More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1474 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1474  phospholipase D/transphosphatidylase  100 
 
 		 714 aa  1423    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2521  phospholipase D  44.74 
 
 		 714 aa  622  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1912  phospholipase D/transphosphatidylase  45.9 
 
 		 714 aa  605  9.999999999999999e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5412  phospholipase D  44.05 
 
 		 735 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.965585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1523  phospholipase D/transphosphatidylase  44.38 
 
 		 717 aa  542  1e-153  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3205  phospholipase D/transphosphatidylase  43.43 
 
 		 735 aa  538  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1327  phospholipase D/transphosphatidylase  43 
 
 		 732 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.670027  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6502  phospholipase D/transphosphatidylase  43 
 
 		 732 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6091  SNARE associated Golgi protein  43 
 
 		 732 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.123447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5494  SNARE associated Golgi protein  43.92 
 
 		 746 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268451  hitchhiker  0.00450262 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6313  SNARE associated Golgi protein  42.03 
 
 		 739 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.250858 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5587  phospholipase D/transphosphatidylase  41.88 
 
 		 739 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.752263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1139  SNARE associated Golgi protein  40.59 
 
 		 724 aa  488  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3786  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.57 
 
 		 701 aa  485  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.262802 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1879  phospholipase D domain-containing protein  44.1 
 
 		 728 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.426352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1971  transmembrane phospholipase protein  44.1 
 
 		 728 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2217  SNARE associated Golgi protein-related protein  40.29 
 
 		 713 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.107501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0202  phospholipase D/transphosphatidylase  36.88 
 
 		 803 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.830846  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0903  phospholipase D/transphosphatidylase  49.78 
 
 		 478 aa  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.477077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1341  phospholipase D/Transphosphatidylase  49.02 
 
 		 474 aa  365  1e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.400715  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0043  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.4 
 
 		 502 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.98088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0106  phospholipase D/transphosphatidylase  45.38 
 
 		 502 aa  360  6e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2528  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.27 
 
 		 521 aa  358  9.999999999999999e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1421  phospholipase D/transphosphatidylase  33.38 
 
 		 730 aa  357  5.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.261707 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4609  phospholipase D/transphosphatidylase  42.86 
 
 		 491 aa  354  2e-96  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0142  phospholipase D  42.14 
 
 		 525 aa  350  7e-95  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1702  phospholipase D/transphosphatidylase  45.58 
 
 		 483 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.598771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0113  phospholipase D/transphosphatidylase  42.15 
 
 		 498 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1749  phospholipase D/transphosphatidylase  42.15 
 
 		 483 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.63411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2008  phospholipase D/transphosphatidylase  41.65 
 
 		 504 aa  337  3.9999999999999995e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.565408  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1536  phospholipase D/transphosphatidylase  41.19 
 
 		 512 aa  336  1e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4028  phospholipase D/transphosphatidylase  43.04 
 
 		 518 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1004  phospholipase D/transphosphatidylase  45.27 
 
 		 504 aa  334  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.590794 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0073  phospholipase D/Transphosphatidylase  45.07 
 
 		 504 aa  331  3e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3732  phospholipase D  30.16 
 
 		 720 aa  326  8.000000000000001e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4043  phospholipase D/transphosphatidylase  41.28 
 
 		 572 aa  309  1.0000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5003  phospholipase/phosphatidylserine synthase  41.83 
 
 		 517 aa  307  5.0000000000000004e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5129  phospholipase D/Transphosphatidylase  41 
 
 		 503 aa  301  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0744933 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01463  Phospholipase D/Transphosphatidylase  28.02 
 
 		 738 aa  298  3e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4728  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.92 
 
 		 498 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.406507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5802  phospholipase D/transphosphatidylase  42.79 
 
 		 482 aa  295  3e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0382  phospholipase D/transphosphatidylase  38.16 
 
 		 510 aa  291  4e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5425  phospholipase D/Transphosphatidylase  38.84 
 
 		 514 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759396  normal  0.0100683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4330  phospholipase D/transphosphatidylase  47.53 
 
