134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1580 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1580  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00205223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0394  phosphoribosyltransferase  69.57 
 
 		 207 aa  302  3.0000000000000004e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.707933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0900  phosphoribosyltransferase  69.27 
 
 		 226 aa  282  3.0000000000000004e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.876041  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4553  phosphoribosyl transferase  61.69 
 
 		 216 aa  251  6e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.59752  normal  0.0208576 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4420  phosphoribosyltransferase  61.69 
 
 		 216 aa  251  6e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1154  phosphoribosyltransferase  59.02 
 
 		 208 aa  250  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2702  phosphoribosyltransferase  55.71 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00000000905676 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3103  phosphoribosyl transferase domain protein  55.71 
 
 		 222 aa  228  4e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.331363  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4714  phosphoribosyltransferase  49.53 
 
 		 222 aa  175  4e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.120595  decreased coverage  0.00895414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0958  phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 		 242 aa  174  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.376665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0796  phosphoribosyltransferase  42.23 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2854  erythromycin esterase  46.67 
 
 		 885 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.13333 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4233  erythromycin esterase  46.67 
 
 		 885 aa  166  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3530  phosphoribosyltransferase  44.98 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3723  Erythromycin esterase  42.65 
 
 		 884 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.146777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2186  erythromycin esterase  46.38 
 
 		 682 aa  158  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.231601  normal  0.689672 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_783  phosphoribosyltransferase-like protein  40.78 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3987  phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 		 477 aa  156  3e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1733  phosphoribosyltransferase  43.84 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.494334  normal  0.92247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2061  phosphoribosyltransferase  44.6 
 
 		 221 aa  155  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0701589  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0626  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  43.81 
 
 		 232 aa  154  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.987714  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3450  phosphoribosyltransferase  44.55 
 
 		 226 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1594  phosphoribosyltransferase  47.54 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0450512 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2892  phosphoribosyltransferase  44.91 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3315  phosphoribosyltransferase  40.49 
 
 		 208 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7039  phosphoribosyltransferase  43.18 
 
 		 235 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2142  phosphoribosyl transferase domain protein  40.19 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3615  hypothetical protein  42.72 
 
 		 220 aa  149  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.469495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3230  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  41.04 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10581  hypothetical protein  42.52 
 
 		 443 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1413  putative phosphoribosyl transferase domain protein  41.59 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.767905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0940  putative phosphoribosyl transferase protein  44.02 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2509  phosphoribosyltransferase  43.56 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0258464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3462  phosphoribosyltransferase  41.98 
 
 		 441 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0777  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  44.02 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0765  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  44.02 
 
 		 235 aa  145  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0965  phosphoribosyltransferase  41.35 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0854  phosphoribosyltransferase  39.11 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12173  hypothetical protein  42.44 
 
 		 352 aa  145  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.789883 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3513  phosphoribosyltransferase  40 
 
 		 220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.684715  normal  0.167755 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2224  phosphoribosyltransferase  40.78 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1533  hypothetical protein  38.39 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1608  purine/pyrimidine phosphoribosyl transferase  40.28 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0576  putative phosphoribosyl transferase  40.28 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2468  phosphoribosyltransferase  39.02 
 
 		 214 aa  142  4e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2705  phosphoribosyltransferase  47.03 
 
 		 232 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2322  Erythromycin esterase  43.48 
 
 		 669 aa  141  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.445653  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2045  phosphoribosyltransferase  41.63 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.488744  normal  0.275075 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2809  phosphoribosyltransferase  42.79 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1897  putative phosphoribosyl transferase protein  40.87 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.640029 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5385  phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 		 229 aa  139  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1081  erythromycin esterase  42.23 
 
 		 845 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  0.00882815  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1097  erythromycin esterase  42.23 
 
 		 679 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.511682  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1108  erythromycin esterase  42.23 
 
 		 679 aa  139  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0293392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2392  phosphoribosyltransferase  42.65 
 
 		 459 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5866  phosphoribosyltransferase like protein  44.14 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3744  phosphoribosyltransferase-like protein  42.11 
 
 		 418 aa  137  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.478029  normal  0.0623345 
 
 
-
 
NC_003296  RS00882  hypothetical protein  46.23 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0251075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3360  phosphoribosyl transferase domain-containing protein  42.72 
 
 		 216 aa  137  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00395141  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1393  erythromycin esterase  40.29 
 
 		 681 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0175546  normal  0.392686 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3164  phosphoribosyltransferase  40.76 
 
 		 207 aa  135  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.405407 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0832  phosphoribosyltransferase  39.71 
 
 		 437 aa  135  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2806  phosphoribosyltransferase  41.51 
 
 		 443 aa  134  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181803  normal  0.157505 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2465  phosphoribosyltransferase  41.15 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.171549  normal  0.629341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25740  Phosphoribosyl transferase protein  42.11 
 
 		 228 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4384  phosphoribosyltransferase  38.94 
 
 		 229 aa  132  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.36871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3766  phosphoribosyltransferase  41.04 
 
 		 459 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4988  erythromycin esterase  39.81 
 
 		 681 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6485  phosphoribosyltransferase  41.23 
 
 		 209 aa  132  6e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.408226  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4970  phosphoribosyltransferase  37.61 
 
 		 229 aa  131  6.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0585  phosphoribosyltransferase  35.27 
 
 		 208 aa  131  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.362477  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1169  hypothetical protein  37.56 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2462  phosphoribosyltransferase  40.1 
 
 		 439 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00859189  normal  0.0374875 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1189  phosphoribosyltransferase  40.98 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.267888 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1163  hypothetical protein  37.56 
 
 		 216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1746  hypothetical protein  37.26 
 
 		 441 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0311019  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1078  phosphoribosyltransferase  43.54 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.628466  normal  0.518737 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1308  phosphoribosyltransferase  39.05 
 
 		 241 aa  128  6e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.526022  normal  0.255038 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19310  Phosphoribosyltransferase  37.62 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.523965  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1690  phosphoribosyl transferase domain protein  42.52 
 
 		 220 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1335  phosphoribosyltransferase  40.48 
 
 		 446 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0972268  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2998  phosphoribosyltransferase  42.54 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149919  normal  0.225767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1155  phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 		 245 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0796  phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613603  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1277  phosphoribosyltransferase  44.39 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0115029  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12067  hypothetical protein  40.1 
 
 		 681 aa  125  5e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1167  phosphoribosyltransferase  43.9 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0975763  normal  0.0766272 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1792  phosphoribosyltransferase  43.33 
 
 		 232 aa  125  7e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00238592  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3246  phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3308  phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.562029  decreased coverage  0.00695494 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3257  phosphoribosyltransferase  41.95 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.413592  normal  0.450079 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15350  predicted phosphoribosyltransferase  37.91 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.652419  normal  0.519761 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5577  phosphoribosyltransferase  39.81 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1249  phosphoribosyltransferase  42.06 
 
 		 217 aa  121  9e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0737102 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1814  phosphoribosyltransferase  36.23 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.055799  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4420  phosphoribosyltransferase  41.46 
 
 		 214 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.289093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1971  hypothetical protein  40.19 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.359462  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1923  phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4117  phosphoribosyltransferase  42.16 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0136  phosphoribosyltransferase  33.65 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00508045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>