More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2028 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_2028  high affinity sulfate transporter (SulP)  100 
 
 		 620 aa  1251    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2609  sulphate anion transporter  52.65 
 
 		 603 aa  608  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.107186  normal  0.766743 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0918  sulfate transporter  54.26 
 
 		 577 aa  597  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2193  sulfate transporter  51.12 
 
 		 608 aa  594  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0525305  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1638  sulfate transporter  49.57 
 
 		 626 aa  558  1e-157  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.25486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1102  high affinity sulfate transporter (SulP)  46.88 
 
 		 584 aa  497  1e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1188  sulphate transporter  43.03 
 
 		 603 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220567  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1296  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  43.2 
 
 		 599 aa  449  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  39.93 
 
 		 711 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4099  sulphate transporter  41.67 
 
 		 620 aa  392  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.54589 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0091  sulphate transporter  39.96 
 
 		 521 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.266405  hitchhiker  0.00000000110429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0024  sulphate transporter  40.98 
 
 		 522 aa  375  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0062  sulphate transporter  42.83 
 
 		 546 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  39.75 
 
 		 711 aa  359  9e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0075  sulphate transporter  39.4 
 
 		 521 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103886  hitchhiker  0.00048278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0094  sulphate transporter  39.74 
 
 		 521 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.317812  hitchhiker  0.000091476 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1995  sulphate transporter  35.68 
 
 		 573 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2017  sulfate transporter  37.54 
 
 		 730 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0026  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:sulphate transporter  38.66 
 
 		 522 aa  350  5e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0168  sulfate transporter family protein  37.92 
 
 		 522 aa  347  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0030  putative sulfate transporter  39.09 
 
 		 517 aa  343  5e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0442  sulphate transporter  41.85 
 
 		 584 aa  340  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2116  sulphate transporter  36.57 
 
 		 703 aa  335  1e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.242384 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2908  sulfate transporter  37.95 
 
 		 590 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00121599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0091  sulphate transporter  39.59 
 
 		 521 aa  327  3e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0425  sulfate transporter  38.62 
 
 		 601 aa  325  1e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00340  putative sulfate transporter  38.76 
 
 		 517 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0788781 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1967  sulfate transporter  37.06 
 
 		 588 aa  322  9.000000000000001e-87  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.651001  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1668  sulfate transporter  37.63 
 
 		 584 aa  322  9.999999999999999e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.933775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2081  sulphate transporter  34.48 
 
 		 729 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2117  sulphate transporter  34.94 
 
 		 703 aa  316  9e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.271394  normal  0.0391706 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0978  sulphate transporter  31.73 
 
 		 580 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000059535  normal  0.199384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0812  sulfate transporter  33.28 
 
 		 585 aa  302  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4885  sulphate transporter  42.07 
 
 		 698 aa  289  1e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1147  sulfate transporter  32.13 
 
 		 588 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00301297  hitchhiker  0.000165029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2574  sulfate transporter  34.31 
 
 		 591 aa  277  5e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.527803  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2515  putative sulfate transporter  32.52 
 
 		 578 aa  273  5.000000000000001e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0607396 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1183  sulfate transporter  32.76 
 
 		 585 aa  271  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500154  normal  0.430709 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3648  sulfate permease  30.23 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1611  sulfate permease  32.41 
 
 		 558 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0867  sulfate transporter  28.99 
 
 		 571 aa  259  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.146836 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0441  sulfate transporter  29.42 
 
 		 587 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0288663  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3218  sulfate transporter  29.04 
 
 		 574 aa  248  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0296  sulfate transporter  30.87 
 
 		 574 aa  246  6.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.757718  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1689  sulphate transporter  30.63 
 
 		 605 aa  244  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.786377 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0667  sulphate anion transporter  30.87 
 
 		 570 aa  244  5e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0679788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2348  sulfate transporter  30.9 
 
 		 572 aa  243  7.999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.21714 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1731  sulfate transporter  31.16 
 
 		 592 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294405  normal  0.138337 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46920  sulphate transporter  30.9 
 
