More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1162 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1162  serine O-acetyltransferase  100 
 
 
252 aa  515  1.0000000000000001e-145  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000000254376  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0811  serine O-acetyltransferase  67.6 
 
 
250 aa  362  4e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000161338  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1947  Serine O-acetyltransferase  66 
 
 
249 aa  342  4e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0360289  normal  0.182379 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2208  serine O-acetyltransferase  63.53 
 
 
255 aa  324  7e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.18753  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0870  serine O-acetyltransferase  63.45 
 
 
261 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.239622 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0840  serine O-acetyltransferase  63.45 
 
 
261 aa  319  3e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.332483  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0883  serine O-acetyltransferase  63.05 
 
 
261 aa  318  6e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.25583  hitchhiker  0.00547616 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4338  serine O-acetyltransferase  63.05 
 
 
261 aa  318  7e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.790594  hitchhiker  0.000000000213243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3513  serine O-acetyltransferase  60.87 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.599692  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0616  serine O-acetyltransferase  60.8 
 
 
260 aa  311  4.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175554  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4614  Serine O-acetyltransferase  62.35 
 
 
258 aa  311  5.999999999999999e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103477  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1647  Serine O-acetyltransferase  60 
 
 
258 aa  310  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.421596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1297  serine acetyltransferase  63.75 
 
 
258 aa  310  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.613777  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1421  serine O-acetyltransferase  62.92 
 
 
258 aa  309  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1235  Serine O-acetyltransferase  63.71 
 
 
258 aa  308  4e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.377019  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14700  serine O-acetyltransferase  63.33 
 
 
258 aa  308  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.74383  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01353  serine acetyltransferase  61.54 
 
 
274 aa  304  7e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000779312  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40420  Serine O-acetyltransferase  62.1 
 
 
259 aa  304  1.0000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2061  Serine O-acetyltransferase  65.09 
 
 
268 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.145784  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2839  Serine O-acetyltransferase  60.16 
 
 
256 aa  301  6.000000000000001e-81  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.700144  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1291  Serine O-acetyltransferase  60.43 
 
 
273 aa  300  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.147219  normal  0.0151136 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1130  serine O-acetyltransferase  61.47 
 
 
269 aa  298  7e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1246  serine O-acetyltransferase  63.09 
 
 
280 aa  296  2e-79  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1120  serine O-acetyltransferase  57.66 
 
 
259 aa  296  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1662  serine O-acetyltransferase  61.7 
 
 
261 aa  294  7e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.317013  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2686  serine O-acetyltransferase  61.7 
 
 
261 aa  294  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145985  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2602  serine O-acetyltransferase  61.7 
 
 
261 aa  294  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1438  serine O-acetyltransferase  61.7 
 
 
261 aa  294  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2551  serine O-acetyltransferase  61.7 
 
 
261 aa  294  7e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3151  serine O-acetyltransferase  61.7 
 
 
261 aa  294  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2165  serine O-acetyltransferase  61.7 
 
 
261 aa  294  7e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1236  serine O-acetyltransferase  60.61 
 
 
267 aa  294  9e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00306075  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2262  serine acetyltransferase  58.72 
 
 
273 aa  294  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2102  serine O-acetyltransferase  62.77 
 
 
257 aa  293  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.348935 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1817  serine O-acetyltransferase  58.72 
 
 
273 aa  293  1e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000171245  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2151  serine O-acetyltransferase  58.72 
 
 
273 aa  293  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00432813  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2282  serine O-acetyltransferase  58.72 
 
 
273 aa  293  1e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000478112  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5994  serine O-acetyltransferase  62.34 
 
 
267 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2083  serine O-acetyltransferase  62.34 
 
 
267 aa  293  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.097824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1959  serine O-acetyltransferase  59.15 
 
 
273 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000137808  hitchhiker  0.00459897 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1198  serine O-acetyltransferase  61.9 
 
 
280 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0792406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2388  serine O-acetyltransferase  59.15 
 
 
273 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000558111  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1395  serine O-acetyltransferase  58.61 
 
 
271 aa  292  3e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00513134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2399  serine O-acetyltransferase  59.15 
 
 
273 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000148816  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2504  serine O-acetyltransferase  59.15 
 
 
273 aa  292  3e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000959459  normal  0.0292535 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1988  serine O-acetyltransferase  62.34 
 
 
257 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.436626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1456  serine O-acetyltransferase  59.15 
 
 
273 aa  291  6e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000250331  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1737  serine O-acetyltransferase  58.3 
 
 
273 aa  291  6e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000134681  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2118  serine O-acetyltransferase  62.34 
 
 
257 aa  291  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.339976  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1936  serine O-acetyltransferase  60.43 
 
