More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1590 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  100 
 
 		 609 aa  1139    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  60.32 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  59.31 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  54.74 
 
 		 462 aa  276  9e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  53.99 
 
 		 501 aa  263  4.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  49.86 
 
 		 506 aa  255  1.0000000000000001e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  50.76 
 
 		 497 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  52.01 
 
 		 493 aa  253  8.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  58.85 
 
 		 388 aa  250  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  60 
 
 		 392 aa  250  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  58.89 
 
 		 405 aa  249  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  60.89 
 
 		 490 aa  247  4.9999999999999997e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  59.58 
 
 		 395 aa  245  1.9999999999999999e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  51.06 
 
 		 492 aa  245  1.9999999999999999e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  50.61 
 
 		 494 aa  242  1e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  49.72 
 
 		 486 aa  240  5e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  52.91 
 
 		 475 aa  237  6e-61  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  52.31 
 
 		 475 aa  235  2.0000000000000002e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  48.18 
 
 		 492 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  75 
 
 		 492 aa  234  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  55 
 
 		 404 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  48.93 
 
 		 488 aa  231  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  70.41 
 
 		 431 aa  226  9e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  47.77 
 
 		 492 aa  226  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  69.38 
 
 		 437 aa  218  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  71.07 
 
 		 404 aa  217  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  44.86 
 
 		 481 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  53.91 
 
 		 469 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  44.65 
 
 		 482 aa  213  7e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  44.58 
 
 		 492 aa  213  7e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  41.87 
 
 		 493 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  41.87 
 
 		 493 aa  210  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174414 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  63.53 
 
 		 272 aa  210  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  62.35 
 
 		 272 aa  209  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  51.02 
 
 		 390 aa  207  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  51.02 
 
 		 390 aa  207  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  59.79 
 
 		 276 aa  206  7e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  41.81 
 
 		 498 aa  205  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  43.58 
 
 		 488 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  44.05 
 
 		 517 aa  204  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  60.43 
 
 		 375 aa  204  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  60.84 
 
 		 272 aa  202  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  62.43 
 
 		 387 aa  201  3e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  42.22 
 
 		 580 aa  201  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  43.45 
 
 		 516 aa  200  5e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  53.64 
 
 		 294 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  56.76 
 
 		 393 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  58.95 
 
 		 279 aa  197  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  56.47 
 
 		 467 aa  196  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  54.46 
 
 		 506 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  59.04 
 
 		 278 aa  195  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  56.67 
 
 		 274 aa  195  2e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  57.65 
 
 		 468 aa  195  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  54.46 
 
 		 506 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  54.46 
 
 		 506 aa  195  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  56.22 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  61.54 
 
 		 279 aa  195  3e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  42.3 
 
 		 484 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  55.07 
 
 		 280 aa  194  6e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  42.3 
 
 		 485 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  55.1 
 
 		 502 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  63.98 
 
 		 373 aa  191  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  59.88 
 
 		 587 aa  191  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  52.94 
 
 		 398 aa  191  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  55.56 
 
 		 412 aa  190  5.999999999999999e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  48.29 
 
 		 493 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  56.07 
 
 		 687 aa  189  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  59.63 
 
 		 505 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  59.63 
 
 		 505 aa  188  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  42.9 
 
 		 483 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2114  flagellin  58.72 
 
 		 506 aa  187  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.168497 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1258  flagellin  47.41 
 
 		 545 aa  187  7e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0516151 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  42.73 
 
 		 380 aa  186  8e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  44.17 
 
 		 379 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  59.75 
 
 		 263 aa  185  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  57.06 
 
 		 271 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2022  putative flagellin  54.12 
 
 		 349 aa  184  3e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  57.06 
 
 		 271 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  61.88 
 
 		 278 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  50.73 
 
 		 404 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2158  flagellin  51.79 
 
 		 579 aa  184  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  57.74 
 
 		 422 aa  184  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  53.18 
 
 		 282 aa  183  6e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  57.06 
 
 		 272 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  60.25 
 
 		 294 aa  183  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  57.06 
 
 		 272 aa  183  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1053  flagellin  55.81 
 
 		 568 aa  182  2e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2698  flagellin  55.23 
 
 		 585 aa  181  2e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132656 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  63.16 
 
 		 287 aa  181  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  58.54 
 
 		 271 aa  180  7e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  56.44 
 
 		 271 aa  180  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  56.44 
 
 		 271 aa  180  8e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27700  Flagellin  58.23 
 
 		 567 aa  180  9e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  58.9 
 
 		 263 aa  179  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  55.83 
 
 		 271 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  46.1 
 
 		 390 aa  179  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  55.83 
 
 		 271 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  59.41 
 
 		 288 aa  179  1e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  57.93 
 
 		 271 aa  179  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1716  flagellin  51.28 
 
 		 572 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.363061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>