241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1103 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  100 
 
 		 312 aa  647    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  49.48 
 
 		 315 aa  279  5e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  36.93 
 
 		 334 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  32.81 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  30.82 
 
 		 337 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  31.58 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  30.15 
 
 		 321 aa  122  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  30.36 
 
 		 310 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  28.17 
 
 		 333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  29.06 
 
 		 310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  28.71 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  29.96 
 
 		 315 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  30.11 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  31.43 
 
 		 321 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  28.92 
 
 		 308 aa  109  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  30.45 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  30.89 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  28.45 
 
 		 315 aa  103  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  26.72 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  30.54 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  29.37 
 
 		 298 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  25.27 
 
 		 287 aa  97.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  27.74 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  29.27 
 
 		 342 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  26.29 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  29.03 
 
 		 318 aa  95.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  28.68 
 
 		 327 aa  95.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  28.57 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  27.18 
 
 		 340 aa  94  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 318 aa  92.4  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  28.32 
 
 		 314 aa  92.4  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.47 
 
 		 312 aa  90.5  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.74 
 
 		 305 aa  90.9  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  29.02 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 322 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 		 309 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  25.61 
 
 		 351 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  27.8 
 
 		 332 aa  84.3  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 346 aa  83.6  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  28.41 
 
 		 325 aa  82.8  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  23.31 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  29.54 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2765  beta-lactamase domain protein  30 
 
 		 304 aa  80.9  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00567584  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  24.75 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  25.83 
 
 		 330 aa  79.3  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  26.38 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  30.37 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  25.52 
 
 		 364 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  29.15 
 
 		 309 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  25.34 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1824  beta-lactamase domain-containing protein  26.55 
 
 		 342 aa  77.8  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00672926 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  25 
 
 		 364 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  22.54 
 
 		 308 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  30.37 
 
 		 307 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  24.38 
 
 		 323 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0472  hydrolase, putative  26.69 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0389397 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  26.1 
 
 		 313 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  28.16 
 
 		 312 aa  75.1  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  25.96 
 
 		 319 aa  73.9  0.000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  26.81 
 
 		 312 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 337 aa  73.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3306  beta-lactamase domain protein  25.95 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0686  beta-lactamase domain-containing protein  30.48 
 
 		 597 aa  73.2  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.459688 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1652  beta-lactamase domain-containing protein  26.46 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.685243  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1240  beta-lactamase domain protein  25.28 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0886366 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  25.58 
 
 		 310 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1667  metallo-beta-lactamase family protein  24.09 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  25.96 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  26.38 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2612  beta-lactamase domain protein  28.57 
 
 		 342 aa  67.4  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.584413  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1904  metallo-beta-lactamase family protein  23.82 
 
 		 300 aa  67  0.0000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7059  beta-lactamase domain protein  26.09 
 
 		 295 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  26.51 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0989  beta-lactamase domain-containing protein  25.7 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27.92 
 
 		 318 aa  63.9  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  24.45 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  25.64 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0462  beta-lactamase-like  23.13 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  24.44 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 		 319 aa  62  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  24.71 
 
 		 312 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1677  metallo-beta-lactamase family protein  27.13 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  27.08 
 
 		 321 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1033  beta-lactamase domain protein  26.05 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4537  beta-lactamase domain protein  24.32 
 
 		 314 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.630097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1084  beta-lactamase domain protein  25.2 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  30.49 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1577  beta-lactamase domain protein  27.65 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  24.11 
 
 		 294 aa  58.2  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1197  beta-lactamase domain protein  24.75 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00755  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  23.24 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.168876  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  22.27 
 
 		 316 aa  56.6  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0801  beta-lactamase domain-containing protein  28.14 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.451978  normal  0.510072 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1285  beta-lactamase domain protein  28.21 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3305  beta-lactamase domain protein  28.02 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0149024  normal  0.0144108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  24.87 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.533019 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1264  beta-lactamase domain-containing protein  27.55 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  26.37 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1614  Beta-lactamase-like  24.65 
 
 		 339 aa  54.7  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>