More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1282 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1282  rhodanese-like protein  100 
 
 		 397 aa  799    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1932  beta-lactamase domain-containing protein  59.54 
 
 		 403 aa  457  1e-127  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.516166  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1187  beta-lactamase domain-containing protein  46.15 
 
 		 393 aa  335  7e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.778544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1152  beta-lactamase domain protein  44.58 
 
 		 395 aa  332  5e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000210846  decreased coverage  0.000000422487 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0816  beta-lactamase domain-containing protein  43.87 
 
 		 393 aa  306  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2641  beta-lactamase domain protein  42.13 
 
 		 379 aa  264  2e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0871  metallo-beta-lactamase family protein  39.95 
 
 		 376 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000195083 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0938  metallo-beta-lactamase family protein  39.42 
 
 		 376 aa  259  6e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000331666  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0739  metallo-beta-lactamase family protein  39.68 
 
 		 376 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000119995  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0687  metallo-beta-lactamase family protein  39.68 
 
 		 376 aa  259  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.879597  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0777  metallo-beta-lactamase family protein  39.68 
 
 		 376 aa  259  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0687  beta-lactamase domain-containing protein  40.21 
 
 		 378 aa  256  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.596111  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0673  metallo-beta-lactamase family protein  39.15 
 
 		 376 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00215478  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0831  metallo-beta-lactamase family protein  39.68 
 
 		 376 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00416077  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0867  metallo-beta-lactamase family protein  39.15 
 
 		 376 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4505  metallo-beta-lactamase family protein  39.15 
 
 		 378 aa  249  8e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000320753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2898  beta-lactamase domain protein  37.56 
 
 		 375 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0566  beta-lactamase domain protein  34.88 
 
 		 378 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00148503  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4316  beta-lactamase domain protein  36.54 
 
 		 397 aa  234  3e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.558515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0540  beta-lactamase domain protein  37.6 
 
 		 395 aa  229  7e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0933785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4261  beta-lactamase domain protein  36.62 
 
 		 369 aa  226  6e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3386  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 		 428 aa  221  9.999999999999999e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2930  beta-lactamase domain-containing protein  38.03 
 
 		 378 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4293  beta-lactamase domain protein  38.35 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3702  Rhodanese domain protein  33.58 
 
 		 397 aa  213  4.9999999999999996e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.418788  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2422  beta-lactamase domain protein  34.31 
 
 		 400 aa  211  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0257  beta-lactamase domain protein  35.38 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0612  beta-lactamase domain protein  37.41 
 
 		 389 aa  202  6e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1375  beta-lactamase domain protein  35.64 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3631  beta-lactamase domain protein  35.5 
 
 		 374 aa  187  4e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.162031  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4110  Rhodanese domain protein  35.01 
 
 		 370 aa  180  2.9999999999999997e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3034  beta-lactamase domain protein  35.82 
 
 		 382 aa  177  2e-43  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1046  Rhodanese domain protein  32.9 
 
 		 391 aa  167  2.9999999999999998e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.223586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3284  beta-lactamase domain-containing protein  34.26 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1429  Rhodanese domain protein  28.2 
 
 		 401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0596  beta-lactamase domain protein  33.15 
 
 		 432 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3165  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0757  beta-lactamase domain protein  38.33 
 
 		 244 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.717339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0093  Beta-lactamase-like  35.65 
 
 		 244 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000294531  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0267  beta-lactamase domain protein  35.17 
 
 		 484 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2913  beta-lactamase domain protein  30.6 
 
 		 469 aa  103  8e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3935  beta-lactamase-like  33.65 
 
 		 251 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.361961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3119  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 463 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0513  beta-lactamase domain-containing protein  31.58 
 
 		 617 aa  100  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3176  beta-lactamase domain protein  34.51 
 
 		 461 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00491395  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  31.2 
 
 		 476 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1643  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 		 464 aa  98.6  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1215  beta-lactamase domain-containing protein  30.71 
 
 		 460 aa  97.8  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0173274 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1830  beta-lactamase domain-containing protein  34.73 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.772754  normal  0.208991 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4023  beta-lactamase domain-containing protein  34.73 
 
 		 459 aa  97.8  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.139103  normal  0.561085 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3239  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 		 243 aa  96.3  8e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211177  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6932  beta-lactamase domain protein  36.93 
 
 		 470 aa  96.3  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2738  putative metallo-beta-lactamase family protein  36.27 
 
 		 243 aa  95.9  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.292941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5172  beta-lactamase domain protein  32.26 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21300  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  29.17 
 
 		 456 aa  95.9  1e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617308  hitchhiker  0.0075618 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2790  beta-lactamase domain protein  32.27 
 
 		 246 aa  95.1  2e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3467  beta-lactamase domain-containing protein  32.89 
 
 		 243 aa  95.1  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.919915  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6177  beta-lactamase domain protein  31.78 
 
 		 470 aa  94.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2937  beta-lactamase domain-containing protein  33.19 
 
 		 452 aa  94.7  3e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142956  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1826  beta-lactamase-like protein  31.32 
 
 		 457 aa  94  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3258  beta-lactamase domain-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  93.2  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0866294  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0985  beta-lactamase domain-containing protein  33.47 
 
 		 459 aa  93.2  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  31.56 
 
 		 480 aa  93.2  8e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5378  beta-lactamase domain protein  34.38 
 
 		 462 aa  92.8  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1183  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 476 aa  92.8  1e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0291229  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.42 
 
 		 459 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0359  beta-lactamase domain protein  30.28 
 
 		 476 aa  92  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0076  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4881  beta-lactamase domain-containing protein  31.12 
 
 		 471 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897195  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0074  beta-lactamase domain-containing protein  27.47 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0047  beta-lactamase domain protein  30.87 
 
 		 466 aa  91.3  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3361  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 		 466 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.655276  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1571  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.51 
 
 		 471 aa  90.9  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  27.78 
 
 		 478 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.15 
 
 		 478 aa  89.7  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  28.51 
 
 		 478 aa  89.7  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  28.51 
 
 		 478 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0381  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 		 246 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1223  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 		 246 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2863  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 		 246 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1757  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 		 246 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1570  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 		 246 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06430  metallo-beta-lactamase superfamily protein  29.32 
 
 		 471 aa  89  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0424  metallo-beta-lactamase family protein  31.51 
 
 		 246 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11813  Rhodanese-like protein  27.51 
 
 		 442 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0383  beta-lactamase domain protein  32.9 
 
 		 471 aa  88.2  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  32.19 
 
 		 480 aa  88.6  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 		 205 aa  87.8  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5594  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 470 aa  87.8  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00681465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5691  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  27.35 
 
 		 484 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  27.35 
 
 		 484 aa  87.4  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0946  beta-lactamase domain protein  29.17 
 
 		 467 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  29.15 
 
 		 455 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5312  beta-lactamase-like protein  32.22 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5401  beta-lactamase domain-containing protein  32.22 
 
 		 459 aa  87.4  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.854326  normal  0.319128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34990  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  31.73 
 
 		 453 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.848513  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12628  hypothetical protein  25.64 
 
 		 448 aa  87  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.520905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1619  beta-lactamase-like protein  29.18 
 
 		 479 aa  86.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000199695  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  29.96 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>