More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0534 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  100 
 
 
240 aa  487  1e-137  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  70.29 
 
 
268 aa  353  2e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  68.75 
 
 
240 aa  349  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  69.58 
 
 
244 aa  346  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0409  ABC transporter ATP-binding protein  68.03 
 
 
262 aa  336  2e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0648772 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0264  ABC transporter related  68.03 
 
 
262 aa  336  2e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  68.03 
 
 
262 aa  336  2e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0356  ABC transporter related  68.44 
 
 
266 aa  333  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0304  ABC transporter-related protein  68.03 
 
 
263 aa  332  3e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2176  ABC transporter related  66.53 
 
 
258 aa  328  5e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0597  ABC transporter related  66.53 
 
 
261 aa  327  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0435549 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3709  ABC transporter related  64.49 
 
 
265 aa  327  1e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.320955  normal  0.158224 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  66.12 
 
 
258 aa  326  2e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  66.12 
 
 
258 aa  326  2e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6120  ABC transporter, ATPase subunit  66.12 
 
 
258 aa  326  2e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.668552  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0327  ABC transporter related  66.12 
 
 
260 aa  325  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.945249  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0709  ABC transporter related  69.58 
 
 
240 aa  325  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0487  ABC transporter, ATP-binding protein  66.12 
 
 
258 aa  325  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.635199  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4486  ABC transporter related  64.49 
 
 
268 aa  325  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.152694 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4121  ABC transporter, ATPase subunit  66.12 
 
 
261 aa  325  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0465  ABC transporter related  63.05 
 
 
264 aa  325  4e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.15337  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0525  ABC transporter related  66.12 
 
 
258 aa  325  4e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0766  ABC transporter system, ATP-binding protein  66.12 
 
 
258 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.857207  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0075  ABC transporter, ATP-binding protein  66.12 
 
 
258 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1515  ABC transporter, ATP-binding protein  66.12 
 
 
258 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2943  ABC transporter, ATP-binding protein  66.12 
 
 
258 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0598  ABC transporter, ATP-binding protein  66.12 
 
 
258 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3107  ABC transporter, ATP-binding protein  66.12 
 
 
258 aa  325  5e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0582  ABC transporter, ATP-binding protein  66.12 
 
 
258 aa  325  5e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  65.71 
 
 
258 aa  323  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  65.7 
 
 
255 aa  323  1e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  65.57 
 
 
255 aa  323  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  65.71 
 
 
258 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0148157 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4226  ABC transporter-related protein  64.9 
 
 
268 aa  321  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219808 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0149  putative ATP-binding ABC transporter protein  64.49 
 
 
251 aa  318  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0418  ABC transporter-related protein  63.87 
 
 
263 aa  314  8e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.757416  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0577  ABC transporter related  61.63 
 
 
256 aa  312  3e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0673  ABC transporter related  62.04 
 
 
262 aa  312  3e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.125229  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0777  ABC transporter related  62.45 
 
 
264 aa  311  5e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2500  ABC transporter related  64.26 
 
 
289 aa  311  6e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0376779  normal  0.330779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2723  ABC transporter related  64.26 
 
 
290 aa  311  6e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.569692  normal  0.148561 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5470  ABC transporter related  63.71 
 
 
283 aa  310  1e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279643  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3668  ABC transporter related  64.53 
 
 
261 aa  309  3e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2428  ABC transporter related  63.83 
 
 
289 aa  309  3e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.047746  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  61.83 
 
 
241 aa  308  6e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  57.26 
 
 
241 aa  306  2e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0158  ABC transporter related  62.03 
 
 
321 aa  305  3e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.44909 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  57.26 
 
 
241 aa  303  1e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  60.58 
 
 
241 aa  303  2e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1145  ABC transporter related  61.18 
 
 
282 aa  302  3e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0734842  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  57.26 
 
 
241 aa  302  3e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  59.41 
 
 
244 aa  301  8e-81  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0169  ABC transporter related  62.13 
 
 
279 aa  300  1e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0122  putative ABC transporter ATP-binding protein  60.34 
 
 
336 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.069577  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0157  ABC transporter, ATP-binding protein  62.39 
 
 
277 aa  299  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0152  ABC transporter, ATP-binding protein  62.39 
 
 
254 aa  299  3e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0336404  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  59.92 
 
 
333 aa  298  3e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2792  ABC transporter, ATPase subunit  58.92 
 
 
241 aa  298  4e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.26307  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  60 
 
 
247 aa  298  4e-80  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  59.92 
 
 
332 aa  298  4e-80  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0050  ABC transporter related  59.83 
 
 
316 aa  298  5e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.161692  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2183  ABC transporter related  62.45 
 
 
282 aa  298  6e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0392022  normal  0.686559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  60.25 
 
 
310 aa  298  6e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  59.34 
 
 
241 aa  298  7e-80  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  59.34 
 
 
241 aa  298  7e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  58.44 
 
 
243 aa  297  9e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  60.17 
 
 
241 aa  297  9e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0047  ABC transporter related  62.39 
 
 
258 aa  297  9e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.132774 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0063  ABC transporter related  62.39 
 
 
258 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  59.83 
 
 
246 aa  296  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  58.65 
 
 
239 aa  296  2e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  57.26 
 
 
241 aa  295  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  60.17 
 
 
242 aa  295  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  57.74 
 
 
250 aa  295  5e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  59 
 
 
244 aa  294  9e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  57.26 
 
 
241 aa  293  1e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  58.58 
 
 
244 aa  293  1e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  56.43 
 
 
249 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0416  ABC transporter related  59.07 
 
 
317 aa  293  2e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  58.75 
 
 
244 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  58.16 
 
 
244 aa  293  2e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  56.43 
 
 
249 aa  293  2e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0347  ABC transporter related  60.89 
 
 
255 aa  292  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  57.68 
 
 
241 aa  292  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2272  ABC transporter related  57.81 
 
 
244 aa  292  4e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.638981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0336  ABC transporter related  60.89 
 
 
250 aa  292  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.18468  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.68 
 
 
241 aa  291  8e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0499  ABC transport protein, ATP-binding component  55.19 
 
 
241 aa  291  8e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2225  ABC transporter related  56.85 
 
 
259 aa  290  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0656  ABC transporter related  59.07 
 
 
314 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.30871 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  57.32 
 
 
277 aa  290  2e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2817  ABC transporter related  58.58 
 
 
253 aa  289  2e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5034  ABC transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 
241 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0268647  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1156  ABC transporter, ATPase subunit  58.58 
 
 
253 aa  289  2e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4262  ABC transporter related  57.68 
 
 
241 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0177  ABC transporter related  58.65 
 
 
317 aa  288  4e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.32716  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1368  ABC transporter, ATP-binding protein  58.23 
 
 
264 aa  288  4e-77  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.569741  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  58.65 
 
 
246 aa  288  5e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  1.82009e-07 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2906  ABC transporter related  59.07 
 
 
258 aa  288  6e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.20972  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  55.19 
 
 
241 aa  288  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>