More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0375 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0375  cell division ATP-binding protein FtsE  100 
 
 		 220 aa  438  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.249019  decreased coverage  0.00264654 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2739  ABC transporter related  65.28 
 
 		 217 aa  301  6.000000000000001e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.569673  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3717  cell division ATP-binding protein FtsE  62.67 
 
 		 217 aa  274  9e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.780877  normal  0.114133 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0732  cell division ATP-binding protein FtsE  62.5 
 
 		 218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3596  cell division ATP-binding protein FtsE  58.53 
 
 		 230 aa  259  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0240123  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2989  cell division ATP-binding protein FtsE  59.17 
 
 		 226 aa  258  6e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.300559  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0134  cell division ATP-binding protein FtsE  57.73 
 
 		 220 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3745  cell division ATP-binding protein FtsE  56.74 
 
 		 224 aa  249  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0202  cell division ATP-binding protein FtsE  57.21 
 
 		 231 aa  248  8e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000183823  decreased coverage  0.00000275574 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4585  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  55.81 
 
 		 233 aa  244  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3773  cell division ATP-binding protein FtsE  55.81 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000852689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3846  cell division ATP-binding protein FtsE  55.81 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3971  cell division ATP-binding protein FtsE  55.81 
 
 		 233 aa  243  9.999999999999999e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00007474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0220  cell division ATP-binding protein FtsE  56.28 
 
 		 230 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.123928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2988  cell division ATP-binding protein FtsE  56.74 
 
 		 222 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34764  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2660  cell division ATP-binding protein FtsE  57.14 
 
 		 224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8795  hitchhiker  0.0000942029 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3467  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  56.28 
 
 		 229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0169  cell division ATP-binding protein FtsE  56.28 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4163  cell division ATP-binding protein FtsE  55.35 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000108411  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4093  cell division ATP-binding protein FtsE  55.35 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000482041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3979  cell division ATP-binding protein FtsE  55.35 
 
 		 230 aa  242  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000304408  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4294  cell division ATP-binding protein FtsE  55.35 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.0000113777  normal  0.0247872 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0290  cell division ATP-binding protein FtsE  55.35 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000108191  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0172  cell division ATP-binding protein FtsE  55.35 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000000152449  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0215  cell division ATP-binding protein  52.53 
 
 		 217 aa  241  5e-63  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.354221  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2109  cell division ABC transporter, ATP-binding protein FtsE  52.53 
 
 		 217 aa  241  5e-63  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4327  cell division ATP-binding protein FtsE  54.67 
 
 		 223 aa  241  9e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3605  cell division ATP-binding protein FtsE  54.88 
 
 		 233 aa  240  2e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000127054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0222  cell division protein FtsE  53.42 
 
 		 223 aa  233  1.0000000000000001e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0345347 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0276  cell division ATP-binding protein FtsE  53.95 
 
 		 229 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000204562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3876  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  53.95 
 
 		 223 aa  233  2.0000000000000002e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3945  cell division ATP-binding protein FtsE  52.09 
 
 		 224 aa  232  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000529058  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4064  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  53.02 
 
 		 222 aa  231  7.000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2373  cell division ATP-binding protein FtsE  51.82 
 
 		 233 aa  230  1e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000033444  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3615  ABC transporter related  55.3 
 
 		 232 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135384  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3504  ABC transporter related  52.53 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000316102  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0100  cell division protein FtsE  52.56 
 
 		 223 aa  228  4e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.578603  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03536  FtsE  51.63 
 
 		 237 aa  228  5e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0487726  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0094  cell division protein FtsE  52.56 
 
 		 223 aa  228  6e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2902  cell division ATP-binding protein FtsE  50.68 
 
 		 222 aa  228  6e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0688524  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0240  cell division protein FtsE  52.29 
 
 		 222 aa  226  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.127861  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3978  cell division protein FtsE  52.29 
 
 		 222 aa  227  1e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590462  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0578  cell division protein FtsE  52.29 
 
 		 222 aa  226  1e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00281853  normal  0.74415 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03312  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  52.56 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0252  Type II (General) Secretory Pathway (IISP) Family protein  52.56 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3662  cell division protein FtsE  52.56 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3945  cell division protein FtsE  52.56 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3746  cell division protein FtsE  52.56 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0253  cell division protein FtsE  52.56 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03265  hypothetical protein  52.56 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4783  cell division protein FtsE  52.56 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3859  cell division protein FtsE  52.56 
 
