More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1522 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1522  glutamate racemase  100 
 
 		 265 aa  543  1e-154  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.167317  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3010  glutamate racemase  69.43 
 
 		 275 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.067434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3052  glutamate racemase  69.43 
 
 		 275 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.580902 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1238  glutamate racemase  68.91 
 
 		 268 aa  358  4e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0487  glutamate racemase  51.91 
 
 		 288 aa  279  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  53.67 
 
 		 275 aa  275  5e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  52.51 
 
 		 272 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2923  glutamate racemase  51.35 
 
 		 272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  50.58 
 
 		 276 aa  263  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0260  glutamate racemase  50.19 
 
 		 278 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172375 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  49.05 
 
 		 278 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0573  glutamate racemase  48.5 
 
 		 267 aa  252  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  52.69 
 
 		 266 aa  245  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  48.81 
 
 		 270 aa  243  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1937  glutamate racemase  45.88 
 
 		 268 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512985  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  46.25 
 
 		 267 aa  236  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1735  glutamate racemase  47.15 
 
 		 271 aa  236  4e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0215474 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2003  glutamate racemase  45.15 
 
 		 269 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.520225  normal  0.08167 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0264  glutamate racemase  46.69 
 
 		 276 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.741636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0346  glutamate racemase  44.32 
 
 		 274 aa  231  9e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.633772  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  42.42 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1797  glutamate racemase  45.86 
 
 		 269 aa  228  9e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.850127  normal  0.2795 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  49.24 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0278  glutamate racemase  41.29 
 
 		 264 aa  227  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.424849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0449  glutamate racemase  44.53 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0316043  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0699  glutamate racemase  47.92 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0698  glutamate racemase  47.92 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2743  glutamate racemase  46.33 
 
 		 285 aa  221  8e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.677331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  44.66 
 
 		 261 aa  220  9.999999999999999e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  47.9 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0415  glutamate racemase  44.66 
 
 		 272 aa  218  7.999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.51428  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3231  glutamate racemase  44.75 
 
 		 272 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.041198  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1386  glutamate racemase  45.53 
 
 		 272 aa  216  2e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0404  glutamate racemase  41.73 
 
 		 280 aa  216  2.9999999999999998e-55  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  41.7 
 
 		 264 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1783  glutamate racemase  41.35 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  45.28 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  44.09 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0708  glutamate racemase  46.18 
 
 		 259 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.235687 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0302  glutamate racemase  42.37 
 
 		 271 aa  209  3e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3675  glutamate racemase  43.08 
 
 		 258 aa  209  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00345939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1467  glutamate racemase  42.86 
 
 		 292 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0107271  normal  0.23474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0161  glutamate racemase  43.72 
 
 		 270 aa  207  2e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0534068  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1600  glutamate racemase  40.78 
 
 		 264 aa  206  3e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129686  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1797  glutamate racemase  42.35 
 
 		 278 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0527  glutamate racemase  43.75 
 
 		 264 aa  205  5e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0603  glutamate racemase  41.18 
 
 		 281 aa  204  9e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  40 
 
 		 267 aa  203  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  40.08 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  40.08 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  40.08 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  40.08 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  40.08 
 
 		 269 aa  203  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  40.08 
 
 		 269 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  40 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  40 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0848  glutamate racemase  42.08 
 
 		 264 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  38.41 
 
 		 295 aa  202  5e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0987  glutamate racemase  46.98 
 
 		 260 aa  201  7e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.507565  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7556  glutamate racemase  42.47 
 
 		 295 aa  201  8e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6812  glutamate racemase  47.04 
 
 		 268 aa  201  9e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.636194 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1315  glutamate racemase  43.58 
 
 		 282 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.278048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  39.69 
 
 		 269 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  40 
 
 		 267 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0860  glutamate racemase  41.25 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000213664  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0588  glutamate racemase  40.78 
 
 		 281 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  41.6 
 
 		 265 aa  199  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2509  glutamate racemase  40.43 
 
 		 291 aa  198  9e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.194908 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3460  glutamate racemase  38.66 
 
 		 269 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0361413 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2258  hypothetical protein  43.73 
 
 		 279 aa  196  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  41.67 
 
 		 276 aa  195  7e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2229  hypothetical protein  43.35 
 
 		 279 aa  194  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1732  Glutamate racemase  42.86 
 
 		 276 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.648223 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1955  glutamate racemase  40.78 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00243974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1403  glutamate racemase  40.48 
 
 		 271 aa  192  4e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.011176  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0088  glutamate racemase  38.83 
 
 		 311 aa  191  9e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0755  glutamate racemase  39.38 
 
 		 276 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  41.13 
 
 		 263 aa  189  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1543  glutamate racemase  44.71 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1276  glutamate racemase  37.11 
 
 		 295 aa  189  5e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0590  glutamate racemase  43.68 
 
 		 293 aa  188  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.169456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  42.86 
 
 		 282 aa  188  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3920  glutamate racemase  43.45 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0806  glutamate racemase  39.38 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0847  glutamate racemase  39.38 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09110  glutamate racemase  43.07 
 
 		 307 aa  187  2e-46  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.644138  normal  0.0830373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3846  glutamate racemase  43.45 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0942  glutamate racemase  39.38 
 
 		 276 aa  186  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000979949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1700  glutamate racemase  43.46 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0499651  normal  0.299923 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2361  glutamate racemase  38.43 
 
 		 289 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.566119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2624  glutamate racemase  37.78 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.155868 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1031  glutamate racemase  39.92 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00684957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0939  glutamate racemase  39.77 
 
 		 275 aa  186  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0940  glutamate racemase  41.54 
 
 		 277 aa  185  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.389602 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3832  glutamate racemase  43.07 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1321  glutamate racemase  41.7 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1686  glutamate racemase  42.02 
 
 		 263 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.000161224  hitchhiker  0.00000616393 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11368  glutamate racemase  43.51 
 
 		 271 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110986  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2356  glutamate racemase  41.18 
 
 		 278 aa  183  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0280232  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  42.32 
 
 		 268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>