More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1023 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1023  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  100 
 
 
327 aa  665  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165145 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0336  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  63.38 
 
 
327 aa  432  1e-120  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2612  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  61.47 
 
 
327 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.635928 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0143  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.74 
 
 
334 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.391723 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0591  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  60.74 
 
 
328 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  54.29 
 
 
329 aa  373  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.763521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2577  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  54.66 
 
 
323 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.646455  normal  0.38451 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2294  molybdenum cofactor synthesis-like protein  44.71 
 
 
343 aa  284  1e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.819438  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0518  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  47.62 
 
 
365 aa  282  5e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0158  molybdenum cofactor synthesis-like  43.33 
 
 
331 aa  282  5e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  1.94349e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2766  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.88 
 
 
331 aa  282  7e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.237766  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1999  radical SAM:molybdenum cofactor synthesis C-terminal  44.79 
 
 
357 aa  279  5e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.655025  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.65 
 
 
332 aa  277  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.412863  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3898  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.43 
 
 
350 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.587408  normal  0.400488 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0124  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.04 
 
 
338 aa  275  6e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.592578  normal  0.0245829 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.54 
 
 
332 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0620358  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3826  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.65 
 
 
331 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.488803  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44970  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.95 
 
 
331 aa  275  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1878  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.48 
 
 
355 aa  275  1e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.0061453  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1387  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.97 
 
 
351 aa  275  1e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2254  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.67 
 
 
344 aa  274  1e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483047  normal  0.0526989 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0235  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.18 
 
 
344 aa  273  4e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2516  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.94 
 
 
332 aa  273  4e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0514833  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1785  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.65 
 
 
351 aa  272  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2586  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.27 
 
 
340 aa  271  8e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.64 
 
 
327 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3480  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.11 
 
 
344 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.460525 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7629  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.32 
 
 
342 aa  271  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.08 
 
 
335 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.485207  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1605  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  47.13 
 
 
331 aa  269  4e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2076  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.34 
 
 
329 aa  269  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000199937  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1577  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.61 
 
 
339 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.187872  normal  0.347401 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1219  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.15 
 
 
343 aa  267  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3388  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.64 
 
 
332 aa  267  2e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3906  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.37 
 
 
334 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2025  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.51 
 
 
348 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0930422  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.31 
 
 
326 aa  266  3e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.76 
 
 
335 aa  266  3e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.97 
 
 
340 aa  265  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1477  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.15 
 
 
343 aa  265  6e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4127  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.07 
 
 
334 aa  265  1e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1558  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.75 
 
 
334 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6237  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1239  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.09 
 
 
329 aa  262  5e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30330  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.78 
 
 
331 aa  262  5e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2247  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.35 
 
 
348 aa  262  6e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3287  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.4 
 
 
345 aa  261  9e-69  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.637281 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2191  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.11 
 
 
344 aa  261  9e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.218235  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1290  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.2 
 
 
336 aa  261  1e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0333256  normal  0.347849 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2231  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.81 
 
 
345 aa  261  1e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.813022  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4597  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.07 
 
 
334 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.770379 
 
 
-
 
NC_004310  BR0958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.98 
 
 
344 aa  261  1e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.105392  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.79 
 
 
329 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.254776  normal  0.121323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3389  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.71 
 
 
345 aa  260  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.142655 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1291  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.07 
 
 
334 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0056  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.55 
 
 
348 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0808361  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.47 
 
 
330 aa  261  2e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.342071  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2073  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.07 
 
 
344 aa  259  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.292381  normal  0.516517 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2774  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.41 
 
 
344 aa  260  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00282433  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0948  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.67 
 
 
344 aa  259  4e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1055  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  48.04 
 
 
347 aa  259  6e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0726639 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1315  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.07 
 
 
341 aa  258  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.374397  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2072  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.92 
 
 
329 aa  258  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2650  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.85 
 
 
344 aa  258  9e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2877  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.85 
 
 
344 aa  258  9e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.593908  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0925  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.01 
 
 
339 aa  257  2e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3688  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.49 
 
 
328 aa  257  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1615  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.97 
 
 
596 aa  257  2e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3884  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.62 
 
 
327 aa  257  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.31 
 
 
327 aa  256  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4462  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.62 
 
 
327 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1582  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.28 
 
 
349 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.519622  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3972  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40 
 
 
327 aa  256  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.76185 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4267  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.62 
 
 
327 aa  256  5e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4724  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.62 
 
 
327 aa  255  6e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.49 
 
 
328 aa  255  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0460197  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.62 
 
 
327 aa  255  9e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2703  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.11 
 
 
345 aa  254  1e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2052  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.86 
 
 
344 aa  253  2e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.128137 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3879  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.31 
 
 
327 aa  254  2e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2357  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  39.76 
 
 
331 aa  254  2e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.719976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1879  molybdenum cofactor synthesis-like  44.48 
 
 
354 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6712  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.22 
 
 
346 aa  253  4e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.420701  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0077  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40 
 
 
327 aa  253  4e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1655  molybdenum cofactor synthesis-like protein  44.91 
 
 
337 aa  252  7e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0082  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.88 
 
 
328 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6195  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.83 
 
 
346 aa  251  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2122  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  45.51 
 
 
340 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1905  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  43.59 
 
 
329 aa  249  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349909  unclonable  1.06016e-05 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1265  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.26 
 
 
336 aa  247  2e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.522887  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1354  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.28 
 
 
326 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.935737  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2931  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.67 
 
 
326 aa  241  8e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4099  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.02 
 
 
328 aa  241  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  42.6 
 
 
340 aa  239  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2958  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.08 
 
 
325 aa  237  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5676  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.22 
 
 
340 aa  236  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0373  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.92 
 
 
323 aa  236  3e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.96 
 
 
328 aa  236  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1520  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  44.35 
 
 
346 aa  235  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.886892 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1990  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  42.22 
 
 
335 aa  235  7e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3777  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.74 
 
 
338 aa  235  8e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.579463  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>