 		 222 aa  226  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00279  ABC transporter ATPase subunit  51.38 
 
 		 235 aa  226  3e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0355  cell division ATP-binding protein FtsE  51.16 
 
 		 223 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002139  cell division transporter ATP-binding protein FtsE  51.38 
 
 		 224 aa  225  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0306098  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3867  cell division protein FtsE  52.56 
 
 		 221 aa  225  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.508824  normal  0.0993887 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04910  cell division ATP-binding protein FtsE  51.16 
 
 		 223 aa  224  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0953664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5110  cell division ATP-binding protein FtsE  51.16 
 
 		 225 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4750  ABC transporter  50.7 
 
 		 223 aa  223  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.199681  normal  0.0424479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4983  cell division ATP-binding protein FtsE  51.16 
 
 		 223 aa  223  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5160  cell division ATP-binding protein FtsE  51.16 
 
 		 223 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2723  hypothetical protein  53.24 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2596  hypothetical protein  53.24 
 
 		 216 aa  223  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1545  cell division ATP-binding protein FtsE  51.15 
 
 		 222 aa  223  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0469  cell division ATP-binding protein FtsE  51.16 
 
 		 223 aa  223  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.55028  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3762  cell division protein FtsE  52.09 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3941  cell division protein FtsE  52.09 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.923272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3882  cell division protein FtsE  52.09 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.166736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3839  cell division protein FtsE  52.09 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4174  cell division ATP-binding protein FtsE  51.63 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00105133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3772  cell division protein FtsE  52.09 
 
 		 222 aa  221  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48090  Cell-division ATP-binding protein FtsE  52.09 
 
 		 222 aa  221  6e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354842  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5336  cell division ATP-binding protein FtsE  51.16 
 
 		 223 aa  221  6e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0428  cell division ATP-binding protein FtsE  50.23 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2304  cell division ATP-binding protein FtsE  57.14 
 
 		 226 aa  220  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.820604  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0159  cell division ATP-binding protein FtsE  51.63 
 
 		 235 aa  218  6e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0624  cell division ATP-binding protein FtsE  48.37 
 
 		 222 aa  216  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0710  cell division ATP-binding protein FtsE  52.56 
 
 		 227 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.387605  normal  0.298527 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2996  Sigma 54 interacting domain protein  48.17 
 
 		 223 aa  211  5.999999999999999e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000178962 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2752  cell division ATP-binding protein FtsE  52.09 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2372  cell division ATP-binding protein FtsE  52.09 
 
 		 223 aa  210  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.125104  hitchhiker  0.000226971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1287  cell division ATP-binding protein FtsE  47.71 
 
 		 223 aa  209  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4742  cell division ATP-binding protein FtsE  48.61 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1554  cell division ATP-binding protein FtsE  49.3 
 
 		 216 aa  209  4e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.154084  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1856  cell division ATP-binding protein FtsE  48.85 
 
 		 223 aa  208  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.663349  normal  0.473161 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3673  cell division ATP-binding protein FtsE  49.31 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1775  cell division ATP-binding protein FtsE  47 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.030617  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0471  cell division ATP-binding protein FtsE  50.69 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03715  cell division ATP-binding protein FtsE  47.47 
 
 		 228 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3966  cell division ATP-binding protein FtsE  46.76 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000448693  unclonable  0.00000000011916 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3606  cell division ATP-binding protein FtsE  44.19 
 
 		 227 aa  197  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2412  cell division ATP-binding protein FtsE  47 
 
 		 230 aa  197  7.999999999999999e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.122374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1932  cell division ATP-binding protein FtsE  47 
 
 		 223 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3781  cell division ATP-binding protein FtsE  49.54 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25190  cell division ATP-binding protein FtsE  48.61 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.661516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1244  cell division ATP-binding protein FtsE  49.07 
 
 		 229 aa  193  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1046  cell division ATP-binding protein FtsE  44.19 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0412114  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2769  cell division ATP-binding protein FtsE  47.96 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.785262 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3073  cell division ATP-binding protein FtsE  45.83 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1923  cell division ATP-binding protein FtsE  47.03 
 
 		 229 aa  192  4e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000106993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>