More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1834 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  100 
 
 
396 aa  787  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  59.74 
 
 
396 aa  465  1e-130  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  58.81 
 
 
402 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  58.21 
 
 
403 aa  461  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  58.9 
 
 
407 aa  461  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  58.9 
 
 
407 aa  462  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  59.11 
 
 
383 aa  461  1e-128  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  58.56 
 
 
402 aa  460  1e-128  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  58.81 
 
 
402 aa  461  1e-128  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  58.56 
 
 
402 aa  460  1e-128  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  58.56 
 
 
402 aa  460  1e-128  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  59.16 
 
 
401 aa  458  1e-128  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  59.16 
 
 
401 aa  459  1e-128  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  59.16 
 
 
401 aa  459  1e-128  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  61.78 
 
 
383 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  59.9 
 
 
402 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.91 
 
 
401 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.91 
 
 
401 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  58.91 
 
 
401 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  58.5 
 
 
403 aa  451  1e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  58.88 
 
 
398 aa  454  1e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  61.56 
 
 
398 aa  454  1e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  58 
 
 
404 aa  453  1e-126  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  58.25 
 
 
404 aa  453  1e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  59.22 
 
 
398 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  58.51 
 
 
388 aa  438  1e-122  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  57.99 
 
 
388 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  57.99 
 
 
387 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  54.29 
 
 
392 aa  415  1e-115  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  55.47 
 
 
380 aa  406  1e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.22 
 
 
390 aa  405  1e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  55.73 
 
 
386 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.09 
 
 
379 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  53.72 
 
 
385 aa  382  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  53.75 
 
 
383 aa  381  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.69 
 
 
388 aa  378  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  53.09 
 
 
379 aa  376  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.7 
 
 
384 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  52.24 
 
 
386 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  58.07 
 
 
380 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  54.17 
 
 
385 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.7 
 
 
385 aa  367  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  54.83 
 
 
389 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  54.52 
 
 
389 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  54.19 
 
 
386 aa  362  7e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.68 
 
 
412 aa  362  8e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  53.89 
 
 
402 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  53.73 
 
 
386 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  51.9 
 
 
386 aa  358  7e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  57.8 
 
 
385 aa  356  5e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  57 
 
 
386 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.37 
 
 
417 aa  349  5e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  56.03 
 
 
386 aa  348  7e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.75 
 
 
408 aa  347  2e-94  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  52.12 
 
 
383 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.39 
 
 
391 aa  331  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  50.13 
 
 
387 aa  330  3e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  50.45 
 
 
513 aa  321  1e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  50.79 
 
 
465 aa  319  5e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  46.78 
 
 
372 aa  311  9e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  49.06 
 
 
457 aa  305  1e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  43.08 
 
 
443 aa  302  8e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  48.45 
 
 
474 aa  299  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  45.15 
 
 
472 aa  297  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  47.87 
 
 
350 aa  296  4e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  45.56 
 
 
476 aa  295  1e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  51.56 
 
 
460 aa  294  2e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.09 
 
 
442 aa  293  5e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  46.79 
 
 
442 aa  291  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  4.78038e-13  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1471  protease Do  46.13 
 
 
474 aa  291  2e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  45.37 
 
 
502 aa  290  3e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  45.76 
 
 
478 aa  290  3e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  47.85 
 
 
463 aa  289  5e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1855  protease Do  46.73 
 
 
504 aa  289  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.19147  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2762  protease Do  44.39 
 
 
485 aa  288  1e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.280827 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  48 
 
 
474 aa  287  3e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  48 
 
 
474 aa  287  3e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  44.81 
 
 
463 aa  285  8e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  42.74 
 
 
472 aa  285  1e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1673  protease Do  41.71 
 
 
505 aa  285  1e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0684799  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4291  protease Do  44.94 
 
 
477 aa  285  1e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1430  protease Do  44.94 
 
 
492 aa  285  1e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  44.32 
 
 
475 aa  284  2e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1467  serine protease, MucD  45.24 
 
 
473 aa  284  2e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627151  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  41.05 
 
 
467 aa  283  3e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  47.08 
 
 
496 aa  283  4e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  44.21 
 
 
472 aa  282  6e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4377  protease Do  44.64 
 
 
477 aa  282  7e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.937074  normal  0.327825 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  47.08 
 
 
468 aa  281  1e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  47.81 
 
 
458 aa  281  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1070  protease Do  44.64 
 
 
479 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4221  serine protease, MucD  46.61 
 
 
479 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1087  protease Do  45.85 
 
 
477 aa  281  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.386741  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  43.56 
 
 
471 aa  280  2e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  45.02 
 
 
458 aa  280  2e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  45.61 
 
 
487 aa  281  2e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1565  protease Do  45.4 
 
 
502 aa  280  3e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  9.01531e-09  hitchhiker  0.00330598 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0747  protease Do  42.03 
 
 
511 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  3.07319e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  43.41 
 
 
471 aa  279  5e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  46.63 
 
 
476 aa  280  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>