More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2036 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  100 
 
 		 155 aa  300  6.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  44 
 
 		 155 aa  117  7.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2829  UspA domain protein  46.71 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0510043  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4869  UspA domain protein  39.61 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0991837 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3792  UspA domain protein  39.61 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1760  hypothetical protein  38.93 
 
 		 148 aa  102  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5567  UspA domain protein  41.89 
 
 		 152 aa  101  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4434  UspA domain protein  46 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4567  UspA domain protein  46 
 
 		 166 aa  101  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.233455  normal  0.128301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1859  putative universal stress protein  40.54 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3137  universal stress protein  42.38 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4451  universal stress protein UspA  40.27 
 
 		 161 aa  99.4  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.15852  normal  0.144884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2306  UspA domain-containing protein  40.82 
 
 		 155 aa  98.6  3e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3827  putative universal stress protein  39.86 
 
 		 187 aa  98.6  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  41.14 
 
 		 156 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3150  UspA domain-containing protein  41.72 
 
 		 155 aa  97.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5818  UspA domain-containing protein  43.15 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0832063 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4273  UspA domain protein  40.13 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.664066 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1853  universal stress protein  41.72 
 
 		 168 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.499137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0184  hypothetical protein  43.33 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.101223 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4485  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0607  putative universal stress-related protein  39.87 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.135512 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5738  UspA domain-containing protein  41.33 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.192477 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5121  hypothetical protein  41.33 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4434  UspA domain-containing protein  38.16 
 
 		 158 aa  95.9  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5296  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 		 158 aa  95.1  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0916  hypothetical protein  42.28 
 
 		 173 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02117  hypothetical protein  38.96 
 
 		 151 aa  94.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4283  UspA domain-containing protein  40.67 
 
 		 163 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6185  UspA domain-containing protein  40.76 
 
 		 157 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.552133  normal  0.212632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  42.86 
 
 		 154 aa  94  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3815  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 167 aa  94.4  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.911542  normal  0.55924 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1117  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 156 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.656052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6200  UspA domain-containing protein  40 
 
 		 163 aa  93.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.371788  normal  0.304824 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1334  hypothetical protein  40.82 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0586772  normal  0.952223 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2298  UspA domain-containing protein  42.28 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.178234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5381  UspA domain-containing protein  36.31 
 
 		 162 aa  92.8  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1213  hypothetical protein  42.28 
 
 		 151 aa  91.7  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.166995  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7012  UspA domain-containing protein  39.73 
 
 		 156 aa  91.3  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.305575  normal  0.800144 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0036  universal stress protein  40.54 
 
 		 155 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  38.71 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1677  hypothetical protein  38.1 
 
 		 146 aa  90.5  7e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.884231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3456  UspA domain-containing protein  38.06 
 
 		 164 aa  90.5  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0198744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1185  universal stress protein  39.86 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0032  universal stress protein  39.86 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0038  universal stress protein  39.86 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.283622  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1465  universal stress protein  39.86 
 
 		 155 aa  90.5  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0038  universal stress family protein  39.86 
 
 		 155 aa  90.1  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.98264  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1134  UspA domain-containing protein  38.78 
 
 		 167 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1164  hypothetical protein  39.74 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0442  universal stress protein  39.73 
 
 		 200 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1311  UspA domain protein  39.46 
 
 		 187 aa  88.6  3e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.519886  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0052  universal stress protein  39.86 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5580  UspA domain protein  37.91 
 
 		 168 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4395  universal stress protein UspA  35.57 
 
 		 164 aa  88.6  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.25513 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5552  UspA domain-containing protein  38.51 
 
 		 150 aa  87.4  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0358862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0904  hypothetical protein  35.37 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381712  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5916  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 157 aa  87  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585154  normal  0.579135 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6944  universal stress protein  38.1 
 
 		 157 aa  86.3  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00046035  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1761  hypothetical protein  38.93 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4745  hypothetical protein  37.67 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.829975  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3346  hypothetical protein  40 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0885774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5899  UspA domain-containing protein  39.74 
 
 		 167 aa  85.1  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.642554  normal  0.144749 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6388  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.686835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1197  hypothetical protein  39.22 
 
 		 151 aa  84.7  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7052  UspA domain-containing protein  38.1 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1440  hypothetical protein  38.1 
 
 		 159 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0170  universal stress protein  39.73 
 
 		 200 aa  84.3  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1315  universal stress protein  39.73 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0144  universal stress protein  39.73 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6467  UspA domain-containing protein  36.36 
 
 		 159 aa  84  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.276818 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2628  universal stress family protein  39.73 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1035  universal stress protein  39.73 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.883979  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2771  universal stress protein  39.73 
 
 		 156 aa  84  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.778243  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1504  hypothetical protein  35.76 
 
 		 151 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1268  universal stress protein  37.93 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5714  UspA domain-containing protein  35.06 
 
 		 159 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.445064 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4438  UspA domain protein  36.49 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4571  UspA domain protein  36.49 
 
 		 151 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0406402  normal  0.225072 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1925  UspA domain-containing protein  39.6 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1811  hypothetical protein  41.06 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21220  hypothetical protein  41.06 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1525  universal stress family protein  36.73 
 
 		 315 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0105  universal stress protein  36.73 
 
 		 319 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1610  universal stress family protein  36.73 
 
 		 315 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0898  UspA domain protein  37.93 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0751  universal stress family protein  37.93 
 
 		 141 aa  80.1  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  37.33 
 
 		 159 aa  77.8  0.00000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0179  hypothetical protein  35.81 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.096278 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  34.64 
 
 		 149 aa  77.8  0.00000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5869  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 		 148 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.135871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  39.04 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  35.57 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  39.19 
 
 		 290 aa  77  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1232  universal stress family protein  39.24 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.736212  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0707  universal stress protein  39.24 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.531837  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1570  UspA domain protein  33.56 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2430  universal stress protein  39.24 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1720  universal stress protein  39.24 
 
 		 164 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1272  UspA domain-containing protein  32.65 
 
 		 145 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>