More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1359 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1359  ABC transporter ATPase  100 
 
 		 236 aa  476  1e-133  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3832  ABC transporter related  94.92 
 
 		 236 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.737847  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3849  ABC transporter related  94.92 
 
 		 236 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0574047  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1917  ABC transporter related  94.92 
 
 		 236 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2683  ABC transporter related  94.49 
 
 		 236 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1253  ABC transporter related  93.22 
 
 		 236 aa  445  1.0000000000000001e-124  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0397899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1687  ABC transporter related  89.41 
 
 		 236 aa  426  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1836  ABC transporter related  89.41 
 
 		 236 aa  426  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.48298  normal  0.513308 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2875  ATP-binding cassette containing protein  85.41 
 
 		 236 aa  407  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1918  ABC transporter related  89.66 
 
 		 244 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0147  ABC transporter related  88.51 
 
 		 235 aa  401  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1671  ABC transporter related  83.19 
 
 		 234 aa  394  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.663854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2835  ABC transporter related  82.68 
 
 		 245 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204247 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1048  ABC transporter related  82.83 
 
 		 235 aa  387  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1328  ABC transporter related  81.97 
 
 		 244 aa  389  1e-107  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.667978  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3625  ABC transporter related  80.95 
 
 		 243 aa  387  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1923  ABC transporter related  81.47 
 
 		 234 aa  388  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1243  ABC transporter related  81.12 
 
 		 244 aa  390  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0869  ATPase  80.26 
 
 		 243 aa  386  1e-106  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1043  ABC transporter related  81.82 
 
 		 234 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3251  ABC transporter-related protein  82.25 
 
 		 236 aa  380  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1186  ABC transporter related  78.02 
 
 		 241 aa  378  1e-104  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.225539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1364  ABC transporter-related protein  49.13 
 
 		 237 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00718085  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03880  ABC transporter ATPase  91.74 
 
 		 122 aa  224  7e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3713  ABC transporter related  48.86 
 
 		 233 aa  219  3e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1279  ABC transporter related  52.31 
 
 		 235 aa  218  5e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00259137  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0231  ABC transporter related  47.95 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3299  ABC transporter related  53.67 
 
 		 230 aa  215  4e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0482255  normal  0.440753 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3406  ABC transporter related  47.84 
 
 		 240 aa  214  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.225311  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0828  ABC transporter related  48.4 
 
 		 228 aa  212  2.9999999999999995e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0947  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 234 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0347  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3305  ABC transporter related  50.46 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11679  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  43.58 
 
 		 228 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  44.29 
 
 		 223 aa  182  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3267  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 223 aa  180  2e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194795  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2004  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 223 aa  178  7e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.476728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3273  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 223 aa  177  9e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.942342  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3243  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3022  ABC transporter ATP-binding protein  41.74 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.191779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3007  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3255  ABC transporter ATP-binding protein  41.74 
 
 		 223 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.676269  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2235  hypothetical protein  44 
 
 		 654 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2944  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.81423  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0292  ABC transporter related  39.46 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0299  ABC transporter related  39.46 
 
 		 225 aa  176  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.151141  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3253  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2971  ABC transporter related  41.28 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0119229  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3116  ABC transporter related  44.04 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3004  ABC transporter related  44.04 
 
 		 248 aa  175  6e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  42.24 
 
 		 229 aa  174  8e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  44.5 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  41.89 
 
 		 231 aa  172  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0855  ABC transporter related  40.27 
 
 		 228 aa  171  7.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00113999  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4467  ABC transporter related protein  41.96 
 
 		 225 aa  171  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7063  putative ABC transporter, ATP-binding protein  43.5 
 
 		 239 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  42.67 
 
 		 644 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.05 
 
 		 234 aa  169  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  41.36 
 
 		 230 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  43.58 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2078  ABC transporter related  40.44 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.106777  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2586  peptide ABC transporter ATPase  39.82 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0380  ABC transporter related  40.83 
 
 		 246 aa  169  4e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.257996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 		 228 aa  168  6e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  42.15 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  42.15 
 
 		 233 aa  168  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 233 aa  167  9e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1468  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  41.23 
 
 		 230 aa  167  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  42.15 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  39.64 
 
 		 242 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  43.58 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1893  ABC transporter related  41.96 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0539  ABC transporter related protein  39.45 
 
 		 227 aa  166  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0632704  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1554  ABC transporter related  42.49 
 
 		 246 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  42.15 
 
 		 233 aa  166  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.55 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.55 
 
 		 234 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0587  ABC transporter related  43.58 
 
 		 230 aa  166  2e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.0000000200317  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  44.2 
 
 		 228 aa  167  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0367  ABC transporter related  41.78 
 
 		 244 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1257  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  40.83 
 
 		 642 aa  166  4e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  42.79 
 
 		 221 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1431  ABC transporter related  40 
 
 		 227 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.815325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4022  ABC transporter, ATPase subunit  40.83 
 
 		 259 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.91478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  42.47 
 
 		 238 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  41.55 
 
 		 234 aa  166  4e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2830  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.9 
 
 		 231 aa  166  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0931795  normal  0.0149457 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  41.48 
 
 		 232 aa  165  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  41.26 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1081  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  39.91 
 
 		 640 aa  165  5.9999999999999996e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  41.74 
 
 		 228 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  39.47 
 
 		 238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5040  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 246 aa  164  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  37.73 
 
 		 238 aa  164  8e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2476  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  39.04 
 
 		 235 aa  164  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>