More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1012 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01682  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  46.47 
 
 		 795 aa  691    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0961927  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1929  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.47 
 
 		 795 aa  691    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000518334  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1793  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.47 
 
 		 795 aa  691    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000955232  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1457  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.12 
 
 		 809 aa  763    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2470  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.23 
 
 		 793 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.24212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1740  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.17 
 
 		 810 aa  777    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2509  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.74 
 
 		 792 aa  679    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0698  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  52.14 
 
 		 791 aa  728    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.155841  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2215  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.08 
 
 		 795 aa  675    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.188862 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.41 
 
 		 809 aa  721    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3476  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.48 
 
 		 793 aa  683    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00698698 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2995  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.99 
 
 		 807 aa  665    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0870176  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1932  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.47 
 
 		 795 aa  691    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000047761  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1750  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.56 
 
 		 816 aa  669    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0199771 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2086  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.09 
 
 		 795 aa  677    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2383  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  47.54 
 
 		 792 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295144  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1473  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.09 
 
 		 792 aa  699    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000187632  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1005  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.37 
 
 		 818 aa  704    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.85 
 
 		 795 aa  686    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00723547  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1091  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.17 
 
 		 810 aa  777    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.39692  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2765  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.38 
 
 		 793 aa  648    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2638  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.25 
 
 		 793 aa  648    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2167  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.42 
 
 		 792 aa  676    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1835  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.85 
 
 		 795 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000347523  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2672  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  54.28 
 
 		 794 aa  810    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1729  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.85 
 
 		 795 aa  675    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2469  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.4 
 
 		 795 aa  647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228112  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1280  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.23 
 
 		 815 aa  724    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.477194  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3094  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.16 
 
 		 821 aa  661    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.102742 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1012  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  100 
 
 		 781 aa  1544    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0141167 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1477  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.22 
 
 		 795 aa  688    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.020093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1466  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.85 
 
 		 795 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1896  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.05 
 
 		 810 aa  776    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.963354  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1145  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  48.74 
 
 		 793 aa  716    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.158362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1936  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.85 
 
 		 792 aa  680    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0927196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1874  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.58 
 
 		 795 aa  665    Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000755096  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2751  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  49.63 
 
 		 811 aa  761    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0848577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4620  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.25 
 
 		 809 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.52188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0432  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.39 
 
 		 792 aa  741    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0198  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.17 
 
 		 810 aa  777    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0148461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.1 
 
 		 795 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00142202  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1433  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.85 
 
 		 795 aa  691    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.030197 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1553  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.62 
 
 		 810 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1955  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.35 
 
 		 795 aa  688    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.111711  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1662  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.39 
 
 		 793 aa  664    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1825  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.1 
 
 		 795 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.713489  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1829  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.21 
 
 		 795 aa  670    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000186413  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1404  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.87 
 
 		 809 aa  753    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0492  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  52.4 
 
 		 792 aa  808    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.229173  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1908  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.33 
 
 		 795 aa  664    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00255913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02445  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.2 
 
 		 795 aa  648    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.202536  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2590  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.23 
 
 		 810 aa  768    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2597  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.08 
 
 		 795 aa  673    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0200655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1774  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.19 
 
 		 809 aa  757    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.35718 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1901  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.58 
 
 		 795 aa  667    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00294003  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1883  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.77 
 
 		 806 aa  708    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1981  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  49.37 
 
 		 792 aa  696    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.134276  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1341  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.3 
 
 		 810 aa  681    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1582  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.64 
 
 		 816 aa  694    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1918  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.47 
 
 		 795 aa  691    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.333448  normal  0.421493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1998  phenylalanyl-tRNA synthetase beta subunit  54.53 
 
 		 784 aa  805    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.109142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2107  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.61 
 
 		 808 aa  682    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.123782  normal  0.168772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1376  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50 
 
 		 811 aa  763    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.44726 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1603  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.08 
 
 		 795 aa  658    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.643795  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1410  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.09 
 
 		 792 aa  699    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0168176  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1804  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  49.56 
 
 		 793 aa  701    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2149  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.92 
 
 		 795 aa  701    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.625217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2007  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.85 
 
 		 795 aa  690    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.693647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1165  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.41 
 
 		 815 aa  731    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.827312  normal  0.855752 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2800  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.67 
 
 		 802 aa  647    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0968  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.17 
 
 		 810 aa  777    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2056  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.04 
 
 		 790 aa  686    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0998  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.12 
 
 		 809 aa  763    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1717  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.05 
 
 		 810 aa  775    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2494  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  43.95 
 
 		 795 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0476201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1972  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.3 
 
 		 793 aa  678    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.025038 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2395  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.38 
 
 		 814 aa  677    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.990048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3220  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.61 
 
 		 793 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.363224 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0861  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.47 
 
 		 795 aa  672    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0924508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2067  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.46 
 
 		 795 aa  672    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0223695  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1809  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.34 
 
 		 795 aa  682    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2168  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.34 
 
 		 795 aa  682    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0570245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0763  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.94 
 
 		 797 aa  753    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1709  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.58 
 
 		 795 aa  670    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.739174  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0844  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.59 
 
 		 795 aa  682    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000714216  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1364  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  50.87 
 
 		 809 aa  753    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28710  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  48.61 
 
 		 792 aa  678    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.458463  decreased coverage  0.000000000220958 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02093  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.47 
 
 		 806 aa  665    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1534  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.17 
 
 		 810 aa  777    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.540635  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0834  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.99 
 
 		 818 aa  724    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2592  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  44.15 
 
 		 794 aa  653    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0126631 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2854  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.24 
 
 		 812 aa  671    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.440462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1480  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  51.12 
 
 		 809 aa  763    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4611  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.57 
 
 		 815 aa  666    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16834  normal  0.0519802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1449  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.85 
 
 		 795 aa  689    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1864  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  45.34 
 
 		 795 aa  681    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1972  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  47.22 
 
 		 809 aa  721    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2849  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  46.11 
 
 		 808 aa  681    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0102687 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1404  phenylalanyl-tRNA synthetase, beta subunit  46.1 
 
 		 795 aa  696    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1952  phenylalanyl-tRNA synthetase subunit beta  44.91 
 
 		 795 aa  687    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>