164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1234 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01163  hypothetical protein  67.13 
 
 		 510 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000043482  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2460  SpoVR family protein  67.13 
 
 		 510 aa  729    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222624  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1227  SpoVR family protein  70.7 
 
 		 578 aa  749    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.215456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0395  SpoVR family protein  70.64 
 
 		 522 aa  734    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2255  SpoVR family protein  70.49 
 
 		 576 aa  746    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.895608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01173  hypothetical protein  67.13 
 
 		 510 aa  729    Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.00000266726  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1591  SpoVR family protein  70.7 
 
 		 559 aa  745    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.762696  normal  0.699519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3487  SpoVR family protein  65.03 
 
 		 512 aa  699    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.241137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2884  SpoVR family protein  66.26 
 
 		 508 aa  723    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0545  SpoVR like family protein  71.93 
 
 		 520 aa  774    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46890  SpoVR family protein  71.2 
 
 		 520 aa  771    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1675  SpoVR family protein  67.33 
 
 		 510 aa  730    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000834062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2206  SpoVR family protein  68.2 
 
 		 505 aa  721    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.193374  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2858  SpoVR family protein  67.56 
 
 		 507 aa  731    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2727  SpoVR family protein  67.56 
 
 		 507 aa  730    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4633  SpoVR family protein  71.52 
 
 		 520 aa  771    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.217683 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3555  SpoVR family protein  70.29 
 
 		 517 aa  744    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1234  SpoVR family protein  100 
 
 		 509 aa  1066    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2027  SpoVR family protein  70.76 
 
 		 560 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5141  SpoVR family protein  70.08 
 
 		 523 aa  748    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4753  SpoVR family protein  70.9 
 
 		 559 aa  746    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.135349  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1530  SpoVR family protein  70.08 
 
 		 559 aa  740    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.376164  normal  0.61215 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1329  SpoVR family protein  67.13 
 
 		 510 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000362879  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2467  SpoVR family protein  70.14 
 
 		 560 aa  738    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.33279  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2048  SpoVR family protein  70.08 
 
 		 502 aa  742    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0996469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2215  SpoVR family protein  69.47 
 
 		 511 aa  743    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.155219  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0731  SpoVR family protein  71.58 
 
 		 515 aa  748    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2159  SpoVR family protein  67.79 
 
 		 520 aa  731    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.223118  normal  0.683334 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2007  SpoVR family protein  70.49 
 
 		 552 aa  746    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1636  SpoVR family protein  65.45 
 
 		 504 aa  717    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000747677  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0883  SpoVR family protein  66.73 
 
 		 516 aa  716    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.800321  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1949  SpoVR family protein  68.99 
 
 		 513 aa  738    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0479181  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3906  SpoVR family protein  70.7 
 
 		 512 aa  750    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.230436 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1135  SpoVR family protein  70.7 
 
 		 507 aa  745    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1392  SpoVR family protein  64.86 
 
 		 521 aa  717    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1982  SpoVR family protein  67.47 
 
 		 511 aa  736    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148623  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1740  SpoVR family protein  70.08 
 
 		 502 aa  742    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0137532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003983  hypothetical protein  68.84 
 
 		 519 aa  736    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1569  SpoVR family protein  65.58 
 
 		 508 aa  720    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00678887  normal  0.771403 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1644  SpoVR family protein  65.85 
 
 		 508 aa  723    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000992283  hitchhiker  0.0074183 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1744  SpoVR family protein  67.75 
 
 		 513 aa  732    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1512  SpoVR family protein  70.29 
 
 		 559 aa  743    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.854578  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07650  SpoVR family protein  71.02 
 
 		 517 aa  753    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1615  SpoVR family protein  70.7 
 
 		 559 aa  745    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.244629  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1636  SpoVR family protein  65.45 
 
 		 508 aa  719    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00115572  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2245  SpoVR family protein  68.79 
 
 		 519 aa  737    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0368477  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1923  SpoVR family protein  68.85 
 
 		 507 aa  744    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000604699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2706  SpoVR family protein  66 
 
 		 507 aa  735    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3058  SpoVR family protein  70.23 
 
 		 519 aa  739    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.339025  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2385  SpoVR family protein  67.35 
 
 		 522 aa  707    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1689  SpoVR family protein  70.76 
 
