More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0674 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 394 aa  751    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  43.05 
 
 		 407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  41.93 
 
 		 409 aa  260  4e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  37.56 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 429 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  41.19 
 
 		 408 aa  239  8e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2807  major facilitator superfamily MFS_1  42.47 
 
 		 414 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0095  major facilitator superfamily MFS_1  28.34 
 
 		 395 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2658  major facilitator superfamily protein  30.03 
 
 		 409 aa  99.8  7e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.605129  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2123  GlpT transporter; quinolone resistence NorA protein  22.61 
 
 		 381 aa  99.8  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2873  major facilitator transporter  26.56 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.896526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0881  major facilitator family transporter  24.79 
 
 		 400 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19471e-35 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3398  general substrate transporter  31 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0177815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2365  major facilitator family transporter  22.32 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2313  major facilitator family transporter  23.14 
 
 		 381 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2186  major facilitator family transporter  22.32 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0494381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0684  quinolone resistence protein  24.93 
 
 		 506 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00565548  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2346  major facilitator family transporter  22.32 
 
 		 381 aa  97.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0787  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 399 aa  96.7  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000257301  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2372  major facilitator family transporter  22.35 
 
 		 381 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0128612  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0950  major facilitator family transporter  24.22 
 
 		 400 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000143189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2448  major facilitator family transporter  22.71 
 
 		 381 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0753672  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0841  major facilitator family transporter  24.57 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00299381  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0879  major facilitator family transporter  24.22 
 
 		 400 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000268355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2155  major facilitator transporter  22.92 
 
 		 384 aa  95.5  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.490773  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0697  quinolone resistence protein NorA  24.5 
 
 		 506 aa  95.5  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000944811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2109  GlpT transporter; quinolone resistence protein  22.61 
 
 		 381 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.273955  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0749  major facilitator family transporter  25.07 
 
 		 505 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000682732  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0698  major facilitator transporter  24.22 
 
 		 447 aa  94.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4495  major facilitator family transporter  24.29 
 
 		 400 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000363259  decreased coverage  0.0000000000000205787 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 383 aa  94  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4635  major facilitator superfamily MFS_1  27.18 
 
 		 410 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.720897 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0650  major facilitator transporter  24.72 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0139547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3012  major facilitator family transporter  23.14 
 
 		 399 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.372037 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1902  major facilitator superfamily MFS_1  25.65 
 
 		 404 aa  90.9  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2117  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 391 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000191868  normal  0.363164 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0801  putative multidrug resistance protein  25.51 
 
 		 390 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000590572  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0894  major facilitator superfamily MFS_1  24.86 
 
 		 403 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  25.22 
 
 		 384 aa  89.4  9e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  25.7 
 
 		 384 aa  89.7  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  25.62 
 
 		 384 aa  89  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0741  multidrug resistance protein, putative  25.43 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0188639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0584  multidrug ABC transporter  24.93 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0583  multidrug ABC transporter  24.93 
 
 		 390 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  24.34 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0729  putative multidrug resistance protein  25.14 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.97646e-50 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15060  major facilitator superfamily MFS_1  22.96 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.139374  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  28.83 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2106  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 399 aa  86.7  6e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00044461  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0640  multidrug resistance protein  25.14 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0674  multidrug resistance protein  25.14 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00116506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3013  major facilitator transporter  28.34 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0363665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.8 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1430  major facilitator transporter  27.95 
 
 		 410 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  26.54 
 
 		 438 aa  84  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3086  quinolone resistence protein NorA  27.49 
 
 		 399 aa  82.8  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.388424  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1951  major facilitator superfamily transporter  28.37 
 
 		 440 aa  82.8  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3100  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.085117  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2997  quinolone resistence protein  27.49 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116888  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  25 
 
 		 386 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3345  major facilitator family transporter  27.49 
 
 		 399 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3305  major facilitator family transporter  26.98 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3309  major facilitator family transporter  28.07 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3322  major facilitator family transporter  27.05 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1927  major facilitator family transporter  26.98 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.644574 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3315  major facilitator family transporter  27.54 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  25.94 
 
 		 434 aa  80.9  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15980  arabinose efflux permease family protein  25.07 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000235485 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  24.65 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  28.89 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  29.94 
 
 		 401 aa  79  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4171  major facilitator superfamily MFS_1  24.79 
 
 		 415 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1093  major facilitator superfamily MFS_1  26.61 
 
 		 406 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0159699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  27.25 
 
 		 435 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4405  major facilitator transporter  28.22 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.9798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  26.98 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  24.13 
 
 		 405 aa  77.8  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1408  major facilitator superfamily MFS_1  26.39 
 
 		 401 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1982  major facilitator superfamily MFS_1  28.53 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.130406  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1577  major facilitator transporter  24.42 
 
 		 383 aa  77.4  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0471047  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3166  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5204  major facilitator transporter  31.01 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.675914 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2764  major facilitator superfamily MFS_1  28.11 
 
 		 389 aa  76.3  0.0000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0806  major facilitator transporter  24.49 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.674294 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3789  major facilitator superfamily MFS_1  23.98 
 
 		 396 aa  76.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.206252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  26.7 
 
 		 416 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1853  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000358317  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  24.31 
 
 		 396 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2493  major facilitator transporter  27.86 
 
 		 420 aa  74.7  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.995351  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2528  major facilitator superfamily MFS_1  26.89 
 
 		 417 aa  73.2  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.387633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0879  major facilitator superfamily MFS_1  22.99 
 
 		 395 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0954  MFS family transporter  25.66 
 
 		 414 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.456329  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2389  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 396 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  25.69 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2181  putative antibiotic transporter  24.48 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3626  major facilitator superfamily MFS_1  26.33 
 
 		 414 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6746  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3129  major facilitator superfamily MFS_1  27.64 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0861  major facilitator superfamily MFS_1  28.44 
 
 		 404 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.152258  normal  0.126341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>