More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0539 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0539  antiporter-2, CPA2 family monovalent cation/proton antiporter  100 
 
 
658 aa  1285  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  53.4 
 
 
659 aa  660  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0296  sodium/hydrogen exchanger  56.15 
 
 
659 aa  646  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0414  putative glutathione-regulated potassium-efflux system K+/H+ antiporter transmembrane protein  55.99 
 
 
659 aa  644  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0507155 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  53.85 
 
 
674 aa  654  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3417  potassium efflux system protein  52.6 
 
 
652 aa  630  1e-179  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00166015  normal  0.19535 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  52.74 
 
 
667 aa  627  1e-178  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0492  potassium efflux system protein  54.91 
 
 
663 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.491444  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6115  Sodium/hydrogen exchanger  53.05 
 
 
668 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.763943 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0269  sodium/hydrogen exchanger  55.84 
 
 
659 aa  628  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  53.34 
 
 
666 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2171  sodium/hydrogen exchanger  52.48 
 
 
668 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  52.74 
 
 
667 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2796  sodium/hydrogen exchanger  52.48 
 
 
668 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0879164 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2785  sodium/hydrogen exchanger  52.48 
 
 
668 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0657605  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0530  sodium/hydrogen exchanger  52.2 
 
 
678 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.191923  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0587  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  54.32 
 
 
669 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3101  potassium efflux system protein  54.32 
 
 
669 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1520  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  54.32 
 
 
669 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.418182  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0771  potassium efflux system protein  54.35 
 
 
663 aa  618  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  52.94 
 
 
661 aa  617  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2948  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  54.32 
 
 
669 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.248455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0603  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  54.32 
 
 
669 aa  615  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0070  monovalent cation:proton antiporter-2 (CPA2) family protein  54.32 
 
 
669 aa  615  1e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2845  sodium/hydrogen exchanger  52.48 
 
 
670 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0613147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2703  sodium/hydrogen exchanger  52.33 
 
 
670 aa  608  1e-172  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4238  sodium/hydrogen exchanger  51.66 
 
 
656 aa  601  1e-170  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1611  sodium/hydrogen exchanger  50.76 
 
 
660 aa  600  1e-170  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0181  sodium/hydrogen exchanger  53.56 
 
 
665 aa  592  1e-168  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3810  sodium/hydrogen exchanger family protein  53.81 
 
 
680 aa  589  1e-167  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.162531 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1906  potassium efflux system protein  50.23 
 
 
660 aa  585  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1968  potassium-efflux system protein  52.89 
 
 
661 aa  583  1e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4900  potassium efflux system protein  52.71 
 
 
664 aa  583  1e-165  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1636  sodium/hydrogen exchanger  52.89 
 
 
661 aa  583  1e-165  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35169e-07 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0880  sodium/hydrogen exchanger  52.68 
 
 
655 aa  573  1e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.19448  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0155  sodium/hydrogen exchanger  52.55 
 
 
661 aa  561  1e-158  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4109  sodium/hydrogen exchanger  52.7 
 
 
661 aa  559  1e-158  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.324646  normal  0.0690123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4786  potassium efflux system protein  51.98 
 
 
661 aa  533  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4133  potassium efflux system protein  50.77 
 
 
661 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.477795 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3491  potassium efflux system protein  51.08 
 
 
661 aa  506  1e-142  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  40.97 
 
 
662 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1760  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.83 
 
 
654 aa  471  1e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.303253  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1976  sodium/hydrogen exchanger  40 
 
 
666 aa  452  1e-126  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  40.62 
 
 
650 aa  445  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  40.4 
 
 
649 aa  441  1e-122  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2884  potassium efflux system protein  41.08 
 
 
648 aa  436  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.76121  normal  0.0157932 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  40.55 
 
 
649 aa  439  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  41.27 
 
 
648 aa  437  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1463  potassium efflux system protein  40.77 
 
 
648 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1468  potassium efflux system protein  40.92 
 
 
648 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1270  sodium/hydrogen exchanger  37.98 
 
 
657 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3143  potassium efflux system protein  40.46 
 
 
649 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0190825 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  40.54 
 
 
648 aa  428  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1499  potassium efflux system protein  40.92 
 
 
648 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01391  Kef-type K+ transport system, membrane component  37.37 
 
 
720 aa  417  1e-115  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2614  potassium efflux system protein  40.31 
 
 
649 aa  419  1e-115  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1593  putative glutathione-regulated potassium-efflux system protein  39.63 
 
 
655 aa  416  1e-115  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2623  potassium efflux system protein  40.06 
 
 
648 aa  418  1e-115  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00669117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2690  potassium efflux system protein  40.06 
 
 
648 aa  418  1e-115  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  4.90638e-05 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3263  sodium/hydrogen exchanger  40.33 
 
 
653 aa  414  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.538739 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1159  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  40.73 
 
 
648 aa  414  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  37.72 
 
 
654 aa  401  1e-110  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3967  Sodium/hydrogen exchanger  45.69 
 
 
570 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2952  Sodium/hydrogen exchanger, TrkA-N  38.45 
 
 
568 aa  338  2e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.38 
 
 
697 aa  338  2e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  35.01 
 
 
666 aa  336  7e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.14201e-07 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  35.52 
 
 
665 aa  327  3e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  35.23 
 
 
672 aa  327  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  33.84 
 
 
658 aa  320  4e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.81991e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  34.12 
 
 
775 aa  320  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  7.97462e-07 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  33.69 
 
 
762 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  31.56 
 
 
665 aa  316  1e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  32.87 
 
 
674 aa  314  3e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3734  sodium/hydrogen exchanger  38.29 
 
 
591 aa  313  6e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.319534 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2194  potassium efflux system protein  39.54 
 
 
574 aa  313  7e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  33.43 
 
 
773 aa  312  1e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  34.1 
 
 
666 aa  309  1e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1249  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.45 
 
 
572 aa  306  1e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  34.19 
 
 
666 aa  306  1e-81  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1735  sodium/hydrogen exchanger  37.76 
 
 
593 aa  305  2e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1380  sodium/hydrogen exchanger  32.63 
 
 
540 aa  303  6e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.034971  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.84 
 
 
670 aa  302  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.5266e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1457  K+ efflux antiporter, putative (KEA1)  36.07 
 
 
583 aa  302  1e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0395  potassium efflux system protein  40.18 
 
 
577 aa  301  3e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  33.18 
 
 
771 aa  300  8e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4369  sodium/hydrogen exchanger  38.36 
 
 
592 aa  299  9e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  37.41 
 
 
577 aa  299  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1519  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.78 
 
 
579 aa  299  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.49267  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 
741 aa  299  1e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2429  glutathione-regulated potassium-efflux system protein, kefB  36.06 
 
 
642 aa  298  3e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.760759  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1092  sodium/hydrogen exchanger  36.06 
 
 
642 aa  298  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.163516  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0802  sodium/hydrogen exchanger  37.78 
 
 
583 aa  297  4e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.943195  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  32.64 
 
 
682 aa  297  5e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  33.8 
 
 
652 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4668  sodium/hydrogen exchanger  37.72 
 
 
594 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0852287  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0872  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC  38.56 
 
 
635 aa  295  2e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.37465  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3407  potassium efflux system protein  35.5 
 
 
624 aa  295  2e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229701  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  33.59 
 
 
664 aa  294  3e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 
665 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  31.95 
 
 
665 aa  293  5e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>