23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2069 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2069  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  532  1e-150  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3448  hypothetical protein  57.07 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2326  hypothetical protein  56.06 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.16205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0930  hypothetical protein  34.78 
 
 		 296 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000114693 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1906  GP60  35.79 
 
 		 339 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000000738533  normal  0.0210495 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01960  hypothetical protein  31.06 
 
 		 318 aa  65.1  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4111  hypothetical protein  34.65 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000120566 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0794  hypothetical protein  41.54 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000436094 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1672  gp60  33.08 
 
 		 311 aa  52.8  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0382632  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2872  hypothetical protein  27.96 
 
 		 314 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.802618  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1033  gp60  33.08 
 
 		 311 aa  52.8  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4446  phage O protein family  25 
 
 		 313 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0401993  unclonable  0.00000000141211 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3439  putative transcriptional regulator  29.77 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119584  unclonable  9.09525e-17 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3117  hypothetical protein  32.23 
 
 		 197 aa  48.9  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0292  putative replication protein O  29.13 
 
 		 299 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3263  hypothetical protein  30.11 
 
 		 294 aa  45.8  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.102407  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0743  putative replication protein  31.82 
 
 		 249 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0773  hypothetical protein  31.82 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104231 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1139  replication protein  29.41 
 
 		 326 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00398063  hitchhiker  2.1893400000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3612  putative replication protein  31.82 
 
 		 249 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000425732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0770  hypothetical protein  35.29 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0218266  normal  0.283783 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3490  hypothetical protein  23.53 
 
 		 278 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0314566  unclonable  0.00000747295 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1975  hypothetical protein  23.53 
 
 		 278 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00555051  normal  0.0479802 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>