More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0712 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0712  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  100 
 
 
250 aa  509  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0154333 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3719  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  52.05 
 
 
247 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.561641  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1048  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 
254 aa  228  8e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1572  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50.68 
 
 
266 aa  223  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.36409 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0911  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  53.42 
 
 
253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3519  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.65 
 
 
253 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0877  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.2 
 
 
249 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0394331  normal  0.0815705 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1021  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.2 
 
 
249 aa  192  3e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00477503  normal  0.0346927 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4623  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.22 
 
 
240 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.89868  hitchhiker  0.000034158 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3312  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.74 
 
 
238 aa  186  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.33 
 
 
238 aa  185  6e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2407  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.33 
 
 
238 aa  185  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.18242  normal  0.658816 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03475  biopolymer transport ExbB protein  41.95 
 
 
253 aa  182  3e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2278  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.59 
 
 
243 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.314419  normal  0.0287229 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3382  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.83 
 
 
238 aa  181  7e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000129068 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3075  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.84 
 
 
239 aa  180  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00179933  normal  0.181057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2590  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.32 
 
 
250 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000318132 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6110  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.08 
 
 
246 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2569  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.86 
 
 
242 aa  178  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0695018  hitchhiker  0.0010528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2236  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.8 
 
 
242 aa  178  9e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.787404  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0010  biopolymer transport ExbB protein  39.66 
 
 
254 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1115  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.93 
 
 
247 aa  177  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.955363  normal  0.19888 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0010  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.66 
 
 
254 aa  176  3e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.686858  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1946  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 
243 aa  176  4e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0814  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.79 
 
 
265 aa  174  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1806  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.6 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.388089  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3141  biopolymer transport transmembrane protein, MotA/TolQ/ExbB like  42.86 
 
 
242 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.346915  normal  0.0492826 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1802  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.05 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0799  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.05 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1408  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.5 
 
 
243 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.108659 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0009  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.51 
 
 
253 aa  173  2.9999999999999996e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00486785 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2063  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.05 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.692674  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.05 
 
 
242 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0618  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.05 
 
 
242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.948348  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0521  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  43.05 
 
 
242 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.154816  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.44 
 
 
236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.39 
 
 
230 aa  172  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0862  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.06 
 
 
240 aa  172  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.286551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4497  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.37 
 
 
242 aa  171  9e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1793  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 
242 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.418463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.22 
 
 
242 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.065084  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1077  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.92 
 
 
243 aa  169  3e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1931  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.86 
 
 
234 aa  167  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.908791  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.92 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3052  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.3 
 
 
238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.92 
 
 
243 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0573  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.5 
 
 
222 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.250468 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0547  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.5 
 
 
222 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.232514  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1755  biopolymer transport ExbB protein  39.73 
 
 
307 aa  166  4e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.449833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5528  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.34 
 
 
243 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0652  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.5 
 
 
222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0169  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.5 
 
 
222 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.5 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2224  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.5 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.59 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.219229 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0382  putative MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.55 
 
 
309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0926632 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0619  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.5 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.701482  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2734  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.05 
 
 
222 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5878  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.5 
 
 
244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1716  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
303 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1731  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
301 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471993  normal  0.437872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1441  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.84 
 
 
301 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1053  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.28 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6362  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.5 
 
 
303 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.413769  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.79 
 
 
244 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0220  putative transport-related membrane protein  45.28 
 
 
221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1964  biopolymer transport transmembrane protein  42.34 
 
 
243 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368694  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2025  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  42.01 
 
 
233 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.371376  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4695  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.37 
 
 
303 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5007  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.39 
 
 
304 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.119067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2999  biopolymer transport transmembrane protein, ExbB/TolQ  39.81 
 
 
301 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1120  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.12 
 
 
286 aa  159  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3921  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.94 
 
 
219 aa  158  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3269  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.94 
 
 
222 aa  158  8e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0574  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40 
 
 
237 aa  157  1e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0890694  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.99 
 
 
311 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.983112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0270  biopolymer transport protein ExbB, putative  40.95 
 
 
235 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0688  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.79 
 
 
307 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1938  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.93 
 
 
263 aa  156  3e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.251082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0136  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.95 
 
 
235 aa  156  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4355  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.58 
 
 
262 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3738  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.55 
 
 
234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.966259 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21820  ExbB proton channel  41.58 
 
 
236 aa  154  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.6 
 
 
301 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.876301  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4552  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.92 
 
 
222 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1231  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.05 
 
 
235 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1148  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.27 
 
 
246 aa  153  2e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2455  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.05 
 
 
235 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0372  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.05 
 
 
235 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3454  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.05 
 
 
235 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2642  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.05 
 
 
235 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3452  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.05 
 
 
235 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.203481  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08070  ExbB proton channel  41.58 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21700  ExbB proton channel  41.58 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.798679  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2476  bipolymer transport protein MotA/TolQ/ExbB family  42.34 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.127088  normal  0.824305 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  41.18 
 
 
235 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.484595  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3417  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.59 
 
 
235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0669  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  44.9 
 
 
218 aa  151  8.999999999999999e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.62 
 
 
238 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  42.64 
 
 
239 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>