153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2046 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2046  hypothetical protein  100 
 
 		 207 aa  417  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0174425  normal  0.659871 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1769  putative protein-disulfide isomerase  49.51 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0763119  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0725  DSBA oxidoreductase  50.51 
 
 		 221 aa  182  3e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.246686  normal  0.929424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4089  hypothetical protein  49.74 
 
 		 211 aa  181  7e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0795  DSBA oxidoreductase  48.48 
 
 		 221 aa  174  6e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  0.0910349 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0778  hypothetical protein  50 
 
 		 221 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.544779  normal  0.0154482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53160  hypothetical protein  51.65 
 
 		 200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3102  protein-disulfide isomerase-like protein  46.15 
 
 		 221 aa  162  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.967383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4660  hypothetical protein  50 
 
 		 212 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1735  hypothetical protein  49.48 
 
 		 210 aa  157  8e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.824558  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1366  DSBA oxidoreductase  43.72 
 
 		 210 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.28938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3657  DSBA oxidoreductase  47.15 
 
 		 210 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.381267 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3955  DSBA oxidoreductase  45.88 
 
 		 210 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0174672 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2712  dithiol-disulfide isomerase  37.75 
 
 		 223 aa  147  9e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1350  DSBA oxidoreductase  46.39 
 
 		 210 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1694  DSBA oxidoreductase  46.11 
 
 		 210 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.274727 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34850  DSBA oxidoreductase  45.7 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1759  DSBA oxidoreductase  45.99 
 
 		 199 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1051  hypothetical protein  35.53 
 
 		 242 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0212434  normal  0.0155406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0606  putative protein-disulfide isomerase  35.53 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.872062  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6828  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold protein  39.6 
 
 		 210 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.391464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1688  conserved hypothetical protein, thioredoxin-like fold  35.78 
 
 		 210 aa  121  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.746509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2620  thioredoxin domain-containing protein  39.5 
 
 		 259 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0545  hypothetical protein  34.9 
 
 		 200 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6744  thioredoxin-like fold  35.78 
 
 		 214 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0075  hypothetical protein  29.27 
 
 		 206 aa  112  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22500  protein-disulfide isomerase  34.76 
 
 		 244 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000773657  hitchhiker  0.0000178225 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3640  protein-disulfide isomerase  31.22 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1753  hypothetical protein  40.64 
 
 		 245 aa  105  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.93705  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0530  hypothetical protein  29.19 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000790995  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0459  hypothetical protein  32.42 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0058  hypothetical protein  38.65 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1413  hypothetical protein  28.8 
 
 		 209 aa  95.1  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0401797  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002936  thioredoxin  27.68 
 
 		 209 aa  92.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000472775  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1385  hypothetical protein  38.62 
 
 		 231 aa  92.4  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147376  normal  0.897973 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2644  hypothetical protein  28.49 
 
 		 209 aa  91.7  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.25227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1321  hypothetical protein  38.62 
 
 		 231 aa  90.1  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0445299  normal  0.563378 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3663  hypothetical protein  37.1 
 
 		 256 aa  89.4  4e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0807483  normal  0.175109 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02994  protein-disulfide isomerase  28.14 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1053  hypothetical protein  34.78 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3568  hypothetical protein  27.81 
 
 		 213 aa  85.9  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.149179  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0294  hypothetical protein  32.99 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00700  hypothetical protein  37.69 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1753  hypothetical protein  28.9 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.731876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4446  hypothetical protein  29.13 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0048258 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3841  hypothetical protein  35.08 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.782723 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1963  DSBA oxidoreductase  26.23 
 
 		 207 aa  81.6  0.000000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00619259  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2250  hypothetical protein  32.29 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.72314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2391  dithiol-disulfide isomerase  25.38 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.20777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3039  putative protein-disulfide isomerase  30.85 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1444  hypothetical protein  34.92 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5479  thioredoxin  23.98 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2043  thioredoxin  25.62 
 
 		 208 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2523  DSBA oxidoreductase  26.52 
 
 		 300 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0950  thioredoxin  24.49 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1351  protein-disulfide isomerase-like protein  33.16 
 
 		 217 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.485662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2351  hypothetical protein  29.69 
 
 		 214 aa  76.3  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1273  DSBA oxidoreductase  28.22 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4381  thioredoxin  23.98 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.583730000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0336  hypothetical protein  32.24 
 
 		 209 aa  75.1  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.483638  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4159  polyketide biosynthesis dithiol-disulfide isomerase-like protein  23.56 
 
 		 328 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5215  hypothetical protein  26.52 
 
 		 336 aa  73.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00274094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0966  hypothetical protein  32.26 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3255  hypothetical protein  32.26 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0101602  hitchhiker  0.0000000123908 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1019  hypothetical protein  32.26 
 
 		 211 aa  71.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000937  hypothetical protein  30.34 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.043372  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0279  protein-disulfide isomerase  23.47 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000930867  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3166  putative protein-disulfide isomerase  31.49 
 
 		 230 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.343946  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1805  thioredoxin  28.22 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.379307  normal  0.533532 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3165  putative protein-disulfide isomerase  32.04 
 
 		 230 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1656  DSBA oxidoreductase  25.12 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000319257  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1561  DSBA oxidoreductase  24.62 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000756973  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1205  putative protein-disulfide isomerase  31.49 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.090867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3309  putative protein-disulfide isomerase  30.94 
 
 		 230 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0312483 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2050  DSBA oxidoreductase  22.82 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3629  hypothetical protein  30.65 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0770  hypothetical protein  24.06 
 
 		 297 aa  58.2  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0485  DSBA oxidoreductase  24.86 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1089  putative protein-disulfide isomerase  29.32 
 
 		 217 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2784  putative protein-disulfide isomerase  29.44 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0238093  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1625  hypothetical protein  24.75 
 
 		 297 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3475  hypothetical protein  29.53 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1475  DSBA oxidoreductase  32.63 
 
 		 220 aa  56.6  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1542  DSBA-like thioredoxin domain-containing protein  30 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2293  hypothetical protein  33.07 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.472167 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1372  hypothetical protein  29 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0623516  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3785  DSBA oxidoreductase  25.98 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400426  normal  0.0244722 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2460  protein-disulfide isomerase  29 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0358  hypothetical protein  29 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.496177  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1267  hypothetical protein  29 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.42251  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1193  hypothetical protein  29 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0935  hypothetical protein  29 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6424  DSBA oxidoreductase  26.7 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.450496 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0094  DSBA oxidoreductase  27.23 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3237  DSBA oxidoreductase  26.6 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  26.29 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8729  putative DsbA-like thioredoxin protein  31.16 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0636  hypothetical protein  29 
 
 		 249 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3490  hypothetical protein  28.96 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.320877  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7778  DSBA oxidoreductase  26.64 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>