154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1223 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1223  hypothetical protein  100 
 
 
127 aa  253  4e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1884  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.63 
 
 
126 aa  138  3e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.173624  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.12 
 
 
124 aa  137  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0960  glyoxalase family protein  59.22 
 
 
108 aa  122  1e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.189194  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1466  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  49.19 
 
 
128 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27002  predicted protein  51.54 
 
 
142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00346607  normal  0.11675 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1288  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.22 
 
 
123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0253  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.85 
 
 
129 aa  115  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3087  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  42.37 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.867854 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0209  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.34 
 
 
123 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.59 
 
 
120 aa  90.9  6e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0205  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.5 
 
 
123 aa  90.1  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00140373 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3961  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.88 
 
 
121 aa  88.2  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3119  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.32 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2287  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.75 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0860  hypothetical protein  30 
 
 
120 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.03 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0281  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.77 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1471  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
129 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.441246  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3464  hypothetical protein  32.76 
 
 
148 aa  55.5  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0898  hypothetical protein  30 
 
 
120 aa  53.9  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4476  hypothetical protein  27.5 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.147519 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0970  hypothetical protein  29.17 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000478568  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
129 aa  53.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.65593 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0658  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.58 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.283538  normal  0.26359 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2367  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.69 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.015885 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1246  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.4 
 
 
121 aa  52  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.135357 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0769  hypothetical protein  27.5 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.147179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0717  lactoylglutathione lyase  27.5 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000259775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0806  hypothetical protein  27.5 
 
 
119 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00929856  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0704  lactoylglutathione lyase  27.5 
 
 
119 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0037968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0902  hypothetical protein  27.5 
 
 
117 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9505800000000003e-44 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1883  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
137 aa  50.4  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1779  hypothetical protein  28.45 
 
 
146 aa  50.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1562  hypothetical protein  35.24 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.317926  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0601  putative glyoxalase  35.24 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2042  hypothetical protein  35.24 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.546279  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2194  glyoxalase family protein  35.24 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0375114  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2107  glyoxalase family protein  35.24 
 
 
152 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.390472  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0721  hypothetical protein  35.24 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.900837  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0096  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.14 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0588  putative dioxygenase  30.83 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.258406  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1981  hypothetical protein  35.48 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2879  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.04 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0659  hypothetical protein  25.83 
 
 
118 aa  48.9  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3746  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.83 
 
 
128 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2133  hypothetical protein  26.95 
 
 
168 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.733636 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1428  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3795  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  22.83 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2613  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.85 
 
 
128 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4485  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.03 
 
 
131 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0261666  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1785  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
152 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439636  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3214  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.59 
 
 
135 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.521696  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2439  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.92 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.509697 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1250  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 
152 aa  47.8  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0005  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.06 
 
 
138 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.742613  hitchhiker  0.00144174 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4015  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.07 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.328603  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07780  glyoxalase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G15060)  50 
 
 
135 aa  47  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.534108 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0675  glyoxylase family protein  24.41 
 
 
128 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2963  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 
129 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06310  hypothetical protein  24.79 
 
 
127 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.454344  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0005  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.08 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.100474 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2154  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1766  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.28 
 
 
196 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.252016  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0995  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  34.11 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.44614  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2600  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.27 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000115728  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06791  glyoxalase I  26.4 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0508996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3321  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
128 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0453  glyoxalase family protein  25.98 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0502  lactoylglutathione lyase (glyoxalase I)  26.19 
 
 
136 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3197  methylmalonyl-CoA epimerase  31.07 
 
 
134 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07081  glyoxalase I  26.4 
 
 
129 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.199659  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2679  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.6 
 
 
137 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.859841 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0348  glyoxylase I family protein  28.93 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4542  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  36.59 
 
 
160 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0746  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0097338 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0444  glyoxalase I  25.98 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282289  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3148  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5647  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.23 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.680123  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0652  glyoxalase I  26.4 
 
 
129 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3770  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.2 
 
 
133 aa  43.9  0.0008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0196484  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0719  lactoylglutathione lyase  23.36 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2825  glyoxylase family protein  24.41 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.090794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1958  hypothetical protein  26.77 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1309  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24 
 
 
128 aa  42.7  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.35828  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.08 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933623  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0734  glyoxylase family protein  23.85 
 
 
136 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.784175  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3244  glyoxylase family protein  25.83 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.201718  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.97 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0815  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.3 
 
 
138 aa  42.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1242  hypothetical protein  28.24 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4963  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.32 
 
 
160 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.460855  normal  0.230969 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04140  Glyoxalase/Bleomycin resistance/Dioxygenase superfamily protein  32.23 
 
 
152 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00679  glyoxylase I family protein  26.98 
 
 
127 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2903  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.24 
 
 
137 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.991894  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4919  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.27 
 
 
129 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206926  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0531  lactoylglutathione lyase  26.98 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000101735  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1199  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.65 
 
 
287 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0199  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.03 
 
 
146 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.616516 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2924  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.71 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>