More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1010 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1010  50S ribosomal protein L20  100 
 
 		 119 aa  236  9e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0761247  hitchhiker  0.00845124 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0490  50S ribosomal protein L20  81.36 
 
 		 119 aa  196  1.0000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.397114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3022  50S ribosomal protein L20  78.15 
 
 		 119 aa  191  2e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1278  50S ribosomal protein L20  76.27 
 
 		 118 aa  187  4e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144087  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1163  50S ribosomal protein L20  76.27 
 
 		 118 aa  187  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.322945  normal  0.917296 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1580  50S ribosomal protein L20  75.42 
 
 		 118 aa  182  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1644  50S ribosomal protein L20  75.42 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187432  normal  0.12551 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2000  50S ribosomal protein L20  73.95 
 
 		 120 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0210248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1974  50S ribosomal protein L20  74.58 
 
 		 118 aa  180  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1339  50S ribosomal protein L20  77.31 
 
 		 119 aa  180  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1455  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0966  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215823  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1093  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0111531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1893  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.292968  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4618  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0133372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1555  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1776  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.462713 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2592  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.808755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1738  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.183281  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1536  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.25728  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0200  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00269198  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0996  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1715  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179133  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1478  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  179  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.727027  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2753  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  178  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0178087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1402  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1374  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  178  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.107797  normal  0.806931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1362  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  178  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.626846  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4613  50S ribosomal protein L20  73.95 
 
 		 119 aa  175  2e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167314  hitchhiker  0.00727098 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1451  50S ribosomal protein L20  73.95 
 
 		 119 aa  175  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2397  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  174  3e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.703088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2105  50S ribosomal protein L20  73.95 
 
 		 119 aa  174  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.136209  normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2856  50S ribosomal protein L20  71.43 
 
 		 120 aa  173  8e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.366682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1873  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  172  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.855478  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3092  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 		 119 aa  171  1.9999999999999998e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.493016  normal  0.0864607 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2851  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 119 aa  171  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0110251 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2674  50S ribosomal protein L20  78.64 
 
 		 119 aa  170  6.999999999999999e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.36852 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1748  50S ribosomal protein L20  72.03 
 
 		 118 aa  169  1e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0111676 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0915  ribosomal protein L20  69.75 
 
 		 119 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1143  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000341848  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2029  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 119 aa  165  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000108915  hitchhiker  0.0000236508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2123  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 119 aa  164  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000359041  normal  0.016896 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1768  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 119 aa  164  5e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000021709  normal  0.0190948 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2594  ribosomal protein L20  69.49 
 
 		 118 aa  163  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649926  hitchhiker  0.00570674 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2302  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 118 aa  163  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2219  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 118 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000521277  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2187  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 118 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000144083  normal  0.0378081 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1708  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 118 aa  163  8e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0547661  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2151  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 118 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000337835  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2327  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 118 aa  163  8e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000174207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1958  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 118 aa  163  8e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000262165  normal  0.497021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2018  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 118 aa  163  8e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000148558  normal  0.0497188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2015  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 118 aa  163  8e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000132248  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2046  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 118 aa  163  8e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000387614  hitchhiker  0.00333012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2260  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 119 aa  163  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000555159  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2488  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000082554  hitchhiker  0.0000796215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2025  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 119 aa  162  1.0000000000000001e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.240457  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02082  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 117 aa  161  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0832  50S ribosomal protein L20  73.11 
 
 		 121 aa  162  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0909072  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003713  LSU ribosomal protein L20p  68.38 
 
 		 117 aa  161  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000104464  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0939  50S ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 117 aa  161  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000748381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0219  ribosomal protein L20  68.38 
 
 		 118 aa  160  5.0000000000000005e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1007  50S ribosomal protein L20  72.27 
 
 		 121 aa  160  8.000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1412  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00164339  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1475  50S ribosomal protein L20  64.96 
 
 		 119 aa  159  1e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000544649  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2496  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 118 aa  158  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00192283  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20450  50S ribosomal protein L20  69.49 
 
 		 118 aa  157  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.834025  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1453  ribosomal protein L20  70.64 
 
 		 119 aa  155  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111816  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2507  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2381  ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.153219  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2165  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000386102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1934  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000268188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0765  50S ribosomal protein L20P  63.87 
 
 		 119 aa  155  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.9715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28680  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000531022 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1979  50S ribosomal protein L20  68.64 
 
 		 118 aa  155  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0347964  normal  0.0774628 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2611  50S ribosomal protein L20  65.55 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0328909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2240  50S ribosomal protein L20  65.55 
 
 		 119 aa  154  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00478573  hitchhiker  0.00537539 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0469  50S ribosomal protein L20  63.56 
 
 		 120 aa  154  3e-37  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.667366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2216  ribosomal protein L20  65.25 
 
 		 118 aa  154  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000311515  normal  0.131567 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2468  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 118 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0164678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3478  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 118 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0800064  hitchhiker  0.00881726 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3222  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 118 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.888026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1970  50S ribosomal protein L20  66.95 
 
 		 118 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0648376  hitchhiker  0.00701004 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1664  50S ribosomal protein L20  66.1 
 
 		 118 aa  152  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1802  50S ribosomal protein L20  67.83 
 
 		 117 aa  152  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0021941  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0696  50S ribosomal protein L20  68.81 
 
 		 115 aa  152  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129228  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1885  50S ribosomal protein L20  67.8 
 
 		 118 aa  152  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0110106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5320  50S ribosomal protein L20  62.18 
 
 		 125 aa  150  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5553  50S ribosomal protein L20  62.18 
 
 		 125 aa  150  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.129523  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1757  50S ribosomal protein L20  70.75 
 
 		 117 aa  150  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0134124  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2431  50S ribosomal protein L20  64.1 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.500057  normal  0.976562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0674  50S ribosomal protein L20  62.39 
 
 		 133 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2767  50S ribosomal protein L20  67.92 
 
 		 119 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2640  50S ribosomal protein L20  67.92 
 
 		 119 aa  149  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0129  50S ribosomal protein L20P  63.25 
 
 		 118 aa  149  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.049531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0366  50S ribosomal protein L20P  59.83 
 
 		 117 aa  148  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000702723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0215  50S ribosomal protein L20  63.87 
 
 		 119 aa  148  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.901812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1608  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 121 aa  147  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.248279  normal  0.0149786 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1628  50S ribosomal protein L20  60.68 
 
 		 121 aa  147  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0736554  hitchhiker  0.00508977 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0134  50S ribosomal protein L20  62.71 
 
 		 124 aa  147  6e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>