More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0574 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  151  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  73.33 
 
 		 75 aa  124  5e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  75.34 
 
 		 76 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  69.33 
 
 		 75 aa  115  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  73.97 
 
 		 76 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  66.67 
 
 		 75 aa  114  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2187  SirA family protein  76.06 
 
 		 76 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0108315  hitchhiker  0.000000214154 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2557  hypothetical protein  76.06 
 
 		 76 aa  113  6.9999999999999995e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  decreased coverage  0.00791893  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  68 
 
 		 75 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  68 
 
 		 75 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  66.67 
 
 		 75 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2791  SirA family protein  64.47 
 
 		 76 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.281845  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1672  SirA family protein  68 
 
 		 76 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1881  SirA family protein  64 
 
 		 75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.045708 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4578  SirA-like protein  64 
 
 		 75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.408362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1412  SirA family protein  64 
 
 		 75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.960057 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0952  SirA-like  64 
 
 		 75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1434  SirA family protein  64 
 
 		 75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3088  SirA-like  64 
 
 		 75 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1353  SirA family protein  64 
 
 		 75 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.563442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1314  SirA family protein  64 
 
 		 75 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1134  hypothetical protein  61.33 
 
 		 75 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450728 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  62.67 
 
 		 75 aa  107  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2801  SirA family protein  62.67 
 
 		 77 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.205489 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3724  SirA-like  62.67 
 
 		 75 aa  106  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.893626 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1333  hypothetical protein  64 
 
 		 77 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3170  SirA family protein  61.33 
 
 		 77 aa  106  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.206236 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0429  hypothetical protein  64.47 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0594568  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1453  hypothetical protein  64.47 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0920  hypothetical protein  64.47 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1839  hypothetical protein  64.47 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2640  hypothetical protein  64.47 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0863392  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0734  hypothetical protein  64.47 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1684  hypothetical protein  64.47 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.109756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1662  hypothetical protein  64.47 
 
 		 76 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0398143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1298  SirA family protein  58.67 
 
 		 75 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2214  SirA family protein  60 
 
 		 75 aa  104  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2377  SirA-like  58.67 
 
 		 75 aa  103  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0972982  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2384  SirA family protein  57.33 
 
 		 75 aa  102  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.21335  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  60.76 
 
 		 82 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1593  SirA family protein  60.53 
 
 		 78 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.433427  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2898  SirA family protein  57.33 
 
 		 75 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1028  SirA family protein  56 
 
 		 75 aa  100  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.399081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  59.72 
 
 		 76 aa  97.1  7e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  60.27 
 
 		 81 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  55.56 
 
 		 77 aa  96.3  1e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  60.27 
 
 		 81 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  58.57 
 
 		 78 aa  95.5  2e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  60 
 
 		 77 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3614  SirA family protein  55.26 
 
 		 76 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000103575 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0125  SirA family protein  55.71 
 
 		 78 aa  90.9  5e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2324  SirA family protein  55.71 
 
 		 77 aa  90.5  6e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0434291  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  57.14 
 
 		 78 aa  90.1  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  53.52 
 
 		 76 aa  90.1  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3746  SirA family protein  54.93 
 
 		 74 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00371656  unclonable  0.000000591857 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1959  redox protein regulator of disulfide bond formation-like  54.29 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000373287  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0026  SirA family protein  52.86 
 
 		 78 aa  87.8  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000175689  normal  0.0503522 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  50 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  46.58 
 
 		 201 aa  84  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0330  SirA family protein  43.24 
 
 		 80 aa  84  7e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  43.66 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51310  hypothetical protein  51.39 
 
 		 83 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000169267 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1233  SirA family protein  47.3 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3957  hypothetical protein  50.7 
 
 		 83 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3979  SirA family protein  49.3 
 
 		 79 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4185  SirA family protein  47.3 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1263  SirA family protein  47.3 
 
 		 79 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.600838  normal  0.692978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35370  SirA-like protein  50.7 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  45.95 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1544  SirA-like  49.3 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.409096  normal  0.0539174 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  43.84 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  43.24 
 
 		 75 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1367  SirA-like  48.61 
 
 		 79 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.463137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  44.59 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2088  hypothetical protein  47.22 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0107447  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4391  hypothetical protein  48.61 
 
 		 83 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  43.24 
 
 		 76 aa  76.6  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2618  SirA-like protein  46.58 
 
 		 80 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  43.24 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2132  hypothetical protein  41.89 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00495785  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0807  SirA family protein  41.89 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.720013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  43.24 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  43.24 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  41.89 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  41.89 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  41.89 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  41.89 
 
 		 76 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  41.89 
 
 		 75 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3777  SirA family protein  57.63 
 
 		 60 aa  73.6  0.0000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2575  molybdopterin cofactor biosynthesis MoaC region  43.66 
 
 		 85 aa  73.6  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1659  SirA family protein  48.61 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.995311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  43.66 
 
 		 83 aa  72  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  40.54 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  39.19 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  39.19 
 
 		 80 aa  71.2  0.000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  41.89 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0717  SirA family protein  39.19 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.178055  normal  0.908547 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  37.84 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0090  SirA family protein  40.58 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0719339  normal  0.137098 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1905  sulfur transfer protein SirA  37.33 
 
 		 83 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00381161  normal  0.533797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>