 		 515 aa  254  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4847  phospholipase D/Transphosphatidylase  44.03 
 
 		 517 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.119076  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4699  phospholipase D/Transphosphatidylase  47.27 
 
 		 513 aa  239  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.439393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2728  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.65 
 
 		 507 aa  217  5.9999999999999996e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1513  phospholipase D/Transphosphatidylase  31.43 
 
 		 507 aa  206  8e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.281383 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2133  putative transmembrane phospholipase protein  40.2 
 
 		 252 aa  153  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2772  hypothetical protein  38.21 
 
 		 232 aa  127  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0994  Phospholipase D  32.92 
 
 		 470 aa  111  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0503  phospholipase D/Transphosphatidylase  34.6 
 
 		 546 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1483  SNARE associated Golgi protein  32.58 
 
 		 246 aa  99.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.183252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3253  phospholipase D/transphosphatidylase  29.96 
 
 		 510 aa  94.7  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.364759  normal  0.703804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3242  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 516 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1364  phospholipase D/transphosphatidylase  33.71 
 
 		 226 aa  92.4  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3304  phospholipase D/transphosphatidylase  33.33 
 
 		 516 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546009  decreased coverage  0.00437672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3799  Phosphatidylserine/phosphatidylglycerophosphate/ cardiolipinsynthase-like protein  32.52 
 
 		 533 aa  89.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.614498 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3885  phospholipase D/transphosphatidylase  30.26 
 
 		 524 aa  88.6  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0762  phospholipase D/transphosphatidylase  33.1 
 
 		 754 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0768  phospholipase D/transphosphatidylase  33.1 
 
 		 734 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498495  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0782  phospholipase D/transphosphatidylase  33.1 
 
 		 754 aa  88.2  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.484743  normal  0.757286 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  30.48 
 
 		 228 aa  88.2  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2674  Phospholipase D  30.9 
 
 		 533 aa  86.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3124  hypothetical protein  36.81 
 
 		 255 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3135  hypothetical protein  36.81 
 
 		 255 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.778386 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3185  hypothetical protein  36.81 
 
 		 255 aa  87  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.127153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  36.84 
 
 		 240 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2018  hypothetical protein  33.66 
 
 		 245 aa  86.3  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4229  hypothetical protein  37.67 
 
 		 239 aa  85.1  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.713657 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2196  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.26 
 
 		 632 aa  83.6  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  35.43 
 
 		 225 aa  81.6  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4320  Phospholipase D  27.74 
 
 		 512 aa  80.9  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  37.31 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0620  SNARE associated Golgi protein  30.46 
 
 		 224 aa  79.7  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  29.36 
 
 		 236 aa  79  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2624  phospholipase D/Transphosphatidylase  26.93 
 
 		 544 aa  78.6  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  29.13 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  32.08 
 
 		 320 aa  77  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4105  SNARE associated Golgi protein  26.04 
 
 		 221 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4078  phospholipase D/Transphosphatidylase  28.76 
 
 		 465 aa  76.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.179058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  30.04 
 
 		 224 aa  75.5  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2175  SNARE associated Golgi protein  28.02 
 
 		 220 aa  75.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  30.27 
 
 		 242 aa  75.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  26.37 
 
 		 217 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4086  hypothetical protein  25.45 
 
 		 219 aa  75.1  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  29.67 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3976  hypothetical protein  26.15 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.417481 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3833  phospholipase D/transphosphatidylase  30.34 
 
 		 472 aa  73.9  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2761  hypothetical protein  35.06 
 
 		 267 aa  73.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.281656  normal  0.425828 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11521  hypothetical protein  35.82 
 
 		 252 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.203646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3883  hypothetical protein  25 
 
 		 219 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  35.07 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3651  hypothetical protein  35.03 
 
 		 245 aa  71.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  26.9 
 
 		 227 aa  71.6  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  25.14 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05920  conserved hypothetical protein  23.41 
 
 		 1522 aa  70.9  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.660267  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.3 
 
 		 218 aa  70.1  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4689  hypothetical protein  26.47 
 
 		 219 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  26.32 
 
 		 227 aa  70.5  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>