85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1561 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1561  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  236  9e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.150485  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  56.03 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2272  Rieske (2Fe-2S) region  54.55 
 
 		 134 aa  130  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308557  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2437  Rieske (2Fe-2S) region  54.55 
 
 		 127 aa  128  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.55603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  57.69 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  58.1 
 
 		 130 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  58.1 
 
 		 130 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3657  Rieske (2Fe-2S) region  52.88 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1381  Rieske (2Fe-2S) domain protein  51.79 
 
 		 123 aa  115  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  51.96 
 
 		 133 aa  115  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0821  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  52 
 
 		 130 aa  114  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  48.62 
 
 		 126 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.03606 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0659  hypothetical protein  51.46 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  50 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50.98 
 
 		 131 aa  110  5e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1065  hypothetical protein  51 
 
 		 133 aa  110  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0994  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 		 136 aa  110  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 		 132 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1072  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal  0.136055 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0634  Rieske (2Fe-2S) region  50 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1810  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2860  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0573473  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2799  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0503713  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2487  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00132222  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00324792  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0523  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  50 
 
 		 131 aa  108  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.472442  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0990  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  49 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2640  Rieske (2Fe-2S) domain protein  47.57 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3287  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.57 
 
 		 125 aa  103  6e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4785  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.45 
 
 		 126 aa  103  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1176  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.6 
 
 		 125 aa  103  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  47.12 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5279  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  45.71 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1723  Rieske (2Fe-2S) protein  43.27 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  44.12 
 
 		 123 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1421  Rieske (2Fe-2S) region  44.74 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.606028 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  39.74 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.1 
 
 		 105 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  40.4 
 
 		 108 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  37.38 
 
 		 105 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  36.94 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  29.81 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0744  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.45 
 
 		 105 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.347579  hitchhiker  0.000000000639734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.96 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  39.39 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.38 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 		 153 aa  64.7  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.64 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  38.38 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0838  Rieske [2Fe-2S] region  38.46 
 
 		 132 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000649112 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  36.94 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42610  hypothetical protein  33.64 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.217045  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  35.78 
 
 		 112 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.48 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  42.53 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.51 
 
 		 105 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  31.53 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  34.26 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.17 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4083  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.171695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  40 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3434  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.24 
 
 		 217 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.63 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3380  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.96 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5626  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  38.89 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.164476 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6068  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.73 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0959217  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  36.36 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.36 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4253  hypothetical protein  36.25 
 
 		 144 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  0.678624 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5218  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.02 
 
 		 111 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.434864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.71 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2735  Rieske (2Fe-2S) protein  34.41 
 
 		 111 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0390389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  37.1 
 
 		 149 aa  50.8  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3905  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.48 
 
 		 114 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.391138  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  32.23 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.71 
 
 		 119 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.93 
 
 		 138 aa  48.9  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2392  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.33 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.29 
 
 		 151 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1360  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  36.11 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2795  Rieske iron sulfur-like protein  36.11 
 
 		 170 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  27.78 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0228441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.3 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>