More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1735 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  100 
 
 		 301 aa  595  1e-169  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  33.55 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  35.81 
 
 		 294 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  32.76 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  27.91 
 
 		 295 aa  122  8e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  29.39 
 
 		 297 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  30.98 
 
 		 291 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  30.85 
 
 		 291 aa  109  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  33.44 
 
 		 300 aa  109  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  30.85 
 
 		 309 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  32.13 
 
 		 298 aa  107  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2148  hypothetical protein  32.43 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1862  UspA domain-containing protein  29 
 
 		 293 aa  98.6  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.23265  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  31.39 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  30.74 
 
 		 323 aa  94.7  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  28.8 
 
 		 305 aa  93.6  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  30.41 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  31.74 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  30.89 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  27.16 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  37.5 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0418  universal stress protein uspA  30.41 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  27 
 
 		 289 aa  82  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5472  UspA domain protein  29.9 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.814559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  26.33 
 
 		 297 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  32.2 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  30.13 
 
 		 303 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  29.43 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30.2 
 
 		 304 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  30.14 
 
 		 265 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2877  UspA domain protein  31.21 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  30.69 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3554  UspA domain-containing protein  31.19 
 
 		 300 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.125802  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  26.91 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  28.52 
 
 		 286 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6021  UspA domain protein  27.46 
 
 		 352 aa  74.3  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.218013  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  29.97 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  29.57 
 
 		 294 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  29.8 
 
 		 150 aa  72.8  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  28.47 
 
 		 286 aa  72.8  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  26.2 
 
 		 314 aa  72  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25.41 
 
 		 297 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  29.84 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  29.84 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2212  hypothetical protein  27.24 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00559639  normal  0.433652 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  21.07 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  30.03 
 
 		 289 aa  70.5  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  30.82 
 
 		 153 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  27.62 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  31.1 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  28.85 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  26.8 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4992  UspA domain-containing protein  29.29 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.969556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  30.14 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1265  hypothetical protein  20.7 
 
 		 275 aa  66.6  0.0000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.995311  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  28.57 
 
 		 307 aa  66.2  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2325  UspA domain protein  24.48 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1162  UspA domain-containing protein  29.45 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.77 
 
 		 145 aa  65.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  26.8 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  23.15 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  23.72 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 145 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.57 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1288  universal stress protein UspA  25.81 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  29.45 
 
 		 153 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  27.52 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.9 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3749  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 		 281 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.074776  hitchhiker  0.000110577 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0396  hypothetical protein  25.33 
 
 		 282 aa  63.9  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  31.08 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4652  hypothetical protein  30 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.741195 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  27.03 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  25.09 
 
 		 300 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2467  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0071  hypothetical protein  29.03 
 
 		 308 aa  63.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.677177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  27.46 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  23.66 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  31.79 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  30 
 
 		 157 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1294  universal stress protein  28.77 
 
 		 152 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.967689 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 		 151 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1714  hypothetical protein  31.79 
 
 		 150 aa  61.6  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  35.92 
 
 		 153 aa  62  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  32.17 
 
 		 301 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  22.58 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  30.28 
 
 		 150 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0906  UspA domain protein  30.46 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00116915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  27.87 
 
 		 276 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  31.94 
 
 		 150 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3263  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0214365 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  33.78 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  28.86 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  26.9 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  33.79 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1859  UspA domain-containing protein  24.68 
 
 		 285 aa  60.1  0.00000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  33.99 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>