More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1977 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1977  formyltetrahydrofolate deformylase  100 
 
 		 284 aa  584  1e-166  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2434  formyltetrahydrofolate deformylase  63.73 
 
 		 296 aa  395  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2425  formyltetrahydrofolate deformylase  61.27 
 
 		 284 aa  350  2e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1008  formyltetrahydrofolate deformylase  59.22 
 
 		 284 aa  347  9e-95  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.394277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4234  formyltetrahydrofolate deformylase  58.01 
 
 		 284 aa  338  5.9999999999999996e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.761125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4374  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 		 284 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  57.14 
 
 		 284 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.180137 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2099  formyltetrahydrofolate deformylase  57.8 
 
 		 289 aa  332  6e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.810337  normal  0.272125 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0012  formyltetrahydrofolate deformylase  57.5 
 
 		 284 aa  331  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.909291 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  53.05 
 
 		 309 aa  317  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00390951  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1631  formyltetrahydrofolate deformylase  54.29 
 
 		 300 aa  316  3e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043119  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0638  formyltetrahydrofolate deformylase  53.02 
 
 		 287 aa  316  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2326  formyltetrahydrofolate deformylase  51.25 
 
 		 284 aa  315  6e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1488  formyltetrahydrofolate deformylase  54.77 
 
 		 296 aa  313  1.9999999999999998e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.973322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2543  formyltetrahydrofolate deformylase  52.86 
 
 		 300 aa  305  6e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0678  formyltetrahydrofolate deformylase  54.39 
 
 		 285 aa  305  7e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1668  formyltetrahydrofolate deformylase  49.82 
 
 		 292 aa  305  7e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000000107141  normal  0.242712 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18381  formyltetrahydrofolate deformylase  52.5 
 
 		 284 aa  302  3.0000000000000004e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0692  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 288 aa  301  6.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1522  formyltetrahydrofolate deformylase  52.84 
 
 		 287 aa  301  1e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0375  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 283 aa  300  2e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1695  formyltetrahydrofolate deformylase  54.06 
 
 		 295 aa  298  7e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0684131  normal  0.212705 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2199  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 288 aa  293  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0323  formyltetrahydrofolate deformylase  52.13 
 
 		 286 aa  291  6e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 287 aa  291  7e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0750038 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21841  formyltetrahydrofolate deformylase  49.64 
 
 		 284 aa  291  9e-78  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.310068  normal  0.572618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0556  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 297 aa  291  9e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1020  formyltetrahydrofolate deformylase  48.24 
 
 		 284 aa  290  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0523  formyltetrahydrofolate deformylase  53.19 
 
 		 289 aa  290  2e-77  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1311  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 284 aa  288  7e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0467  formyltetrahydrofolate deformylase  48.75 
 
 		 293 aa  288  8e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5709  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 287 aa  287  1e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.506805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4882  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 283 aa  287  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.784471  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0174  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2419  formyltetrahydrofolate deformylase  52.88 
 
 		 287 aa  286  2e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56060  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 283 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1352  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782528  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1145  formyltetrahydrofolate deformylase  50.18 
 
 		 287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.857181  normal  0.75307 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38280  formyltetrahydrofolate deformylase  49.1 
 
 		 283 aa  285  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0414  formyltetrahydrofolate deformylase  49.47 
 
 		 294 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0175619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4352  formyltetrahydrofolate deformylase  52.3 
 
 		 299 aa  283  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3312  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 		 283 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.929874  normal  0.815852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2051  formyltetrahydrofolate deformylase  49.28 
 
 		 285 aa  281  6.000000000000001e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000424508  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1693  formyltetrahydrofolate deformylase  48.94 
 
 		 290 aa  281  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2211  formyltetrahydrofolate deformylase  49.48 
 
 		 288 aa  280  1e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308703  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2073  formyltetrahydrofolate deformylase  45.94 
 
 		 288 aa  280  1e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0345334  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4164  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 287 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.500211  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1866  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1951  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 286 aa  280  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0189  formyltetrahydrofolate deformylase  46.64 
 
 		 284 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00979575 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  50 
 
 		 286 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1789  formyltetrahydrofolate deformylase  48.38 
 
 		 283 aa  278  5e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2012  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 299 aa  278  6e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.436066  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1591  formyltetrahydrofolate deformylase  45.94 
 
