274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1979 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1979  tryptophan repressor binding protein  100 
 
 		 197 aa  395  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1823  flavodoxin/nitric oxide synthase  69.74 
 
 		 199 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1130  flavodoxin/nitric oxide synthase  66.84 
 
 		 209 aa  263  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0057993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0913  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.5 
 
 		 203 aa  258  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1249  NADPH-dependent FMN reductase:flavodoxin/nitric oxide synthase  65.82 
 
 		 200 aa  256  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.905  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1766  NAD(P)H:quinone oxidoreductase, type IV  63.96 
 
 		 197 aa  256  2e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0408  trp repressor binding protein  63.96 
 
 		 197 aa  256  2e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1665  flavoprotein WrbA  64.47 
 
 		 197 aa  255  3e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.204501  hitchhiker  0.00540913 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2247  flavoprotein WrbA  64.62 
 
 		 205 aa  253  9e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1995  flavoprotein WrbA  64.97 
 
 		 197 aa  253  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04556  tryptophan repressor binding protein  63.96 
 
 		 218 aa  249  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.816043  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0715  flavoprotein WrbA  63.27 
 
 		 197 aa  250  1e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.358899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1558  TRP repressor binding protein  61.93 
 
 		 201 aa  247  8e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.769228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0187  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.29 
 
 		 200 aa  247  9e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.938759  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0980  flavodoxin/nitric oxide synthase  57.73 
 
 		 202 aa  243  1.9999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1353  putative Trp repressor binding protein  61.42 
 
 		 200 aa  242  3e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.873787  normal  0.272914 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0899  TRAP dicarboxylate transporter- DctP subunit  60.94 
 
 		 199 aa  241  3.9999999999999997e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000786086 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0705  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.54 
 
 		 220 aa  241  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.1474  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3703  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.95 
 
 		 201 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00106032 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4229  flavodoxin/nitric oxide synthase  66.67 
 
 		 198 aa  239  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.234243  normal  0.499938 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51990  Trp repressor binding protein WrbA  64.95 
 
 		 198 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00164992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4560  Trp repressor binding protein WrbA  65.1 
 
 		 198 aa  238  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.309608  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2774  flavoprotein WrbA  61.42 
 
 		 200 aa  238  5e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1861  flavodoxin  60.3 
 
 		 687 aa  238  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1686  trp repressor binding protein  63.92 
 
 		 201 aa  237  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0700  hypothetical protein  60.94 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1684  NADPH-dependent FMN reductase  60.3 
 
 		 202 aa  235  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.866798  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0941  flavodoxin  60.3 
 
 		 202 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1706  NADPH-dependent FMN reductase  60.3 
 
 		 202 aa  235  3e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0755  flavodoxin  60.3 
 
 		 202 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.383175  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2990  flavodoxin/nitric oxide synthase  64.58 
 
 		 198 aa  235  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  hitchhiker  0.0079617 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0407  flavodoxin  60.3 
 
 		 202 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1474  flavodoxin  60.3 
 
 		 202 aa  235  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2619  flavodoxin  60.3 
 
 		 202 aa  234  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0682  hypothetical protein  60.94 
 
 		 199 aa  234  8e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2485  flavodoxin/nitric oxide synthase  56.92 
 
 		 198 aa  234  8e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0558  flavoprotein WrbA  61.22 
 
 		 205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.731292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2779  flavoprotein WrbA  60.71 
 
 		 199 aa  231  7.000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1246  flavoprotein WrbA  63.4 
 
 		 201 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000168945 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0973  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.58 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1433  flavoprotein WrbA  61.58 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0631  flavodoxin/nitric oxide synthase  59.89 
 
 		 212 aa  230  1e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1455  flavodoxin/nitric oxide synthase  61.58 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1206  flavoprotein WrbA  62.89 
 
 		 201 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0439  tryptophan repressor binding protein  60.51 
 
 		 199 aa  228  3e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0867  flavoprotein WrbA  55.67 
 
 		 202 aa  228  4e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0748564  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0384  flavoprotein WrbA  60.51 
 
 		 199 aa  228  4e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1644  trp repressor binding protein  62.89 
 
 		 201 aa  227  8e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.330548 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4073  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.89 
 
