More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1700 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1700  Serine/threonine protein kinase  100 
 
 
425 aa  849    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  53.97 
 
 
457 aa  270  4e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1587  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  45.98 
 
 
825 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  47.17 
 
 
620 aa  232  1e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3942  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  45.67 
 
 
907 aa  230  4e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1367  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  43.06 
 
 
869 aa  229  9e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0699  serine/threonine protein kinase  44.4 
 
 
866 aa  227  2e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  45 
 
 
612 aa  219  7e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3670  protein kinase domain-containing protein  42.13 
 
 
781 aa  215  9.999999999999999e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353968  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4118  serine/threonine protein kinase  43.7 
 
 
888 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.116559  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1116  Serine/threonine protein kinase-like  42.06 
 
 
820 aa  213  5.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  43.75 
 
 
628 aa  213  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0158  serine/threonine protein kinase  39.23 
 
 
557 aa  213  7e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4458  serine/threonine protein kinase  45.7 
 
 
573 aa  209  8e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.776532  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.66 
 
 
579 aa  208  1e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0017  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.37 
 
 
658 aa  207  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4066  serine/threonine protein kinase  45.31 
 
 
543 aa  207  3e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000310609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0037  serine/threonine protein kinase  43.65 
 
 
750 aa  206  7e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  43.2 
 
 
612 aa  206  7e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  46.61 
 
 
666 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  42.37 
 
 
985 aa  203  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0069  putative serine/threonine protein kinase  42.16 
 
 
360 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.446321 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2951  serine/threonine protein kinase-like protein  39.77 
 
 
462 aa  203  4e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0439076  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.88 
 
 
650 aa  203  4e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0087  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  46.12 
 
 
645 aa  203  5e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0667  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.57 
 
 
652 aa  202  9e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0537547  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0135  serine/threonine protein kinase  41.11 
 
 
562 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.340026 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0088  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  45.74 
 
 
520 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4391  serine/threonine protein kinase  40.71 
 
 
915 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3369  serine/threonine protein kinase  41.35 
 
 
455 aa  201  3e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  42.21 
 
 
599 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.61 
 
 
632 aa  199  9e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  42.59 
 
 
919 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
468 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.14 
 
 
681 aa  199  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3213  serine/threonine protein kinase  44.09 
 
 
498 aa  198  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0152772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2537  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.7 
 
 
850 aa  198  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0574  serine/threonine protein kinase  39.02 
 
 
703 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.153609  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2939  serine/threonine protein kinase  44.4 
 
 
445 aa  197  4.0000000000000005e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  41.2 
 
 
1023 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2536  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.31 
 
 
747 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.09 
 
 
668 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1067  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  44.88 
 
 
653 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  42.76 
 
 
625 aa  196  9e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  44.31 
 
 
625 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  41.7 
 
 
642 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.68 
 
 
584 aa  194  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  38.87 
 
 
943 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1045  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.13 
 
 
627 aa  194  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4390  serine/threonine protein kinase  40.67 
 
 
938 aa  194  3e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.139237  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.27 
 
 
662 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  41.53 
 
 
757 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2219  serine/threonine protein kinase  39.54 
 
 
862 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.318627  normal  0.271916 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4396  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  35.29 
 
 
822 aa  193  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  35.74 
 
 
691 aa  193  5e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1455  serine/threonine protein kinase  40.07 
 
 
821 aa  193  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  43.58 
 
 
615 aa  193  6e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4117  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  40.23 
 
 
769 aa  192  7e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555121  normal  0.916376 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  44.7 
 
 
646 aa  192  7e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5246  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  43.19 
 
 
613 aa  192  7e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.438769  hitchhiker  0.0079464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  41.31 
 
 
641 aa  192  8e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  42.76 
 
 
625 aa  192  9e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  35.62 
 
 
692 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0020  serine/threonine protein kinase  41.76 
 
 
632 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  41.04 
 
 
776 aa  191  1e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0038  serine/threonine protein kinase  42.86 
 
 
700 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  39.71 
 
 
798 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  43.63 
 
 
618 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.39 
 
 
676 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  40.3 
 
 
557 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  43.8 
 
 
675 aa  191  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  40.24 
 
 
638 aa  191  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  44.19 
 
 
624 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  44.19 
 
 
624 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  44.19 
 
 
624 aa  191  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4392  serine/threonine protein kinase  41.2 
 
 
891 aa  190  4e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4393  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  42.15 
 
 
1019 aa  190  5e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.618951  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00360  protein kinase family protein with PASTA domain protein  39.01 
 
 
668 aa  189  5.999999999999999e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2966  serine/threonine protein kinase  39.27 
 
 
569 aa  189  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  43.15 
 
 
625 aa  189  1e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  42.37 
 
 
593 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0020  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.41 
 
 
648 aa  188  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016475 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  40.64 
 
 
673 aa  188  2e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  43.07 
 
 
1032 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42.31 
 
 
664 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0577  serine/threonine protein kinase  45.42 
 
 
520 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.14687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0053  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.44 
 
 
603 aa  187  4e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.319641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.16 
 
 
715 aa  186  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0263  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
894 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.925108  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1669  protein kinase  42.37 
 
 
1053 aa  186  6e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.421495  normal  0.873367 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1729  serine/threonine protein kinase  43.24 
 
 
301 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.372145  normal  0.952904 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  42.7 
 
 
1032 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1345  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  42 
 
 
641 aa  185  2.0000000000000003e-45  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  41.37 
 
 
667 aa  185  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27070  protein kinase family protein with PASTA domain  40.96 
 
 
692 aa  184  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.93249  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0115  serine/threonine protein kinase  45.71 
 
 
585 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109927  normal  0.0245304 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3232  protein kinase  42.47 
 
 
623 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0785008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  40.7 
 
 
661 aa  184  3e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0048  protein kinase  38.78 
 
 
609 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  38.82 
 
 
627 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>