 
260 aa  291  8e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0874161  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5389  Serine O-acetyltransferase  61.47 
 
 
267 aa  291  9e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.66328 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1097  serine O-acetyltransferase  58.89 
 
 
248 aa  290  1e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.486928 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0828  serine O-acetyltransferase  59.74 
 
 
275 aa  290  1e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.5261 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1003  serine O-acetyltransferase  58.89 
 
 
248 aa  289  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.169467  normal  0.127714 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2873  Serine O-acetyltransferase  57.87 
 
 
273 aa  288  4e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.78055  hitchhiker  0.0000000230689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1220  serine O-acetyltransferase  57.14 
 
 
259 aa  287  1e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2426  serine O-acetyltransferase  57.14 
 
 
273 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.563474  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2515  serine O-acetyltransferase  56.18 
 
 
278 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0135157  hitchhiker  0.0000144493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2611  serine acetyltransferase  59.23 
 
 
261 aa  285  5.999999999999999e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.513784  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1794  serine O-acetyltransferase  55.16 
 
 
262 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.837639  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1162  O-acetylserine synthase  58.57 
 
 
268 aa  284  7e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.973633  normal  0.323446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2188  serine O-acetyltransferase  60.43 
 
 
280 aa  284  9e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2319  serine O-acetyltransferase  57.45 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0101621  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1621  Serine O-acetyltransferase  55.12 
 
 
281 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.645411  normal  0.170015 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1774  serine O-acetyltransferase  56.17 
 
 
273 aa  282  5.000000000000001e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0396638  hitchhiker  0.00060265 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2890  serine O-acetyltransferase  54.3 
 
 
257 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1382  serine O-acetyltransferase  54.65 
 
 
259 aa  280  1e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0271365  normal  0.022365 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1486  serine O-acetyltransferase  56.6 
 
 
273 aa  279  3e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.517534  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3291  serine O-acetyltransferase  54.65 
 
 
259 aa  274  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.434355 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1080  serine O-acetyltransferase  58.17 
 
 
247 aa  274  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0884216  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1117  Serine O-acetyltransferase  57.37 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.665458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3065  serine O-acetyltransferase  57.08 
 
 
237 aa  272  5.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000402378  unclonable  0.000000654619 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1047  serine O-acetyltransferase  53.26 
 
 
263 aa  271  6e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0269774 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0965  serine O-acetyltransferase  52.87 
 
 
263 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.305959  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2076  serine O-acetyltransferase  53.41 
 
 
265 aa  268  5.9999999999999995e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0773346  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1397  Serine O-acetyltransferase  58.44 
 
 
258 aa  266  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.11781  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3564  serine O-acetyltransferase  53.52 
 
 
256 aa  263  3e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4258  serine O-acetyltransferase  52.49 
 
 
260 aa  260  1e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.810533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0820  serine O-acetyltransferase  56.19 
 
 
264 aa  259  2e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0119885  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0671  serine O-acetyltransferase  57.99 
 
 
249 aa  259  4e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1644  serine O-acetyltransferase  55.75 
 
 
222 aa  257  1e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0400856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01650  nitrogen fixation serine O-acetyltransferase CysE1  55.6 
 
 
265 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2569  serine O-acetyltransferase  55.75 
 
 
222 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000552654 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2311  serine O-acetyltransferase  50.92 
 
 
274 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.463939  normal  0.288686 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1244  serine O-acetyltransferase  49.42 
 
 
292 aa  255  6e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000603687  normal  0.0426747 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1862  serine O-acetyltransferase  57.41 
 
 
228 aa  254  8e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  9.89239e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1495  serine O-acetyltransferase  53.42 
 
 
225 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000268046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2572  serine acetyltransferase  53.85 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.289308  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2029  Serine O-acetyltransferase  55.95 
 
 
254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.057307  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1223  serine O-acetyltransferase  55.41 
 
 
258 aa  250  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000216862 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1505  serine O-acetyltransferase  55.41 
 
 
258 aa  250  1e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0852  serine O-acetyltransferase  51.63 
 
 
252 aa  249  2e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0151  serine O-acetyltransferase  54.77 
 
 
258 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1180  serine O-acetyltransferase  50.99 
 
 
303 aa  249  3e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1210  serine O-acetyltransferase  50.59 
 
 
303 aa  249  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.560447 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1830  serine acetyltransferase  54.78 
 
 
249 aa  249  4e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.436553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2614  serine O-acetyltransferase  52.28 
 
 
233 aa  248  5e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000169029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0748  serine O-acetyltransferase  54.42 
 
 
230 aa  248  6e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000445462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0870  Serine O-acetyltransferase  55.35 
 
 
225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.504104  normal  0.0275303 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5874  serine O-acetyltransferase  50.4 
 
 
263 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864914  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>