 		 201 aa  227  8e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3069  flavodoxin-like protein  58.67 
 
 		 198 aa  225  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.432129  hitchhiker  0.00072414 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1336  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.82 
 
 		 206 aa  224  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.481655  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4600  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.96 
 
 		 206 aa  223  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.573755  normal  0.923474 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2340  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.21 
 
 		 200 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200739 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1860  flavoprotein WrbA  60.96 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000177757 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1376  flavoprotein WrbA  60.73 
 
 		 206 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.79766 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1576  flavoprotein WrbA  61.22 
 
 		 202 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2521  Trp repressor-binding protein  62.37 
 
 		 205 aa  221  6e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1897  flavodoxin/nitric oxide synthase  60.54 
 
 		 209 aa  221  6e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36830  WrbA-like flavodoxin  65.62 
 
 		 200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.740574  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02144  Flavodoxin/nitric oxide synthase  53.3 
 
 		 200 aa  208  3e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0314978  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0549  putative Trp repressor binding protein  56.99 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0537  flavodoxin/nitric oxide synthase  55.44 
 
 		 205 aa  202  3e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00888496 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0520  flavodoxin/nitric oxide synthase  62.72 
 
 		 184 aa  199  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.998331 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0737  flavoprotein WrbA  51.23 
 
 		 197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.438501  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1746  Trp repressor-binding protein  53.85 
 
 		 186 aa  194  5.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03195  hypothetical protein  51.81 
 
 		 190 aa  189  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002786  Trp repressor-binding protein  50.78 
 
 		 189 aa  187  5.999999999999999e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1277  flavoprotein WrbA  43.94 
 
 		 199 aa  166  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.079206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7634  TrpR binding protein WrbA  45.27 
 
 		 200 aa  161  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.365622 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6057  TrpR binding protein WrbA  45.27 
 
 		 200 aa  160  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.186902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1455  flavoprotein WrbA  43.5 
 
 		 200 aa  158  6e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157391  normal  0.291105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5841  TrpR binding protein WrbA  45.5 
 
 		 200 aa  157  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.823521 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6077  TrpR binding protein WrbA  45 
 
 		 200 aa  157  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.201338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1010  flavoprotein WrbA  41.5 
 
 		 201 aa  156  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000029905  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6613  TrpR binding protein WrbA  44.28 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280289 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6131  TrpR binding protein WrbA  44.5 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.493495  normal  0.629081 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0428  NADPH-dependent FMN reductase  43.37 
 
 		 197 aa  156  2e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5766  TrpR binding protein WrbA  44 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2181  TrpR binding protein WrbA  45.37 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1148  flavoprotein WrbA  45.27 
 
 		 201 aa  154  9e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6351  TrpR binding protein WrbA  43.72 
 
 		 200 aa  151  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1683  flavoprotein WrbA  44.5 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.308348  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3831  TrpR binding protein WrbA  46 
 
 		 200 aa  150  8e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.872601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4280  TrpR binding protein WrbA  45 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.021842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4647  TrpR binding protein WrbA  45 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2414  flavoprotein WrbA  43 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4797  TrpR binding protein WrbA  44 
 
 		 199 aa  148  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.153134  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0620  TrpR binding protein WrbA  43.43 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0460  TrpR binding protein WrbA  43.43 
 
 		 200 aa  148  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2002  TrpR binding protein WrbA  46.23 
 
 		 199 aa  147  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1505  flavoprotein WrbA  42.49 
 
 		 206 aa  147  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0774654  normal  0.0461136 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0896  flavoprotein WrbA  40.82 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4564  TrpR binding protein WrbA  44.93 
 
 		 208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3134  TrpR binding protein WrbA  42.93 
 
 		 199 aa  145  4.0000000000000006e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0958  flavoprotein WrbA  37.62 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0105  TrpR binding protein WrbA  41.46 
 
 		 204 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2508  TrpR binding protein WrbA  40.38 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272355  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0804  TrpR binding protein WrbA  40.5 
 
 		 203 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.323465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3387  TrpR binding protein WrbA  40.5 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0637331 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0373  flavodoxin/nitric oxide synthase  42.93 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.267004  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>