67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0521 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0521  hypothetical protein  100 
 
 
66 aa  120  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.557857  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0085  hypothetical protein  53.23 
 
 
69 aa  62  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6325  hypothetical protein  46.88 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.999223  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2996  hypothetical protein  46.88 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2976  hypothetical protein  46.88 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2362  hypothetical protein  46.88 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.21694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0295  hypothetical protein  49.21 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.382928  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2317  hypothetical protein  50 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00433359  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2971  hypothetical protein  46.88 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2776  hypothetical protein  46.97 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.331238  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2896  hypothetical protein  50 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0750135 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3023  hypothetical protein  43.75 
 
 
70 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2886  hypothetical protein  43.75 
 
 
64 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2035  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938809  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3734  hypothetical protein  45.31 
 
 
64 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0151275  normal  0.610922 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3058  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0202  hypothetical protein  46.88 
 
 
64 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0331  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0524  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.523411  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0344  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166493  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2249  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3385  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000135899  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0223  hypothetical protein  46.97 
 
 
64 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0105  hypothetical protein  46.15 
 
 
63 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000261109 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06061  hypothetical protein  46.67 
 
 
67 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.693871 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0547  hypothetical protein  47.92 
 
 
69 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.353499  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1176  hypothetical protein  50 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0928  hypothetical protein  42.19 
 
 
68 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0180  hypothetical protein  43.94 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.413822 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2520  hypothetical protein  42.19 
 
 
68 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000165687  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0522  hypothetical protein  39.06 
 
 
64 aa  50.8  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4085  hypothetical protein  39.06 
 
 
64 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2294  hypothetical protein  46.97 
 
 
66 aa  50.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.132721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4136  hypothetical protein  44.62 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4499  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000118764 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3136  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000286621  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4553  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00126894  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4538  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000709815  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0697  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000971992  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4314  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0022719  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4152  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.120970000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4163  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000101716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4649  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000137782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4504  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000229476  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1175  hypothetical protein  47.73 
 
 
63 aa  47  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4266  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000396076  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0515  hypothetical protein  50.85 
 
 
64 aa  47  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0499  hypothetical protein  50.85 
 
 
64 aa  47  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.139972 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3739  hypothetical protein  46.94 
 
 
71 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0155  hypothetical protein  38.46 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000254633  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0753  hypothetical protein  51.11 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5384  hypothetical protein  54.05 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.406208  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3504  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1360  hypothetical protein  52.38 
 
 
74 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0218176  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1467  hypothetical protein  60 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0981  hypothetical protein  42.42 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1390  hypothetical protein  48.94 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0192663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1253  hypothetical protein  42.19 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2070  hypothetical protein  37.21 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4223  hypothetical protein  44.9 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.555481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0550  hypothetical protein  43.94 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3608  hypothetical protein  34.29 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0279579  normal  0.399105 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0889  hypothetical protein  51.22 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.93552e-23 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1609  hypothetical protein  44.44 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1455  hypothetical protein  43.18 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00399997  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1664  hypothetical protein  46.34 
 
 
74 aa  40.4  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.81028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1373  hypothetical protein  38.71 
 
 
73 aa  40  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>