 		 560 aa  744    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.107262  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2004  SpoVR family protein  68.17 
 
 		 511 aa  736    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000607664  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3777  SpoVR family protein  67.97 
 
 		 538 aa  723    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130387 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0345  SpoVR family protein  70.76 
 
 		 560 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.327698  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2506  SpoVR family protein  66.87 
 
 		 508 aa  731    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000176707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1779  SpoVR family protein  66.87 
 
 		 508 aa  729    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000504423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1863  SpoVR family protein  70.76 
 
 		 560 aa  744    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1875  SpoVR family protein  70.76 
 
 		 560 aa  744    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.282053  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0816  SpoVR family protein  70.76 
 
 		 560 aa  744    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.563977  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1831  SpoVR family protein  65.77 
 
 		 510 aa  714    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02753  SpoVR family protein  63.6 
 
 		 515 aa  697    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2364  SpoVR family protein  67.13 
 
 		 510 aa  735    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0656278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1684  SpoVR family protein  65.86 
 
 		 505 aa  723    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000208668  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4019  SpoVR family protein  71.05 
 
 		 521 aa  769    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1465  SpoVR family protein  70.45 
 
 		 516 aa  756    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0201  SpoVR family protein  68.17 
 
 		 532 aa  736    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.262543 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0429  SpoVR family protein  70.43 
 
 		 522 aa  733    Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00886666  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1946  SpoVR family protein  67.13 
 
 		 510 aa  734    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.43581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1708  SpoVR family protein  68.25 
 
 		 515 aa  724    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0816979  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0729  SpoVR family protein  70.12 
 
 		 517 aa  755    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1772  SpoVR family protein  67.08 
 
 		 508 aa  732    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000599877  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1514  SpoVR family protein  67.13 
 
 		 510 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1998  SpoVR family protein  66.87 
 
 		 511 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.154757  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1346  SpoVR family protein  67.13 
 
 		 510 aa  727    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00649322  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01539  SpoVR family protein  70.33 
 
 		 519 aa  741    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1291  SpoVR family protein  67.13 
 
 		 510 aa  729    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1333  SpoVR family protein  67.13 
 
 		 510 aa  729    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000395748  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2448  SpoVR family protein  65.38 
 
 		 506 aa  722    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0619548  normal  0.114389 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2747  SpoVR family protein  68.51 
 
 		 511 aa  739    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00597319  decreased coverage  0.0000564649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1960  SpoVR family protein  66.53 
 
 		 504 aa  721    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2002  SpoVR family protein  67.13 
 
 		 510 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.582174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1816  SpoVR family protein  67.28 
 
 		 508 aa  732    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00125161  normal  0.518687 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2329  SpoVR family protein  68.87 
 
 		 542 aa  709    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.851956  normal  0.900002 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1623  SpoVR family protein  70.9 
 
 		 557 aa  745    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.296087 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2362  SpoVR family protein  66.67 
 
 		 511 aa  727    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0105476  normal  0.544957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2569  SpoVR family protein  73.17 
 
 		 517 aa  794    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0246298  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0426  SpoVR family protein  70.29 
 
 		 522 aa  733    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.375889  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1942  SpoVR family protein  67.13 
 
 		 510 aa  733    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.334996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2108  SpoVR family protein  66.87 
 
 		 511 aa  729    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342881  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2437  SpoVR family protein  67.13 
 
 		 510 aa  729    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00512702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1961  SpoVR family protein  67.33 
 
 		 510 aa  730    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00693869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4807  SpoVR family protein  70.7 
 
 		 522 aa  735    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.091895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2156  SpoVR family protein  65.57 
 
 		 508 aa  716    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0915233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6312  SpoVR family protein  56.26 
 
 		 512 aa  555  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0535  SpoVR family protein  55.4 
 
 		 505 aa  553  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.468104  normal  0.689072 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3961  SpoVR family protein  55.78 
 
 		 523 aa  552  1e-156  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0276367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1223  SpoVR family protein  56.65 
 
 		 522 aa  549  1e-155  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.297925  normal  0.137117 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7067  SpoVR family protein  55.33 
 
 		 528 aa  545  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2559  SpoVR family protein  54.47 
 
 		 516 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0555763  normal  0.797029 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2061  SpoVR family protein  54.73 
 
 		 523 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.106296 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>