 		 605 aa  238  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.326682  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1575  sulfate transporter  30.64 
 
 		 570 aa  238  3e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3404  sulfate permease family protein  27.84 
 
 		 587 aa  238  3e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0571  sulphate anion transporter  31.05 
 
 		 563 aa  237  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1643  sulphate transporter  27.15 
 
 		 583 aa  237  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1307  sulfate transporter  30.21 
 
 		 586 aa  237  6e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2846  sulphate transporter  32.18 
 
 		 604 aa  236  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.145004 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2454  sulfate transporter  30.25 
 
 		 606 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.792452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1648  sulfate transporter  31.05 
 
 		 568 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.423895  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1634  sulphate transporter  33.81 
 
 		 571 aa  232  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2312  sulfate transporter family protein  31.72 
 
 		 590 aa  230  6e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2616  SulP family sulfate permease  31.9 
 
 		 551 aa  229  9e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.352608 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1994  sulfate permease  30.12 
 
 		 583 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0913  sulfate transporter  29.35 
 
 		 568 aa  228  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2701  sulfate transporter  31.43 
 
 		 568 aa  226  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.293526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4982  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS:xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  33.09 
 
 		 552 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0164  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist  31.91 
 
 		 575 aa  226  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1844  sulphate transporter  30.89 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1992  sulphate transporter  33.33 
 
 		 559 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.998362 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4040  sulphate transporter  30.02 
 
 		 586 aa  223  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160074  normal  0.0936872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0223  sulphate transporter  29.57 
 
 		 553 aa  223  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1553  sulphate anion transporter  29.33 
 
 		 553 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000000364529  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2103  sulfate transporter  30.56 
 
 		 568 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0900  sulfate transporter  29.34 
 
 		 556 aa  220  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.312059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1208  sulphate anion transporter  31.24 
 
 		 588 aa  220  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5404  sulphate transporter  30.34 
 
 		 577 aa  219  7.999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.428288  normal  0.878672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0864  hypothetical protein  29.42 
 
 		 567 aa  219  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3504  sulphate transporter  32.32 
 
 		 576 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0835  hypothetical protein  29.29 
 
 		 567 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0606  sulphate transporter  32.34 
 
 		 599 aa  219  2e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.754417 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3287  sulphate transporter  31.9 
 
 		 571 aa  218  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.691601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3625  sulfate transporter  30.58 
 
 		 578 aa  218  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0207467  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2065  sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  30.06 
 
 		 579 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0195664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1585  sulfate transporter  29.68 
 
 		 563 aa  213  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0062  sulfate permease family protein  30.29 
 
 		 553 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000218031  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11757  sulfate ABC transporter membrane protein  28.19 
 
 		 560 aa  210  6e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.986401  normal  0.0396369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4738  sulfate transporter  28.23 
 
 		 565 aa  210  7e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.181577 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1620  sulfate transporter  29.95 
 
 		 582 aa  210  8e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.242226 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1136  sulfate transporter  29.55 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2304  sulfate transporter  27.88 
 
 		 569 aa  208  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.625966 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5628  sulfate transporter  30.07 
 
 		 584 aa  208  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.292466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2252  sulfate transporter  27.7 
 
 		 569 aa  207  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1407  sulfate transporter  31.59 
 
 		 568 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0363  sulfate transporter  27.47 
 
 		 552 aa  207  4e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4316  sulfate transporter  31.59 
 
 		 568 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00416357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3023  sulphate transporter  29.48 
 
 		 574 aa  205  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.524361  normal  0.25764 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3937  sulfate transporter  28.6 
 
 		 573 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.483734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4404  sulfate transporter  31.71 
 
 		 568 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0753618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43200  putative sulfate transporter  30.04 
 
 		 573 aa  204  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.401968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2397  sulphate transporter  30.81 
 
 		 572 aa  204  5e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.298342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2232  sulphate transporter  30.33 
 
 		 597 aa  204  6e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0478021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0743  sulphate transporter  29.08 
 
 		 594 aa  203  9e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0253396  normal  0.310729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>