More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1875 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1875  glycosyl transferase, group 2 family protein  100 
 
 		 241 aa  493  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3263  glycosyl transferase family 2  47.19 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4928  glycosyl transferase family 2  51.71 
 
 		 234 aa  218  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.749845 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3027  putative glycosyltransferase  45.18 
 
 		 237 aa  209  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2417  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 		 247 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.385127 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0631  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.94 
 
 		 321 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4473  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2855  glycosyl transferase family 2  35.35 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.328226  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2680  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.043994  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1577  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 315 aa  128  7.000000000000001e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2328  glycosyl transferase group 2 family protein  33.33 
 
 		 326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.775783  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2580  glycosyl transferase family 2  35.02 
 
 		 341 aa  123  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.392013 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29980  Glycosyl transferase, family 2 protein  37.38 
 
 		 325 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191299  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0315  glycosyl transferase family 2  35.98 
 
 		 311 aa  123  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.357577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1120  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 		 303 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.674601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3866  glycosyl transferase family 2  34.25 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1509  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.05 
 
 		 331 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.37 
 
 		 313 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000268918  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1436  polysaccharide biosynthesis protein/putative rhamnosyl transferase  30.73 
 
 		 313 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2992  glycosyltransferase-like protein  33.93 
 
 		 332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.151276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0237  putative glycosyl transferase  32.86 
 
 		 334 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000312549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2834  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 		 349 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3096  glycosyl transferase family 2  35.24 
 
 		 350 aa  116  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.381079 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2566  glycosyl transferase family 2  41.12 
 
 		 252 aa  116  3.9999999999999997e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0768  glycosyl transferase family 2  35.27 
 
 		 334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2405  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1430  glycosyl transferase family protein  33.64 
 
 		 338 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.339779  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3102  glycosyl transferase family protein  28.27 
 
 		 312 aa  109  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0611107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2531  glycosyl transferase family protein  30.26 
 
 		 310 aa  108  6e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0207  glycosyltransferase  30.41 
 
 		 313 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0393294  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0314  glycosyl transferase family 2  31.73 
 
 		 348 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5289  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2176  glycosyl transferase family protein  31.11 
 
 		 324 aa  105  5e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0528602  hitchhiker  0.0000162414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2340  glycosyl transferase family protein  33.63 
 
 		 310 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3795  putative glycosyl transferase  33.79 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.688058 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3901  glycosyl transferase family 2  30.26 
 
 		 313 aa  98.6  9e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1244  glycosyl transferase family protein  27.89 
 
 		 390 aa  95.5  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2174  glycosyl transferase family protein  30.48 
 
 		 308 aa  93.2  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.203622  decreased coverage  0.00000290408 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3485  glycosyl transferase family protein  29.63 
 
 		 310 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0232814 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0417  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.44 
 
 		 302 aa  90.5  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.163858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  33.49 
 
 		 1171 aa  90.5  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1026  hypothetical protein  32.42 
 
 		 339 aa  90.9  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1499  glycosyltransferase-like protein  28 
 
 		 350 aa  90.5  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.311462  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0071  glycosyl transferase family 2  28.38 
 
 		 334 aa  90.1  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0258597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1184  glycosyl transferase family protein  33.02 
 
 		 801 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5735  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.22 
 
 		 294 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3842  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 312 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.051073  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4080  glycosyl transferase family protein  36.11 
 
 		 312 aa  86.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.106116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7037  glycosyl transferase family 2  32.47 
 
 		 727 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4246  glycosyl transferase family protein  30.51 
 
 		 354 aa  85.5  8e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.691572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1452  glycosyltransferase-like protein  31.51 
 
 		 287 aa  85.1  8e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  39.84 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1697  glycosyl transferase family protein  29.74 
 
 		 336 aa  84  0.000000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.591253  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  25.2 
 
 		 581 aa  84  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3039  glycosyl transferase family protein  27.98 
 
 		 308 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3922  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 308 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.300011 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5173  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 		 330 aa  83.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.65386  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4052  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 329 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.45239  normal  0.6169 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1062  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.44 
 
 		 302 aa  82.8  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3357  glycosyl transferase family protein  31.16 
 
 		 342 aa  82  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.356276 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  31.1 
 
 		 276 aa  82  0.000000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1119  glycosyl transferase family protein  28.97 
 
 		 322 aa  81.6  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0834441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2389  glycosyl transferase family protein  27.65 
 
 		 596 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.062581  hitchhiker  0.00000855128 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  35.09 
 
 		 320 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  30.66 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0297  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 		 313 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0894  glycosyl transferase family 2  32.86 
 
 		 235 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1218  glycosyl transferase family protein  31.53 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.332146  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2972  glycosyl transferase family 2  27.57 
 
 		 294 aa  79.3  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2418  glycosyl transferase family 2  30.22 
 
 		 354 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.319221 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  31.51 
 
 		 337 aa  79  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4243  glycosyl transferase family 2  27.1 
 
 		 374 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0556  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 349 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.532544  normal  0.84686 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1868  glycosyl transferase family protein  30.58 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0131573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2950  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.268496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0844  glycosyl transferase family protein  41.51 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0881511  decreased coverage  0.00160187 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  28.97 
 
 		 338 aa  77  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5392  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.88 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  23.98 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  22.22 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3220  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  35.19 
 
 		 373 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  26.55 
 
 		 326 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  29.36 
 
 		 321 aa  75.9  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2676  glycosyl transferase family protein  27.57 
 
 		 294 aa  75.9  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4580  glycosyl transferase family 2  27.38 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  32.6 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  24.57 
 
 		 326 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2951  glycosyl transferase family 2  30.81 
 
 		 314 aa  75.5  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.769684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0849  glycosyl transferase family protein  28.57 
 
 		 321 aa  75.1  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0730658 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1133  glycosyl transferase family 2  32.21 
 
 		 380 aa  75.1  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.568095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1419  glycosyl transferase family protein  28.04 
 
 		 296 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.12984 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0841  glycosyl transferase family protein  27.31 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.817689  hitchhiker  0.00989101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3797  glycosyl transferase family 2  27.6 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  21.46 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  30.73 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  30.64 
 
 		 345 aa  74.7  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  31.96 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>