More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0916 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0916  hypothetical protein  100 
 
 		 219 aa  433  1e-121  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.964327  normal  0.840597 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.07 
 
 		 449 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  34.22 
 
 		 401 aa  98.2  8e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  45.58 
 
 		 213 aa  98.2  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  34.22 
 
 		 401 aa  98.2  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 		 389 aa  97.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3134  pentapeptide repeat protein  36.32 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  35.83 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  38.62 
 
 		 286 aa  95.5  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  39.22 
 
 		 1033 aa  95.1  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4189  pentapeptide repeat-containing protein  34.1 
 
 		 222 aa  95.1  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898811 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1334  pentapeptide repeat protein  36.87 
 
 		 190 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.877693 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2985  pentapeptide repeat protein  35.6 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2608  pentapeptide repeat-containing protein  42.07 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  35.06 
 
 		 401 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  35.06 
 
 		 401 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  45.07 
 
 		 216 aa  92.4  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  40.52 
 
 		 225 aa  91.7  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0401  pentapeptide repeat-containing protein  35.56 
 
 		 241 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.573387  normal  0.48358 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3522  pentapeptide repeat-containing protein  39.05 
 
 		 168 aa  91.3  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.894088  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  43.59 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  34.54 
 
 		 245 aa  89  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  38 
 
 		 332 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  42.59 
 
 		 277 aa  87.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  40.76 
 
 		 309 aa  86.7  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  36.53 
 
 		 381 aa  87  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  33.99 
 
 		 521 aa  87  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  38.89 
 
 		 320 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0554  pentapeptide repeat protein  43.97 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  38.31 
 
 		 263 aa  85.9  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  32.07 
 
 		 225 aa  85.1  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  36.08 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  39.16 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3446  pentapeptide repeat protein  37.14 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  39.16 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  41.67 
 
 		 456 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2635  hypothetical protein  35.07 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.224677  normal  0.134206 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  34.83 
 
 		 309 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3557  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 175 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.951665  normal  0.239792 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  36.42 
 
 		 517 aa  83.6  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  39.16 
 
 		 447 aa  82.8  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  36.77 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  36.08 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  36.81 
 
 		 727 aa  82.4  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  34.97 
 
 		 333 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  36.08 
 
 		 336 aa  82.4  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  35.86 
 
 		 576 aa  81.6  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5310  pentapeptide repeat protein  36.36 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0316  pentapeptide repeat-containing protein  39.53 
 
 		 384 aa  82  0.000000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2404  pentapeptide repeat-containing protein  35 
 
 		 254 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0475  pentapeptide repeat-containing protein  34.83 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.019443 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  36.65 
 
 		 489 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  36.93 
 
 		 250 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  32.11 
 
 		 493 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  32.66 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  38.41 
 
 		 419 aa  80.5  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  33.73 
 
 		 734 aa  80.5  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  33.68 
 
 		 567 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3776  pentapeptide repeat-containing protein  37.86 
 
 		 255 aa  80.1  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.109684 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3090  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4849  pentapeptide repeat-containing protein  38.79 
 
 		 973 aa  79.7  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.692365  normal  0.0232391 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  31.78 
 
 		 440 aa  79.7  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  41.84 
 
 		 452 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  38.32 
 
 		 862 aa  79.7  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  38.19 
 
 		 386 aa  79.3  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3130  pentapeptide repeat-containing protein  36.84 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.352835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  34.57 
 
 		 294 aa  79  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  33.89 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  42.02 
 
 		 446 aa  79  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  34.97 
 
 		 776 aa  79  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2673  pentapeptide repeat-containing protein  36.36 
 
 		 219 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0020  TPR repeat-containing protein  41.6 
 
 		 256 aa  78.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  39.56 
 
 		 392 aa  78.6  0.00000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2272  pentapeptide repeat-containing protein  33.68 
 
 		 681 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  37.17 
 
 		 311 aa  78.2  0.00000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1956  pentapeptide repeat-containing protein  34.97 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.342311  normal  0.646224 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  34.86 
 
 		 219 aa  77.8  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  38.07 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3095  pentapeptide repeat protein  36.84 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  38.19 
 
 		 441 aa  77.4  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4286  pentapeptide repeat-containing protein  38.1 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0433008 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1544  RDD domain-containing protein  32.32 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0809  pentapeptide repeat protein  43.27 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.294568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1950  pentapeptide repeat protein  39.07 
 
 		 199 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0246  pentapeptide repeat protein  34.36 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.858337  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4194  pentapeptide repeat protein  32.79 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.562882 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  34.73 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1987  pentapeptide repeat-containing protein  46.46 
 
 		 146 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  34.21 
 
 		 448 aa  77  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  34.73 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0290  pentapeptide repeat-containing protein  34.48 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.560216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1977  pentapeptide repeat protein  39.07 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0435241 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  39.73 
 
 		 745 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1082  pentapeptide protein  39.02 
 
 		 614 aa  76.6  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0577925 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3418  pentapeptide repeat-containing protein  35.95 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.391418  normal  0.142714 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  39.49 
 
 		 184 aa  76.3  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  40.48 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0246  pentapeptide repeat protein  36.81 
 
 		 260 aa  75.9  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.161553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2891  effector protein pipB2  33.52 
 
 		 350 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>