More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1795 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  100 
 
 
264 aa  529  1e-149  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2026  polysaccharide export protein  49.62 
 
 
270 aa  266  2e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0242  polysaccharide export protein  45.83 
 
 
264 aa  246  3e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1877  polysaccharide export protein  51 
 
 
281 aa  241  1e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2734  capsular polysaccharide export protein, putative  47.46 
 
 
276 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0365414 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0148  capsular polysaccharide export protein, putative  42.44 
 
 
277 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2367  polysaccharide export protein EpsE  47.92 
 
 
262 aa  202  6e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  38.21 
 
 
324 aa  155  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1538  periplasmic polysaccharide export protein  35.37 
 
 
268 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1658  polysaccharide export protein  32.2 
 
 
277 aa  141  9e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00056738  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0835  polysaccharide export protein  33.2 
 
 
272 aa  125  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0834  polysaccharide export protein  34.26 
 
 
309 aa  120  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1842  polysaccharide export protein  32.28 
 
 
379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.185865  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1695  polysaccharide export protein  30 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.24357  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2182  polysaccharide export protein  28.35 
 
 
298 aa  113  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1369  capsular polysaccharide export protein, putative  31.08 
 
 
362 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.361316  normal  0.297509 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3319  polysaccharide export protein  29.55 
 
 
351 aa  107  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.211792 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  33.21 
 
 
356 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  27.02 
 
 
344 aa  103  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1430  capsular polysaccharide export protein, putative  31.87 
 
 
333 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  34.04 
 
 
178 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1985  outer membrane protein, putative  29.76 
 
 
282 aa  99.8  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2717  polysaccharide export protein  32.61 
 
 
379 aa  100  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335454  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1823  polysaccharide export protein  32.23 
 
 
387 aa  99.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0435675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2193  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.8 
 
 
378 aa  99.4  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000597973  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  26.62 
 
 
473 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1712  polysaccharide export protein  31.58 
 
 
386 aa  99  6e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.69321  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1011  polysaccharide export protein  29.13 
 
 
388 aa  99  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.192426  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2222  polysaccharide export protein  32.65 
 
 
281 aa  97.4  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.456122  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06665  hypothetical protein  30.8 
 
 
373 aa  97.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0578  polysaccharide biosynthesis/export protein  29.89 
 
 
375 aa  95.9  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.809222  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  36.62 
 
 
152 aa  95.5  8e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1296  polysaccharide export protein  30.57 
 
 
378 aa  95.1  9e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.660258  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  31.32 
 
 
381 aa  94.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2365  polysaccharide export protein  29.35 
 
 
282 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2894  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
377 aa  94  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0993342  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2676  polysaccharide export protein  32.22 
 
 
379 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  37.93 
 
 
153 aa  93.6  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0799  polysaccharide export protein  30.94 
 
 
393 aa  93.6  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
417 aa  93.2  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2867  polysaccharide export protein  30.97 
 
 
378 aa  92.4  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  27.18 
 
 
495 aa  92.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  30.53 
 
 
347 aa  91.3  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001119  polysaccharide export lipoprotein wza  29.13 
 
 
317 aa  91.7  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000135082  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  39.47 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2351  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.59 
 
 
351 aa  90.9  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2300  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.59 
 
 
348 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.631767  normal  0.480899 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  30.57 
 
 
431 aa  91.3  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2344  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.43 
 
 
379 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.675285  normal  0.855008 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2458  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.43 
 
 
379 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0550214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4429  polysaccharide export protein  29.17 
 
 
374 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.145769  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1092  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  31 
 
 
386 aa  90.5  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  32.71 
 
 
417 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2584  polysaccharide export protein  27.02 
 
 
288 aa  90.9  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2243  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.59 
 
 
348 aa  90.5  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00986  predicted exopolysaccharide export protein  30.57 
 
 
379 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2660  polysaccharide export protein  30.57 
 
 
379 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  42.15 
 
 
192 aa  89.7  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3645  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.2 
 
 
920 aa  89.7  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2332  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.57 
 
 
386 aa  89.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.132677  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  32.65 
 
 
391 aa  89.7  4e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  30 
 
 
379 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00993  hypothetical protein  30.57 
 
 
379 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1219  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.57 
 
 
379 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2613  polysaccharide export protein  30.57 
 
 
379 aa  89.7  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.139508 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1099  outer membrane lipoprotein, group 4 capsule (G4C) polysaccharide  30.57 
 
 
386 aa  90.1  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0031657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1842  polysaccharide biosynthesis/export domain-containing protein  33.49 
 
 
781 aa  89.7  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.749239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  33.78 
 
 
376 aa  89.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  38.16 
 
 
235 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01968  lipoprotein required for capsular polysaccharide translocation through the outer membrane  30.54 
 
 
379 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1595  polysaccharide export protein  30.54 
 
 
379 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.249253  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2997  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.54 
 
 
379 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0597184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1000  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.54 
 
 
379 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4086  polysaccharide export protein  32.58 
 
 
360 aa  89.4  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.194923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1170  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.54 
 
 
379 aa  89.4  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1579  polysaccharide export protein  30.54 
 
 
379 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.479279  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01957  hypothetical protein  30.54 
 
 
379 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2355  polysaccharide biosynthesis/export protein  30.54 
 
 
379 aa  89.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  35.76 
 
 
205 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00687  hypothetical protein  29.77 
 
 
897 aa  88.6  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  31.4 
 
 
175 aa  88.2  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3036  polysaccharide export protein  29.09 
 
 
378 aa  88.2  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  38.46 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  30.29 
 
 
362 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1583  polysaccharide export protein  32.7 
 
 
378 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.323182  normal  0.546592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  42.28 
 
 
216 aa  86.3  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  28.88 
 
 
178 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  38.62 
 
 
219 aa  86.3  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  30.11 
 
 
379 aa  86.3  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3242  polysaccharide export protein  33.57 
 
 
212 aa  86.3  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  32.54 
 
 
185 aa  85.9  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0598  polysaccharide export protein  28.88 
 
 
478 aa  85.9  6e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000477703  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2691  polysaccharide export protein  30.31 
 
 
508 aa  85.9  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113552  decreased coverage  0.00268462 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  29.52 
 
 
352 aa  85.9  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  41.27 
 
 
196 aa  85.5  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0823  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  34.74 
 
 
429 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0647  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  34.74 
 
 
429 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.377734  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0661  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  34.74 
 
 
429 aa  85.1  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.520209  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  32.22 
 
 
185 aa  85.1  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  37.29 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>