171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1500 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3291  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  70.85 
 
 		 680 aa  868    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00806153  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1252  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  76.55 
 
 		 694 aa  973    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.968564  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0771  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.94 
 
 		 718 aa  731    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3203  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.94 
 
 		 688 aa  973    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.23 
 
 		 712 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.543415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0186  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  54.51 
 
 		 671 aa  689    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3012  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.19 
 
 		 706 aa  763    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1500  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  100 
 
 		 679 aa  1321    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1747  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.99 
 
 		 706 aa  792    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264772  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2357  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.51 
 
 		 842 aa  915    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.131798  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0827  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  70.81 
 
 		 680 aa  882    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000434939  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3239  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  71.04 
 
 		 684 aa  899    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000998265  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0739  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  83.51 
 
 		 677 aa  1089    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.00661783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1818  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.96 
 
 		 702 aa  804    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2641  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.95 
 
 		 707 aa  769    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1067  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  63.14 
 
 		 717 aa  768    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1472  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.55 
 
 		 689 aa  911    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2666  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.22 
 
 		 707 aa  780    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.362236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2299  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.39 
 
 		 732 aa  899    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.48137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0994  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  56.73 
 
 		 672 aa  735    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2678  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.28 
 
 		 706 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.100661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2182  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.7 
 
 		 706 aa  789    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.513059  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2023  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.9 
 
 		 704 aa  743    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0149188  normal  0.0138521 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1141  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.14 
 
 		 712 aa  758    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3281  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.06 
 
 		 710 aa  742    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1528  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  63.49 
 
 		 697 aa  826    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0306017  normal  0.605169 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2995  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.59 
 
 		 681 aa  822    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00639559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.59 
 
 		 681 aa  822    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000847476  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1754  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  69.51 
 
 		 681 aa  896    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000719333  normal  0.172901 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3037  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  71.6 
 
 		 684 aa  941    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00370015  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.99 
 
 		 671 aa  652    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000164217  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2668  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  71.22 
 
 		 693 aa  859    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0348916  normal  0.165448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1701  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.46 
 
 		 746 aa  933    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0933018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1757  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.27 
 
 		 694 aa  927    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3003  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.51 
 
 		 692 aa  902    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2121  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.35 
 
 		 823 aa  870    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.475646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3307  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  76.14 
 
 		 675 aa  920    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.903662 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3408  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.78 
 
 		 710 aa  762    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0686  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  74.67 
 
 		 686 aa  954    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.249632  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0646  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  69.53 
 
 		 681 aa  889    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000127282  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4642  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.9 
 
 		 706 aa  771    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.163123  normal  0.124133 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0657  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.29 
 
 		 711 aa  756    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215912 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0764  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.94 
 
 		 775 aa  729    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2772  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  62.43 
 
 		 700 aa  795    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1965  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  73.27 
 
 		 694 aa  925    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.36393  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0824  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.8 
 
 		 711 aa  759    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.241185  normal  0.154446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1622  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.57 
 
 		 712 aa  747    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2524  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.94 
 
 		 718 aa  736    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1419  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  69.79 
 
 		 683 aa  850    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2916  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  63.57 
 
 		 704 aa  818    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.348085  normal  0.0128697 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4197  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.86 
 
 		 713 aa  686    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.488103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2820  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  63.81 
 
 		 690 aa  793    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000206643  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2905  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  62.3 
 
 		 690 aa  836    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409534  normal  0.0930183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0566  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  71.34 
 
 		 680 aa  897    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0579  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  72.01 
 
 		 687 aa  903    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000633179 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1192  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.66 
 
 		 712 aa  772    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3088  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.78 
 
 		 710 aa  762    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2253  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.38 
 
 		 669 aa  652    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.627571  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3041  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.11 
 
 		 712 aa  733    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.108688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0308  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  59.47 
 
 		 682 aa  764    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3976  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.86 
 
 		 714 aa  733    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.687773  decreased coverage  0.00231033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6803  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.49 
 
 		 715 aa  767    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2973  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  71.95 
 
 		 712 aa  848    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7542  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  60.09 
 
 		 715 aa  781    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0209  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  61.16 
 
 		 712 aa  738    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.135478 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0418  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.95 
 
 		 682 aa  627  1e-178  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1225  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  51.2 
 
 		 654 aa  624  1e-177  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3931  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.88 
 
 		 705 aa  620  1e-176  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000543237  normal  0.470613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2013  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.27 
 
 		 653 aa  610  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446892  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0756  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.22 
 
 		 711 aa  610  1e-173  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.145691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1349  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  51.4 
 
 		 672 aa  603  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.528352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0044  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.93 
 
 		 674 aa  597  1e-169  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15760  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  53.14 
 
 		 652 aa  597  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.0000000000000521315  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1202  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  49.93 
 
 		 692 aa  592  1e-168  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1173  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.58 
 
 		 694 aa  593  1e-168  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.229725  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2414  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.97 
 
 		 672 aa  594  1e-168  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2985  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.41 
 
 		 700 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000074507  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1919  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  48.73 
 
 		 693 aa  589  1e-167  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1378  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.63 
 
 		 718 aa  581  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0934  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  49.03 
 
 		 687 aa  581  1e-164  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1983  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.72 
 
 		 744 aa  575  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0629  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.6 
 
 		 741 aa  568  1e-161  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1804  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.37 
 
 		 706 aa  570  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000195761  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1812  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.15 
 
 		 694 aa  571  1e-161  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0005  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  48.63 
 
 		 694 aa  567  1e-160  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0784  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.57 
 
 		 679 aa  560  1e-158  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1101  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.43 
 
 		 692 aa  561  1e-158  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.930953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_690  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  46.42 
 
 		 679 aa  561  1e-158  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0341598  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0710  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.72 
 
 		 679 aa  560  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2413  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  50.07 
 
 		 698 aa  559  1e-158  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.435461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0372  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.66 
 
 		 792 aa  557  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.110001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0746  V-type H(+)-translocating pyrophosphatase  47.18 
 
 		 890 aa  556  1e-157  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.34227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2001  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  47.49 
 
 		 674 aa  553  1e-156  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0591536  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2262  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.73 
 
 		 779 aa  551  1e-155  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0181184  normal  0.903528 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1713  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.24 
 
 		 683 aa  550  1e-155  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0230915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3559  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.46 
 
 		 779 aa  551  1e-155  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0306706  normal  0.266916 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2481  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  46.08 
 
 		 775 aa  546  1e-154  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.618403 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1479  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  44.78 
 
 		 847 aa  545  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1888  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  45.86 
 
 		 919 aa  545  1e-153  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.640223  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31307  H+-PPase family transporter: proton  43.95 
 
 		 822 aa  544  1e-153  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000955532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>