 		 284 aa  278  7e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1367  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 283 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0129513  normal  0.181813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4436  formyltetrahydrofolate deformylase  47.65 
 
 		 282 aa  278  8e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00849533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4356  formyltetrahydrofolate deformylase  47.69 
 
 		 283 aa  278  8e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000805788  normal  0.0308915 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12031  predicted protein  48.93 
 
 		 297 aa  277  1e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0206302  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1023  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 		 284 aa  276  2e-73  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.124115  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2236  formyltetrahydrofolate deformylase  49.11 
 
 		 288 aa  276  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0525619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0486  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 		 284 aa  276  2e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4447  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 283 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000794151  decreased coverage  0.00000544491 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1052  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 		 284 aa  276  3e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000281715  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0438  formyltetrahydrofolate deformylase  48.76 
 
 		 282 aa  276  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.275251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4314  formyltetrahydrofolate deformylase  48.56 
 
 		 283 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000262425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1577  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 287 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.621505 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0154  formyltetrahydrofolate deformylase  48.03 
 
 		 283 aa  275  7e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00603763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1007  formyltetrahydrofolate deformylase  46.98 
 
 		 283 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000029138  hitchhiker  0.000000000000593821 
 
 
-
 
NC_002936  DET1237  formyltetrahydrofolate deformylase  46.45 
 
 		 284 aa  275  8e-73  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.144683  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1110  formyltetrahydrofolate deformylase  48.39 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  0.241232 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1873  formyltetrahydrofolate deformylase  48.43 
 
 		 288 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00824927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1583  formyltetrahydrofolate deformylase  49.65 
 
 		 287 aa  274  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.746954 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1752  formyltetrahydrofolate deformylase  48.78 
 
 		 288 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1740  formyltetrahydrofolate deformylase  46.81 
 
 		 286 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4018  formyltetrahydrofolate deformylase  48.38 
 
 		 283 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0329939  normal  0.0297352 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1795  formyltetrahydrofolate deformylase  46.32 
 
 		 284 aa  273  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.571525  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0297  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.338729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5913  formyltetrahydrofolate deformylase  47.33 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.779943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0606  formyltetrahydrofolate deformylase  46.83 
 
 		 289 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00930988 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0336  formyltetrahydrofolate deformylase  47.52 
 
 		 287 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0419  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 		 282 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0700542  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0428  formyltetrahydrofolate deformylase  49.12 
 
 		 282 aa  272  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18931  formyltetrahydrofolate deformylase  46.67 
 
 		 284 aa  271  6e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.857167  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4033  formyltetrahydrofolate deformylase  47.48 
 
 		 287 aa  271  7e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  hitchhiker  0.00329385 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2074  formyltetrahydrofolate deformylase  48.43 
 
 		 288 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.437396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0534  formyltetrahydrofolate deformylase  46.92 
 
 		 294 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2671  formyltetrahydrofolate deformylase  49.29 
 
 		 284 aa  271  1e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0749436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4112  formyltetrahydrofolate deformylase  47.18 
 
 		 289 aa  271  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19121  formyltetrahydrofolate deformylase  45.96 
 
 		 290 aa  271  1e-71  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4562  formyltetrahydrofolate deformylase  48.58 
 
 		 287 aa  270  2e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307485  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2792  formyltetrahydrofolate deformylase  46.02 
 
 		 294 aa  270  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.329734 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2300  formyltetrahydrofolate deformylase  50.71 
 
 		 285 aa  270  2e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195931  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0127  formyltetrahydrofolate deformylase  47.84 
 
 		 282 aa  270  2e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.236113  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6111  formyltetrahydrofolate deformylase  46.02 
 
 		 294 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.481987  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1987  formyltetrahydrofolate deformylase  47.7 
 
 		 307 aa  270  2.9999999999999997e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0706  formyltetrahydrofolate deformylase  50.69 
 
 		 282 aa  269  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0609  formyltetrahydrofolate deformylase  48.06 
 
 		 282 aa  268  5e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0648  formyltetrahydrofolate deformylase  49.31 
 
 		 282 aa  268  7e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2167  formyltetrahydrofolate deformylase  45.67 
 
 		 294 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2781  formyltetrahydrofolate deformylase  45.67 
 
 		 294 aa  268  8e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.184484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>