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000102702 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00445  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  35.63 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0543  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  35.88 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0574  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  35.88 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00450  hypothetical protein  35.63 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0533  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  35.88 
 
 		 218 aa  100  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0598  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  35.63 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.79584 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0429  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  35.88 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1122  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  35.03 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0118083  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0556  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  34.12 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0968  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  35.29 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0615  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  34.12 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.382556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0571  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  34.12 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0554  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  34.12 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3193  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  35.59 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.194164  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0561  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  34.12 
 
 		 204 aa  99  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.868884  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1054  Lysophospholipase  35.03 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3005  Lysophospholipase  35.8 
 
 		 182 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.890244  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2068  arylesterase  33.14 
 
 		 217 aa  93.6  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.756828  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1942  GDSL family lipase  41.32 
 
 		 222 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3159  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.52 
 
 		 190 aa  91.3  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.681628  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1271  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.52 
 
 		 216 aa  91.3  9e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.934354  normal  0.745866 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3021  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  33.52 
 
 		 211 aa  90.9  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.116917  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2620  arylesterase  34.1 
 
 		 194 aa  90.5  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.403084  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1919  GDSL family lipase  42.28 
 
 		 222 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1863  Lysophospholipase  37.27 
 
 		 205 aa  89.4  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017765 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2311  acyl-CoA thioesterase I  34.91 
 
 		 226 aa  89.4  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328666  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1157  multifunctional acyl-CoA thioesterase I and protease I and lysophospholipase L1  31.07 
 
 		 196 aa  89  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.987019  hitchhiker  0.000093812 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0285  arylesterase precursor  32.76 
 
 		 206 aa  89  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.751719  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0724  arylesterase  35.39 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000311622  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1530  Lysophospholipase  37.27 
 
 		 202 aa  88.2  8e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.177051 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0938  arylesterase  30.39 
 
 		 219 aa  87.8  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.279693  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4014  lipolytic protein  34.81 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000555437  normal  0.540801 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5220  lipolytic protein  41.61 
 
 		 224 aa  86.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.698487  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4035  arylesterase  34.94 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926755 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1451  acyl-CoA thioesterase I  34.32 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0796987  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2468  acyl-CoA thioesterase I  34.32 
 
 		 232 aa  86.3  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1355  GDSL family lipase  34.5 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.260429  normal  0.647908 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1944  acyl-CoA thioesterase, putative  34.32 
 
 		 210 aa  85.9  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3360  acyl-CoA thioesterase I  34.32 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.323811  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1219  acyl-CoA thioesterase, putative  34.32 
 
 		 226 aa  86.3  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2349  acyl-CoA thioesterase I  34.32 
 
 		 226 aa  85.9  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342974  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6160  lipolytic enzyme, G-D-S-L  40.88 
 
 		 184 aa  85.1  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3020  GDSL family lipase  41.74 
 
 		 221 aa  85.1  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242695 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2959  arylesterase  31.32 
 
 		 202 aa  84.7  8e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0714479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1815  acyl-CoA thioesterase I precursor  41.38 
 
 		 216 aa  84.7  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1384  arylesterase  34.38 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.015235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2130  acyl-CoA thioesterase I  33.73 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0925332  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1603  lipolytic protein G-D-S-L family  43.9 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2368  arylesterase  32.18 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2111  lipolytic protein G-D-S-L family  37.14 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2271  GDSL family lipase  43.9 
 
 		 215 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.806059  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1717  esterase signal peptide protein  36.02 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.122714 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2107  lipolytic protein G-D-S-L family  35.55 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1881  lipolytic protein  31.44 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0651  Lysophospholipase  31.93 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.623159  normal  0.969568 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2392  arylesterase  30.64 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000677217  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000168  arylesterase precursor  36.52 
 
 		 200 aa  82  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.943584  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1907  arylesterase  38.97 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0973047  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0413  putative acyl-CoA thioesterase precursor  37.36 
 
 		 240 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1837  lysophospholipase  38.97 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.761054  normal  0.074561 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1044  arylesterase  31.95 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2409  arylesterase  34.78 
 
 		 204 aa  81.3  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00170275 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2688  arylesterase  31.21 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2785  arylesterase  31.21 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.761375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1678  Arylesterase  31.21 
 
 		 185 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.740826  normal  0.0814833 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2268  acyl-CoA thioesterase I  35.4 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00244622  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2914  arylesterase  32.74 
 
 		 212 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1920  arylesterase  36.08 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000320229  hitchhiker  0.00000000000011785 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2709  arylesterase  31.21 
 
 		 216 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1485  arylesterase  31.84 
 
 		 195 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1660  arylesterase  28.32 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2928  acyl-CoA thioesterase I, putative  31.21 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3451  arylesterase  36.94 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0041909  hitchhiker  0.0000215675 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2558  lysophospholipase  37.5 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000043201  hitchhiker  0.000000000000180449 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2116  Arylesterase  34.98 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0549  arylesterase  28.57 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.65296  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1478  arylesterase  31.21 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1543  arylesterase  31.21 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0357414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1537  GDSL family lipase  31.21 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131898 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1278  GDSL family lipase  35.29 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.398687  normal  0.0389661 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1760  arylesterase  37.5 
 
 		 201 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00951163  hitchhiker  0.000000000100136 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>