187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1026 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1026  molybdopterin synthase subunit MoaD  100 
 
 
83 aa  159  9e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00122387 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5152  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.24 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1789  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.06 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1761  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.06 
 
 
85 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.336452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1422  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.06 
 
 
85 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0783343  hitchhiker  0.00713851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1242  molybdopterin synthase subunit MoaD  49.4 
 
 
95 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00579746 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1875  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.06 
 
 
85 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.306634  hitchhiker  0.0000380608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1809  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 
85 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  0.0687127 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6228  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1851  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 
85 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2378  molybdopterin synthase subunit MoaD  45.88 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.693662 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1267  molybdopterin converting factor, subunit 1  47.06 
 
 
85 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782694  normal  0.789064 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1990  molybdopterin synthase subunit MoaD  47.06 
 
 
85 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.163158  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1381  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2393  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1871  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0025  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.129719  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2228  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.423824  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2266  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1143  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.71 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0546773  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1916  molybdopterin converting factor, subunit 1  48.19 
 
 
83 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2201  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.53 
 
 
87 aa  72  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00732889  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1262  molybdopterin synthase subunit MoaD  45.78 
 
 
83 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.22086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1963  molybdopterin synthase subunit MoaD  48.24 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000246568  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1206  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.88 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0937261  normal  0.054549 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0441  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.35 
 
 
85 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0934  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.53 
 
 
85 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  49.4 
 
 
86 aa  70.1  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.906583  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3104  molybdopterin-converting factor subunit 1  42.17 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.493028  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1331  molybdopterin MPT converting factor subunit 1  44.71 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3144  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 
83 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.376109  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3917  molybdopterin synthase subunit MoaD  45.57 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1555  molybdopterin converting factor subunit 1  47.06 
 
 
85 aa  67.4  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1835  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
83 aa  67  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1545  molybdopterin synthase subunit MoaD  50 
 
 
84 aa  67  0.00000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0478  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.15 
 
 
86 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2861  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.12 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.939434  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2524  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 
83 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.39989 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3632  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.3 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.220789 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2341  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 
83 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12358  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2733  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.9 
 
 
82 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.831217  normal  0.0341849 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2555  molybdopterin converting factor, subunit 1  46.99 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3202  molybdopterin synthase subunit MoaD  46.99 
 
 
87 aa  64.3  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.262131  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0780  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
86 aa  63.9  0.0000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0696937 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1072  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.68 
 
 
82 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2609  molybdopterin synthase subunit MoaD  44.58 
 
 
88 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.503045  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5215  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
91 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.532567  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2591  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.82 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.257626  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1784  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.35 
 
 
82 aa  61.2  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.564106 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1230  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.48 
 
 
84 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000402219 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1035  molybdopterin synthase subunit MoaD  43.9 
 
 
80 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.964546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2274  molybdopterin converting factor, subunit 1  45.78 
 
 
83 aa  61.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0697  molybdopterin converting factor, subunit 1  40 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.326047  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0688  molybdopterin converting factor, subunit 1  40 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2667  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
83 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1084  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.48 
 
 
84 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000213889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1725  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.96 
 
 
83 aa  60.5  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.628781  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2814  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.17 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.73394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2194  molybdopterin synthase subunit MoaD  40.96 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000704898  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2481  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.53 
 
 
77 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2146  thiamineS  39.29 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2021  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
83 aa  59.3  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03858  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
81 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0049  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.18 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.372094  normal  0.038517 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0903  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
83 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2432  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.9 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.554739  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0159  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000222871  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2951  molybdopterin converting factor, subunit 1  43.02 
 
 
77 aa  57.8  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.743129  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3593  molybdopterin synthase subunit MoaD  42.35 
 
 
85 aa  57.8  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0280685  normal  0.372118 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1191  molybdopterin converting factor small subunit  41.67 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1293  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
82 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202321  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4432  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
81 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2999  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.111426  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1248  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  38.55 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13240  molybdopterin converting factor, small subunit  41.67 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.494313  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2227  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
83 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00189001 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1160  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
223 aa  56.6  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.60051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1436  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.82 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2654  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1068  molybdopterin converting factor, subunit 1:MoaD_  40.96 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.679928  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0103  molybdopterin converting factor, subunit 1  38.1 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00524284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1279  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.287689  normal  0.255323 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2949  molybdopterin synthase small subunit  37.8 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.446076  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0547  molybdopterin synthase small subunit  39.02 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1828  molybdopterin converting factor, subunit 1  41.67 
 
 
83 aa  56.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4556  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.17 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.896791 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1515  molybdopterin synthase small subunit  39.02 
 
 
81 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1175  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.421985  normal  0.228216 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11270  Molybdopterin converting factor, small subunit  45.24 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.649649  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2523  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.02 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3527  molybdenum cofactor biosynthesis protein D  39.29 
 
 
83 aa  55.1  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5403  molybdopterin converting factor, subunit 1  40.96 
 
 
83 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1155  molybdopterin converting factor, subunit 1  42.35 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.291215 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2346  molybdopterin converting factor, subunit 1  44.58 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1323  molybdopterin synthase small subunit  39.02 
 
 
81 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.444725  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1714  molybdopterin converting factor, subunit 1  36.14 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.157129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3102  molybdopterin converting factor, subunit 1  39.76 
 
 
86 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.482968  normal  0.232642 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0931  molybdopterin synthase small subunit  37.8 
 
 
81 aa  53.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0868  molybdopterin synthase small subunit  37.8 
 
 
81 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0855763  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0954  molybdopterin synthase small subunit  37.8 
 
 
81 aa  52.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>