More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1665 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1665  hydroxyacylglutathione hydrolase  100 
 
 
256 aa  522  1e-147  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1481  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.64 
 
 
250 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00263805  normal  0.131466 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2116  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.46 
 
 
257 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1621  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.4 
 
 
264 aa  228  6e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.252215  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2530  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.08 
 
 
257 aa  226  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.785477  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2187  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.86 
 
 
266 aa  224  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1895  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.7 
 
 
257 aa  223  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00137094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1975  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.46 
 
 
259 aa  223  2e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1743  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.08 
 
 
259 aa  222  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0994564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2651  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.47 
 
 
258 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0421465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2871  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.56 
 
 
263 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00247676  normal  0.571794 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01981  Hydroxyacylglutathione hydrolase  43.7 
 
 
263 aa  218  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0160657  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1587  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.64 
 
 
255 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.325978  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2206  beta-lactamase-like protein  46.79 
 
 
266 aa  215  5e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00363789  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0870  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.25 
 
 
267 aa  214  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139904  normal  0.346308 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0591  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.25 
 
 
258 aa  214  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1595  Beta-lactamase-like  49.78 
 
 
265 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2291  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.77 
 
 
257 aa  211  7e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.276958  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4897  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.36 
 
 
257 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1989  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.63 
 
 
272 aa  206  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000136825  hitchhiker  0.000132084 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1765  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.52 
 
 
257 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0422  metallo-beta-lactamase family protein  42.52 
 
 
257 aa  207  2e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0543677  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1678  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.35 
 
 
256 aa  206  3e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2114  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.08 
 
 
260 aa  204  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000176506  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1022  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.05 
 
 
269 aa  204  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2529  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.44 
 
 
259 aa  204  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.366844  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1258  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.24 
 
 
273 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000343  normal  0.124604 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1468  metallo-beta-lactamase family protein  47.35 
 
 
268 aa  203  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176854  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0765  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.35 
 
 
268 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0594  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.35 
 
 
268 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2788  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.97 
 
 
268 aa  203  3e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00000589518  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0558  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.35 
 
 
268 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1994  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.67 
 
 
256 aa  202  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.452581  normal  0.438487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2207  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.54 
 
 
259 aa  202  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.181464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1275  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.35 
 
 
268 aa  203  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2406  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.83 
 
 
263 aa  202  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000139632  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1253  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.33 
 
 
263 aa  202  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100506  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1996  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.58 
 
 
263 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0422138  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1515  putative hydroxyacylglutathione hydrolase protein  42.64 
 
 
284 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2161  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.16 
 
 
295 aa  202  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000853605  normal  0.0597088 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2338  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.08 
 
 
259 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2238  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.16 
 
 
295 aa  201  6e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000229962  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2369  beta-lactamase domain-containing protein  47.16 
 
 
267 aa  202  6e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000987439  normal  0.0208559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1972  hydroxyacylglutathione hydrolase  48.57 
 
 
245 aa  201  8e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.293472 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29620  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.8 
 
 
258 aa  201  8e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0944915  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2327  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.58 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000811011  hitchhiker  0.0000970016 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2563  metallo-beta-lactamase family protein  43.87 
 
 
267 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2011  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.58 
 
 
263 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000146784  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1944  hydroxyacylglutathione hydrolase  49.05 
 
 
255 aa  199  3e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1602  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.73 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1498  metallo-beta-lactamase family protein  47.73 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.950921  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2401  putative metallo-beta-lactamase  44.75 
 
 
252 aa  198  5e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1776  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.23 
 
 
267 aa  199  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000249519  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2059  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.15 
 
 
263 aa  198  7e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000134001  decreased coverage  0.000104727 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0498  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.84 
 
 
256 aa  198  7e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0378559  normal  0.142728 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3716  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.63 
 
 
259 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.420034  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4144  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.24 
 
 
259 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002770  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.63 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.18088  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1007  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.35 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.467747  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1721  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.63 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal  0.991139 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1364  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.92 
 
 
258 aa  196  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2021  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.92 
 
 
258 aa  196  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360558  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1828  putative hydroxyacylglutathione hydrolase GloB  41.25 
 
 
252 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1299  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.53 
 
 
258 aa  195  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.744991  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3714  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  42.53 
 
 
259 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610808  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03213  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.47 
 
 
252 aa  195  7e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0397  hydroxyacylglutathione hydrolase, putative  45.56 
 
 
250 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2685  metallo-beta-lactamase family protein  40.23 
 
 
280 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0199524 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2611  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.62 
 
 
263 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00328129  normal  0.860285 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0561  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.56 
 
 
250 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1176  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.72 
 
 
273 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000239023  normal  0.0635677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1702  hydroxyacylglutathione hydrolase  39.38 
 
 
257 aa  192  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0461199  normal  0.908663 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2039  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.4 
 
 
279 aa  192  4e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0934  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.27 
 
 
259 aa  192  4e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.421322  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3469  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.86 
 
 
259 aa  192  4e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1052  metallo-beta-lactamase family protein  40.39 
 
 
251 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.199482  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2033  hydroxyacylglutathione hydrolase  45.83 
 
 
268 aa  192  6e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000269745  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4429  hydroxyacylglutathione hydrolase  46.21 
 
 
268 aa  192  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156624  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1106  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.39 
 
 
251 aa  192  6e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1731  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.4 
 
 
279 aa  191  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00595225  normal  0.648796 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1164  hydroxyacylglutathione hydrolase  47.49 
 
 
260 aa  191  9e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000229771  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1462  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.4 
 
 
240 aa  191  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0144845  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1884  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.4 
 
 
258 aa  190  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000396006  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2841  hydroxyacylglutathione hydrolase  40 
 
 
250 aa  190  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1999  metallo-beta-lactamase family protein  39.84 
 
 
265 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0806  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.61 
 
 
273 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0137889  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1287  hydroxyacylglutathione hydrolase  44.61 
 
 
273 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000101374  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5360  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.91 
 
 
263 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3665  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 
257 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.952724  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3483  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.89 
 
 
258 aa  186  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.677226  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2064  hydroxyacylglutathione hydrolase  41.7 
 
 
257 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.455867  normal  0.0515167 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0842  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.87 
 
 
254 aa  185  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2445  hydroxyacylglutathione hydrolase  42.91 
 
 
257 aa  185  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1761  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.61 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427726  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2184  Beta-lactamase-like  44.53 
 
 
255 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1536  hydroxyacylglutathione hydrolase  40.45 
 
 
263 aa  182  5.0000000000000004e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0733967  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0809  hydroxyacylglutathione hydrolase  43.05 
 
 
233 aa  182  6e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2691  putative hydroxyacylglutathione hydrolase  43.44 
 
 
256 aa  181  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.25235  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0343  metallo-beta-lactamase family protein  43.4 
 
 
256 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1257  hydroxyacylglutathione hydrolase (glyoxalase II)  37.21 
 
 
254 aa  181  1e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>